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在事件发生之前的Gardnerella，prevotella和fannyhessea之间的微生物相互作用：前瞻性，观察性研究的方案
摘要简介细菌性阴道病（BV）的病因（一种与生物膜相关的阴道感染）仍然未知。流行病学数据表明它是性传播的。BV的特征是乳酸产生乳酸杆菌的丧失以及兼性和严格的厌氧菌细菌的增加。Gardnerella spp以95％ - 100％的病例存在；在体外，已发现阴道加德纳（Gardnerella daginal）比其他与BV相关的细菌（BVAB）更具毒性。然而，阴道菌在正常的阴道微生物群中发现了G. g。g。g。g。g。定植不足以进行BV发育。我们假设Gardnerella spp启动BV生物膜形成，但是入射的BV（IBV）需要将其他关键的BVAB（IE，Prevotella bivia，Fannehessea daginae）掺入将多因素群体转录组改变的生物膜中。这项研究将研究IBV之前的微生物事件的序列。方法和分析本研究将在阿拉巴马州伯明翰的一家性健康研究诊所中招募150名18-45岁阴道菌群的女性，没有性传播感染。女性每天每天两次自我收集，最多60天。16S rRNA基因测序，用于Gardnerella spp，P。bivia和F. f. f。f。f。f。divcr以及范围16S rRNA基因QPCR的QPCR将在每天的两次阴道标本中进行，来自IBV女性的阴道女性两次（至少连续2个日子）和对照组的差异（至少是连续2个）和竞赛，并具有可比性的年龄，并且对竞赛的差异，并在竞赛中进行了差异，并在竞赛中进行了反对，并且竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，并在竞赛中，并且竞赛，竞赛和竞赛，竞赛，并在竞赛中，竞赛，竞赛，并竞争。 Microbiota研究IBV女性随着时间的流逝，阴道菌群的变化。参与者将每天对包括性活动在内的多种因素完成日记。道德和传播该协议得到了阿拉巴马大学伯明翰机构审查委员会（IRB-300004547）的批准，并将获得所有参与者的书面知情同意。调查结果将在科学会议上提出，并在同行评审的期刊上发表，并将其传播给感兴趣的社区的提供者和患者。
肠道微生物群中的大量Prevotella copri与2型糖尿病患者的健康饮食成反比
虽然已知肠道菌群受到习惯性食物的影响，但在2型糖尿病患者中很少探索这种关系。本研究旨在研究113种2型糖尿病患者（平均年龄，58岁；体重指数，29.1; Glyemogogoglobin [HBA1C]，8.1％）的饮食模式与肠道微生物物种丰度之间的关系。我们使用16S扩增子测序分析了肠道微生物群，所有患者均分为菌型型肠型（57.5％，n¼65）或prevotella entype（42.5％，n¼48），使用围绕Mediots群集的Algoriths基于最佳代表的分类，该分类属于MEDIDINIDION。与prevotella肠型相比，型菌型肠型的患者显示出更好的血糖对照，HbA1c≤7.0％的比例为2.71次（95％的置态间隔，1.02 E 7.87; p，0.034）。使用经过验证的食物频率问卷评估所有患者的饮食习惯和营养成分。观察到，所消耗的饮食纤维量次优，平均每天摄入量为16 g。此外，我们通过因素分析提取了四种饮食模式：吃外，高糖食品，菜单和发酵食品模式。与Prevotella肠型相比，患有BACTROIDES型的患者的蔬菜模式的分数更高（0.17±0.13 vess v ^ 0.23±0.09; P，0.010）。我们进一步研究了微生物群与四种饮食模式之间的关系，发现只有植物饮食模式评分与主坐标值相关。较低的模式分数与31个显着的微虫特征的累积丰度相关。在这些特征中，通过使用随机森林模型将Prevotella copri鉴定为最重要的，其接收器操作特征下的面积为0.93（95％的置态间隔，0.88 E 0.98）。为了验证这些结果，我们进行了自定义定量聚合酶链反应测定法。该测定法证实了我们队列中P. copri（灵敏度，0.96; Specii fimitivitive; Specii fimitivitive; Specii fircity，0.97）的存在，患病率为47.8％，平均相对丰度为21.0％。总而言之，患有prevotella肠型的2型糖尿病患者表现出较差的血糖控制和与健康饮食模式的偏差。作为主要促成微生物特征的大量P. copri，与饮食中的饮食小菜和蔬菜的严重程度有关。应重点放在促进健康的饮食模式和了解微生物相关性上。
prevotella timonensis通过高糖苷酶和唾液酸酶活性降解阴道上皮糖蛋白
摘要细菌性阴道病（BV）是女性再生产地段的多数菌感染。bv的特征在于通过包括众所周知的gardnerella daginalis在内的多种厌氧菌替代与健康相关的乳杆菌物种。prevotella timonensis和prevotella bivia是在大量BV患者中发现的厌食症，但它们对疾病过程的贡献仍有待确定。定义BV中厌氧过度生长的特征是粘膜表面的依从性，并且在阴道分泌物中粘液降解酶（例如唾液酸酶）的活性增加。我们证明了timonensis，但没有强烈粘附于阴道和宫颈细胞的水平与阴道G. g。Timonensis基因组独特地编码了大量粘液降解酶，包括四种假定的诱导酶和两个假定的唾液酸酶PTNANH1和PTNANH2。酶测定表明，岩藻糖苷酶和唾液酸酶的活性在结合细胞链球菌和分泌的馏分中明显高于其他阴道厌食症。在感染测定中，蒂莫宁SIS有效去除了来自上皮糖蛋白的岩藻糖和α2,3和α2,6和α2,6-链接的唾液酸部分。重组表达的timonensis nanh1和nanh2从上皮表面切割α2,3和α2,6-连接的唾液酸，而在抑制剂上可以阻止timonensis通过抑制剂来阻断唾液酸。我们的结果强调了了解不同厌氧菌在BV中的作用的重要性。这项研究表明，Timonensis具有不同的毒力相关特性，其中包括初始粘附和在阴道上皮粘膜表面粘蛋白降解的高能力。
基于石墨烯纳米级超级晶格的等离子生物传感器的建模
摘要简介细菌性阴道病（BV）的病因（一种与生物膜相关的阴道感染）仍然未知。流行病学数据表明它是性传播的。BV的特征是乳酸产生乳酸杆菌的丧失以及兼性和严格的厌氧菌细菌的增加。Gardnerella spp以95％ - 100％的病例存在；在体外，已发现阴道加德纳（Gardnerella）阴道比其他BV-相关细菌（BVAB）更具毒性。然而，阴道菌在正常的阴道微生物群中发现了G. g。g。g。g。g。定植不足以进行BV发育。我们假设Gardnerella spp启动BV生物膜形成，但是入射的BV（IBV）需要将其他关键的BVAB（IE，Prevotella bivia，Fannehessea daginae）掺入将多因素群体转录组改变的生物膜中。这项研究将研究IBV之前的微生物事件的序列。方法和分析本研究将在阿拉巴马州伯明翰的一家性健康研究诊所中招募150名18-45岁阴道菌群的女性，没有性传播感染。妇女每天会自我收集两次阴道标本，长达60天。16S rRNA基因测序，用于Gardnerella spp，P。bivia和F. f. f。f。f。f。divcr以及范围16S rRNA基因QPCR的QPCR将在每天的两次阴道标本中进行，来自IBV女性的阴道女性两次（至少连续2个日子）和对照组的差异（至少是连续2个）和竞赛，并具有可比性的年龄，并且对竞赛的差异，并在竞赛中进行了差异，并在竞赛中进行了反对，并且竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，竞赛，并在竞赛中，并且竞赛，竞赛和竞赛，竞赛，并在竞赛中，竞赛，竞赛，并竞争。 Microbiota研究IBV女性随着时间的流逝，阴道菌群的变化。参与者将每天对包括性活动在内的多种因素完成日记。道德和传播该协议得到了阿拉巴马大学伯明翰机构审查委员会（IRB-300004547）的批准，并将获得所有参与者的书面知情同意。调查结果将在科学会议上提出，并在同行评审期刊上发表，并将其传播给感兴趣的社区的提供者和患者。
在高丙酸和低甲烷产生的奶牛的瘤胃菌群和普雷特拉分离株的特征
瘤胃产量是瘤胃发酵过程中产生的代谢氢的主要水槽，并且是温室气体（GHG）排放的主要贡献者。个体反刍动物表现出不同的甲烷产生效率；因此，了解低甲烷发射动物的微生物特征可能会给肠甲烷提供降低的机会。在这里，我们研究了瘤胃发酵与瘤胃微生物群之间的关联，重点是甲烷产生，并阐明了在低甲烷产生的奶牛中发现的细菌的生理特征。13个荷斯坦母牛喂养基于玉米青贮饲料的总混合评分（TMR），并检查了进食消化，牛奶产量，瘤胃发酵产品，甲烷的产量和瘤胃微生物组成。使用主要成分分析将母牛分为两个瘤胃发酵组：低和高产生甲烷的牛（36.9 vs. 43.2 l/dmi消化），具有不同的瘤胃短链脂肪酸比率[（C2 + C4）/C3]（3.54 vs. 5.03）和Drul Matter（69）和Druly（69）（69）（69）（69）（69）。但是，两组之间的干物质摄入量（DMI）和牛奶产量没有显着差异。此外，两组之间分配给未经培养的Prevotella sp。，琥珀尼维利奥和其他12种细菌系统型的OTU有差异。特别是先前未经培养的新型Prevotella sp。，在低甲烷产生的母牛中的丰度更高。这些发现提供了证据表明Prevotella可能与低甲烷和高丙酸酯产生有关。但是，需要进一步的研究来改善对肠甲烷缓解涉及的微生物关系和代谢过程的理解。
prevotella copri和菌群成员介导了营养不良的治疗食品的有益作用
微生物群指导的互补食品（MDCF）制剂旨在修复营养不良的儿童的肠道群落。一项随机对照试验表明，与更热量致密的标准营养干预相比，营养不良的孟加拉国儿童的体重增加改善。来自研究参与者的元基因组组装的基因组揭示了Prevotella prevotella copri菌株的洪泛生长与MDCF-2聚糖途径的表达之间的相关性。为了测试这种相关性，在这里，我们使用与定义的年龄和洪巴生长相关的肠道肠细菌菌株定义的gnotobiotic小鼠，有或没有任何具有多疟原虫分离株与元基因组分离的基因组密切匹配。将肠道基因组学和元文字组合与宿主单核RNA测序和肠道代谢组分析结合在一起，我们确定了P. copri在代谢MDCF-2 Glycans中的关键作用，并发现其与其他微生物的相互作用，包括双歧杆菌。P. copri - 含有肠的体重增加和肠上皮细胞内的调节能量代谢。我们的结果揭示了MDCF-2与营养不良儿童的肠道菌群成员之间的结构 - 功能关系，对未来疗法有潜在影响。
prevotella诱导单核细胞的IL-10产生*
简介舌下免疫疗法（SLIT）的机制被认为与疗法后疗法增加有关，介导了白介素10（IL-10），一种调节性细胞因子（1）。我们的研究集中在唾液微生物组上，因为在SLIT期间提供的抗原首先与口服粘膜上的免疫细胞相互作用。实际上，我们在先前的一项研究中发现，与直接从腮腺导管中收集的唾液相比，从人类单核细胞系中诱导的Thp-1细胞中的IL-10产生更大，该唾液管的多样性微生物组较少，预期唾液的多样性（2）。我们的研究还表明，唾液微生物组中普雷托氏菌的组成比与唾液刺激的THP-1细胞的IL-10产生量正相关，并且在缝隙后患有临床缓解的患者中较高（3）。基于这些结果，我们认为Prevotella诱导IL-10产生，并有助于对缝隙的良好响应。
从类风湿性关节炎患者肠道中分离出的致关节炎普氏菌的基因组组与致病力相关
摘要 目的 人体普氏菌被认为是类风湿性关节炎 (RA) 的一个促成因素。然而，在一些非西方化国家，健康个体的肠道中也含有大量的 P. copri。本研究调查了 RA 患者来源的 P. copri ( P. copri RA ) 与健康对照者来源的 P. copri ( P. copri HC ) 的致病性。方法 我们从 RA 患者和健康对照者的粪便中获得 13 株 P. copri 菌株。全基因组测序后，对 P. copri RA 和 P. copri HC 的序列进行了比较。为了分析 P. copri 的诱发关节炎能力，我们检查了两种关节炎模型 (1) 在无特定病原体条件下含有 P. copri 的胶原诱导性关节炎模型和 (2) 在 P. copri 单一定植条件下的 SKG 小鼠关节炎模型。最后，为了评估 P. copri 激活先天免疫细胞的能力，我们在体外用 P. copri RA 和 P. copri HC 刺激骨髓来源的树突状细胞 (BMDC)。结果比较基因组分析显示 P. copri RA 和 P. copri HC 之间核心基因内容没有明显差异，但泛基因组分析显示 P. copri 具有较高的基因组可塑性。我们将 P. copri RA 特异性基因组区域鉴定为接合转座子。在两种关节炎模型中，P. copri RA 诱发的关节炎均比 P. copri HC 严重。体外 BMDC 刺激实验显示 P. copri RA 上调 IL-17 和 Th17 相关细胞因子 (IL-6、IL-23)。结论 我们的研究结果揭示了 P. copri 的遗传多样性，以及与 P. copri RA 强效诱发关节炎能力相关的基因组特征。我们的研究有助于阐明 RA 的复杂发病机制。