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利用生物信息学方法鉴定宫颈癌新基因及相关药物
背景：宫颈癌是严重危害妇女健康的常见妇科肿瘤之一，准确探究其发生发展和临床预后的潜在机制尤为重要。材料/方法：在GEO数据库中，使用GEO2R对GSE6791、GSE9750、GSE63514、GSE67522四个数据库中的差异表达基因进行分析，然后使用DAVID网站进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。使用STRING网站对DEGS的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络进行可视化和分析，并使用Cytohubba插件进一步筛选枢纽基因。最后，通过基因表达谱交互分析（GEPIA）在线工具、人类蛋白质图谱（HPA）数据库和QuartataWeb数据库进一步分析枢纽基因的功能。结果：4个Profile数据集共收集了101例癌组织和67例正常组织，4个数据集中的78个差异表达基因中，51个基因上调，27个基因下调。使用Cytoscape和STRING工具对这些差异表达基因的PPI进行可视化。随后，利用GEPIA工具和Kaplan-Meier曲线进一步分析枢纽基因，结果显示CDK1和PRC1的调控与较好的生存相关，而AURKA的调控与较差的生存相关。在这些枢纽基因中，仅AURKA与宫颈癌的预后密切相关，并发现了21种潜在药物。结论：这些结果提示AURKA及其候选药物未来可以提高宫颈癌的个体化诊断和治疗。
ndc80复合物的见解
通过茎/接头区域控制微管相关蛋白的含力特性：来自NDC80复合体Ilya B. Kovalenko的见解俄罗斯莫斯科的莫斯科州立大学Lomonosov；中国深圳市MSU-BIT大学B深圳； C俄罗斯莫斯科物理学药理论理论问题中心。*应将通信发送至p.s.o和n.b.g（orekhov_p@smbu.edu.cn，ngudimch@gmail.com）在机械载荷下许多微管相关蛋白（MAPS）功能。在其中，运动蛋白和被动耦合器将微管与其他细胞骨骼细丝，膜结构和不同的支架联系起来，以实现细胞形状的变化，运动和其他重要过程。NDC80的键动力学复合物将力从微管拆卸到细胞分裂期间的染色体运动。最近，与沿正端方向拉动相比，当朝着微管的负末端拉动时，该复合物已被证明可以更容易从微管脱离。在这里，我们使用了粗粒的分子动力学和布朗动力学模拟来解释方向载荷对从微管的NDC80复合物解开的不对称效应，然后将我们的发现概括为其他地图。我们发现，由朝向微管的正端倾斜的NDC80的僵硬茎产生的杠杆臂对于这种复合物的不对称解开至关重要，类似于Dynein的络合物。，EB蛋白，微管交联PRC1和驱动蛋白预计缺乏明显的解体不对称性，这是由于它们几乎垂直于微管壁上的垂直锚固，或者是由于其接头区域的较高灵活性与微管结构域紧密相关。因此，我们的研究突出了地图的一些设计原理，并解释了它们的远端部分如何赋予，调节或消除解开外部载荷方向的依赖性。此信息加深了我们对载荷特性和各种图的功能的理解，并可能指导具有预定义机械特性的合成蛋白系统的设计。