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基于TCGA HCC数据库的HCC组合治疗策略的探索
肝细胞癌（HCC）是最致命的癌症之一。索拉非尼目前是FDA批准HCC的唯一可用的第一线分子靶向药物。但是，经常用索拉非尼治疗遇到一级和次要抵抗。HCC中发现的基因组改变代表了针对这种类型癌症开发新药物或新组合策略的潜在靶标。在这里，我们分析了HCC样品的TCGA数据库和诊所可用的相应靶向药物的基因组改变，以鉴定与索拉非尼结合使用时可能有希望的候选药物。我们的结果表明，在HCC中，IL6，JAK1，LEPR和RAF1相关途径通常会改变，这些途径针对医学实践中可用的药物。14个具有可用靶向药物的基因经常在HCC中改变。具有各自靶向药物的途径和基因靶标需要在临床试验中进一步评估，以确定其单独或与索拉非尼联合治疗HCC治疗中的治疗价值。总而言之，TCGA的分析确定了一系列具有靶向药物的途径，这些途径在HCC中改变了。与特定靶向药物的组合处理，具体取决于个体中发现的改变的途径，可以提供更好的治疗策略，最终将改善个体患者的生存。
认可参数列表 Oncoscreen Jena v5.xlsx
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组：AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1