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World File Search SystemPREX1
肌萎缩性侧硬化症中prex1的差异表达。
影响运动神经元的神经退行性疾病，包括肌萎缩性侧索硬化症（ALS），没有治疗方案，通常是致命的（1，2）。我们利用了公正的，整个转录组差异基因表达分析的力量，利用原代患者细胞和组织来发现其表达使用已发表的数据定义零星ALS的基因（3，4）。我们在ALS患者的原代运动神经元中发现了PREX1的显着差异表达，编码了磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸RAC交换因子1。prex1在从ALS患者中分离出的成纤维细胞中也有差异表达。与对照，未固定的成纤维细胞相比，ALS患者成纤维细胞的PREX1转录本在ALS患者成纤维细胞中存在较高水平。这些分析将开始定义ALS的转录格局。
鉴定基于免疫基因组学的肾上腺皮质癌的免疫特异性亚型
摘要：背景：肾上腺皮质癌（ACC）的肿瘤免疫微环境（时间）是异质的。但是，基于时间的ACC分类仍未探索。方法：我们基于二十三个免疫特征的富集水平分层群集ACC，以识别其免疫特异性亚型。此外，我们全面比较了亚型之间的临床和分子纤维。结果：我们分别识别出分别具有高和低免疫特征分数的ACC：ACC的两个免疫特异性亚型。我们证明了通过分析五个不同的ACC队列，这种亚型方法是稳定且可重复的。与免疫H相比，免疫力L的免疫细胞水平较低，整体和无疾病的生存预后较差，肿瘤干性较高，基因组不稳定性，增殖潜力和肿瘤内异质性。此外，ACC驱动基因CTNNB1在免疫中比免疫H中更频繁地突变。与免疫H相比，几种蛋白质，例如MTOR，ERCC1，AKT，ACC1，Cyclin_E1，β-Catenin，Fasn和GAPDH，在免疫H中更高地表达在免疫中。相反，在免疫H中更高度表达了P53，SYK，LCK，PERX1和MAPK。途径和基因本体分析表明，免疫，基质和凋亡途径在免疫H中高度富集，而细胞周期，类固醇生物合成和DNA损伤修复途径在免疫中高度富集。结论：ACC可以分为两种稳定的免疫相关亚型，它们具有明显不同的抗肿瘤反应，分子特征和临床结果。这种亚型可能会为ACC的预后和免疫治疗层分层提供临床意义。