XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemQTL
在受保护的种植下对草莓的评论 通过从xanthomonas oryzae PV中筛选稻米魔法种群中鉴定出的抗性和敏感性QTL。 oryzae 全球资源用于探索和利用高粱作物野生亲戚的遗传变异
细菌和酵母是从鳄梨树的叶子，花朵和果实中分离出来的几年，这些鳄梨树已经被杀虫剂喷洒了几年。分离出的1050种微生物，37％抑制了谷甲藻菌菌群在马铃薯葡萄糖琼脂上的菌丝体生长。这些生物中的许多生物还显着降低了质真菌在覆盖弱糖琼脂的孢子虫的孢子发芽，而比细菌的酵母比更有效。一些细菌和酵母还减少了鳄梨叶盘上病原体的孢子发芽。主要的抑制细菌组为芽孢杆菌属，拮抗酵母菌包括金黄色葡萄球菌。以及各种粉红色和白色菌落类型。杆菌的抗生素耐药物，两种酵母菌的甲状腺素抗分离株和一个金黄色卵巢菌。喷在鳄梨叶上，并在Phylloplane上存活至少2个月。根据这些测试的性能，选择了生物防治和定殖电势的分离株，并测试了它们提供疾病控制水果的能力。在重复测试中，几种细菌和酵母在用病原体接种果实之前施用脱离的鳄梨果实的病变发育和病变大小。
通过基因编辑验证功能等位基因，充分利用丰富的遗传资源进行作物改良
摘要：过去几十年来，分子技术的发展（例如高通量 DNA 标记基因分型）提供了更强大的植物育种方法，包括标记辅助选择和基因组选择。同时，以全基因组测序为首的对植物遗传学和基因组学的大量投资使人们对植物基因组中的基因和遗传途径有了更深入的了解。然而，正向遗传学方法（从表型开始绘制突变位点或 QTL，目的是克隆致病基因）与反向遗传学方法（从大规模序列数据开始，然后追溯基因功能）之间仍然存在差距。最近建立的基于 CRISPR-Cas 的高效基因编辑有望弥补这一差距，并提供一种快速方法来验证通过自然变异研究确定的基因和等位基因的功能。CRISPR-Cas 技术可用于敲除单个或多个基因、通过碱基编辑和主要编辑精确修改基因以及替换等位基因。此外，原生质体分离、植物体内转化和发育调控基因的使用等技术有望实现高通量基因编辑，从而加速作物改良。
分子标记辅助选择及其在植物育种计划中的应用的最新进展
背景：DNA 标记通过标记辅助选择 (MAS) 提高了传统植物育种的生产力和准确性。不同植物物种的大量数量性状基因座 (QTL) 映射读取提供了丰富的分子标记-基因关联。摘要主体：在这篇评论中，我们讨论了分子标记辅助选择的积极方面及其在植物育种计划中的精确应用。分子标记辅助选择大大缩短了新作物品种上市的时间。为了探索有关 DNA 标记的信息，过去几十年来已经发表了许多评论；所有这些评论都是植物育种者为了获得分子遗传学信息而发表的。在这篇评论中，我们旨在概述 DNA 标记的最新发展及其在植物育种计划中的应用，并致力于对 DNA 标记知之甚少或一无所知的早期育种者。分子植物育种、植物遗传学、基因组选择和基因组编辑方面的进展有助于全面了解 DNA 标记，并为农作物遗传多样性提供了多种证据，极大地补充了植物育种装置。
大麦育种在提高氮利用率方面的进展...
摘要：高氮利用效率（NUE）或耐低氮的作物育种被认为是减少氮肥过量使用造成的成本、碳足迹和其他环境问题的理想解决方案。作为谷物作物的模型植物，大麦具有许多优点，包括适应性好、生育期短、抗逆性强或耐逆性强。因此，提高大麦 NUE 的研究不仅有利于氮高效大麦育种，而且还将为其他谷物作物的 NUE 改良提供参考。本文总结了大麦对氮营养反应的理解、NUE 或耐低氮性的评估、与提高 NUE 相关的 QTL 定位和基因克隆以及氮高效大麦育种方面的最新进展。此外，还介绍了可用于揭示大麦 NUE 的分子机制或提高大麦 NUE 育种的几种生物技术工具，包括 GWAS、组学和基因编辑。本文还讨论了揭示提高其他作物氮利用效率的分子机制的最新研究思路，从而为提高大麦的氮利用效率提供了更好的理解，并为该领域的未来研究提供了一些方向。
BSAseq：一种基于网络的交互式集成工作流程，用于识别大量 F2 群体中的因果突变
摘要摘要：随着新一代测序 (NGS) 技术的进步和这些技术成本的降低，批量分离分析 (BSA) 不仅成为绘制数量性状基因座 (QTL) 的有力工具，而且成为识别感兴趣表型的因果基因突变的有效方法。然而，由于存在背景突变和测序、基因分型和参考组装中的错误，通常很难区分真正的因果突变和背景突变。在本研究中，我们开发了 BSAseq 工作流程，其中包括一个自动化生物信息学分析流程，带有用于估计分离区域的概率模型和用于可视化结果的交互式 Shiny Web 应用程序。我们对雄性不育亲本系 (ms8) 进行了深度测序，以捕获批量 F2 数据中的大多数背景突变。我们将该工作流程应用于 11 个批量 F2 种群，并确定了每个种群中的真正因果突变。该工作流程直观而直接，方便没有生物信息学分析技能的用户采用。我们预计 BSAseq 将广泛应用于识别许多感兴趣的表型的因果突变。可用性：BSAseq 可在 https://www.sciapps.org/page/bsa 免费获取联系人：liya.wang@cshl.edu、ware@cshl.edu、zhanguo.xin@ars.usda.gov
小鼠的前室深度受到几个定量性状基因座的控制
前室深度（ACD）是与一角闭合青光眼（PACG）相关的定量性状。尽管ACD高度可遗传，但已知的遗传变异解释了表型变异性的一小部分。这项研究的目的是使用小鼠菌株鉴定附加的ACD影响基因座。由86 N2和111 F2小鼠组成的队列是由重组近近近近近近将BXD24/ TYJ和野生衍生的铸造/ EIJ小鼠之间的十字产生的。使用前腔室光学相干断层扫描，在10-12周龄时表现出小鼠，基于93个全基因组SNP进行基因分型，并进行定量性状基因座（QTL）分析。在对所有小鼠的ACD分析中，六个基因座通过了p = 0.05的显着性阈值，并在多次回归分析后持续存在。这些是在染色体6、7、11、12、15和17上（分别为ACDQ6，ACDQ7，ACDQ11，ACDQ12，ACDQ15，ACDQ15和ACDQ17）。我们的发现证明了在小鼠中ACD遗传的定量多生成术，并确定了六个先前未识别的ACD影响基因座。我们采用了一种独特的方法来研究前室深度表型，通过使用小鼠作为遗传工具来检查这种连续分布的性状。
DNA Primase大亚基是双子病毒的必不可少的植物基因
双子座科的家族由500多个可以感染众多双核和单子植物的圆形单链（SS）DNA病毒物种组成。双子病毒利用宿主的DNA复制机制，在植物细胞的核中复制其基因组。将其DNA转化为双链DNA，随后复制，这些病毒依赖于宿主DNA聚合酶。但是，此过程的第一步的启动，即传入的圆形ssDNA转化为dsDNA分子，已经难以捉摸近30年。In this study, sequencing of melon ( Cucumis melo ) accession K18 carrying the Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) recessive resistance quantitative trait locus (QTL) in chromosome 11, and analyses of DNA sequence data from 100 melon genomes, showed a conservation of a shared mutation in the DNA Primase Large subunit ( PRiL ) of all accessions that对TolCNDV的挑战表现出抵抗力。沉默（天然）烟熏本尼亚人pril以及随后对三种不同的双子病毒的挑战表明，所有三种病毒的滴度都严重减少，完全强调了pril在双子病毒复制中的重要作用。呈现了一个模型，以解释Pril在GESINIVIRAL DNA复制启动中的作用，即 作为原始酶的调节亚基，在DNA复制开始时类似于DNA Primase - 在所有生物体中介导的DNA复制起始。呈现了一个模型，以解释Pril在GESINIVIRAL DNA复制启动中的作用，即作为原始酶的调节亚基，在DNA复制开始时类似于DNA Primase - 在所有生物体中介导的DNA复制起始。
对理解花生种子开发法规景观的进展
花生（Arachis hypogaea）是一种以其独特的发育过程而闻名的精油作物，其特征是空中浮动，其特征是地下水果的发展。该作物是多倍体，由A和B亚基因组组成，这使其遗传分析变得复杂。OMICS技术的出现和进步 - 包括基因组学，转录组学，蛋白质组学，表观基因组学和代谢组学 - 显着提高了我们对花生生物学的理解，尤其是在种子发育以及种子相关性状的调节的背景下。在完成花生参考基因组完成后，研究利用OMICS数据来阐明与种子重量，油含量，蛋白质含量，脂肪酸成分，蔗糖含量和种子外套的颜色以及调节性机制的定量性状基因座（QTL）。本综述旨在总结基于参考基因组指导的OMICS研究的花生种子发展调节和性状分析的进步。它概述了在理解花生种子发育的分子基础中取得的显着进步，从而洞悉了影响关键的农艺特征的复杂遗传和表观遗传机制。这些研究强调了法律数据的重要性，以深刻阐明花生种子发育的调节机制。此外，它们为未来与性状相关功能基因的研究奠定了基础，强调了综合基因组分析在促进我们对植物生物学的理解方面的关键作用。
对蝴蝶中Haldane规则的多基因解释
已经发现了有关动物杂种的两个强大规则：异质杂种更不合适（Haldane的规则），并且性别染色体与混合不相容性（大X/z效应）涉及不成比例。在女性异型分类群（例如黄油岩）中引起这些规则的确切机制是未知的，但理论上建议涉及性染色体上的优势。我们研究了帕皮里奥（Papilio）和Heliconius Butter lop tos of to cons of Hybrid不兼容性，并表明优势理论无法解释我们的数据。相反，许多缺陷与Z染色体和所有常染色体之间的多焦渗入不平衡的多焦点渗入一致。我们的多基因解释预测了这两个规则，因为异元女性的失衡可能更大，而侵入的祖先的比例在thezchromosome上的变化更大。WealSoshowThatMappingTraitspolyGertraitspolygenicenasingleChromosomemosomein Backcrosses中可能会引起潮流的大型大型大型效果。这种幻影是由多基因之间的统计连接引起的，这些多基因的统计连接量是估计效应大小的量子。通过控制统计链接，我们混合交叉中的大多数不相容性QTL与多基因基础一致。由于两个属与远处相关，因此多基因混合不相容性可能在黄油环中常见。
2022 年年度报告
在蓖麻中，可靠且可重复的体外再生方案已经得到优化。有希望的早期（ICH-1146、ICH-440）和中期（ICH-277）杂交种正在协调试验的不同测试阶段。鉴定出三种在种子产量（>50%）和油含量（>49%）方面均表现优异的实验杂交种。在抗性育种方面，鉴定出一种具有灰霉病抗性的育种系 K-18-1-2，而两种育种系 K-18-162 和 GMM-3 在人工附生条件下对灰霉病表现出中等抗性/耐受性反应。此外，还验证了一个灰霉病抗性的主要 QTL。五种对尖镰孢菌属具有抗性反应的基因型。蓖麻（For）分离株来自 3 个中心，其中两种基因型对叶蝉具有中等抗性，五种基因型对粉虱具有高抗性，一种自交系 K-18-45-1 具有抗蒴果蛀虫性，已鉴定出两种耐旱品系。对变性土保护性农业实践的研究表明，在减少耕作和常规耕作方式下，种子产量相当，而且减少耕作还增加了土壤有机碳含量。蓖麻 + 花生间作系统记录的蓖麻当量产量最高。