PCR based genetic markers : RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), SSR (Simple Sequence Repeat), STR (Single Tendem Repeats), VNTR (Variable Number Tendem Repeat), STS (Sequence Tag Size), SNP (Single Nucleotide Polymorphism), EST (Expressed Sequence Tagged) Hybridization based遗传标记:RFLP(限制片段长度多态性)分子标记也可以分类为 -
1. 限制性片段长度多态性 (RFLP) 2. 扩增片段长度多态性 (AFLP) 3. 随机扩增多态性 DNA (RAPD) 4. 切割扩增多态性序列 (CAPS) 5. 简单序列重复 (SSR) 长度多态性 6. 单链构象多态性 (SSCP) 7. 异源双链分析 (HA) 8. 单核苷酸多态性 (SNP) 9. 表达序列标签 (EST) 10. 序列标记位点 (STS)
在孟加拉国农业大学的BAU-GPC和遗传学和植物育种实验室进行了实验,研究了Wax Jambu(Syzygium samarangense)的形态学特征(遗传变异性,遗传变异性,角色的关联,相关性和路径系数分析,均来自Wax JAX jax JAX的辅助,遗传变异性,角色的关联和路径系数分析,BAUIA,并分析BAUIA,bauia fefc and frecor, 2012年3月,2013年。随机扩增多态DNA(RAPD)用于表征分子水平的这些饰品。尽管非常相似,但在水果颜色,形状和TSS百分比具有不同的叶片特征方面,蜡jambu的5个饰面的形态彼此不同。在路径分析,水果宽,干物质和水分百分比方面有助于最大的表型和基因型直接对水果重量的直接影响,表明其作为选择参数的重要性。分子表征,以使用随机扩增的多态性DNA(RAPD)标记来研究5个蜡jambu辅助的变异性。在筛选的4个引物中,选择了2个引物,从而产生了23个清晰明亮的片段。在所使用的两个引物之间,CCAACGTCGG显示出最高水平的多态性(83.33%)。,19(82.7%)是多态性的。NEI(1972)蜡jambu的遗传多样性的估计为0.3339,而香农的信息指数为0.4952。在Bau Jamrul 3和印度尼西亚Jamrul之间观察到最高的遗传距离(0.9861)。另一方面,在Bau Jamrul 1和Bau Jamrul 2之间发现了最低距离(0.1911),这表明辅助之间存在很大的遗传差异。目前在不同形态型和syzygium samarangense的鉴定过程中使用分子标记作为形态学描述的补充的潜力提供了足够的支持
摘要。引入分子标志物已导致水果作物的遗传多样性变化。它们对于多种学科至关重要,例如分类法,基因映射,系统发育分析和疾病抗性评估。这项广泛的研究着眼于各种分子标记,包括AFLP,RAPD,SSRS,SCOT和SNP,以表征水果作物基因组。我们研究了它们如何有助于我们对疾病抗病性,遗传多样性和进化论,在多种果实作物中的动态,例如坚果和热带,亚热带和温带水果。繁殖者现在可以创建具有改善性状,更快的繁殖时间表和更好遗传资源保护的新品种。他们使进行自定义的遗传分析并更深入地了解农业以外的其他领域的遗传学和进化是可行的。从水果作物,保护计划以及更大的科学和医学领域中遗传资源的可持续使用都受到这种历史观点的影响。
发展中国家粮食不安全的主要原因是全球人口增长、气候变化和可耕地面积减少。因此,植物遗传多样性作为研究课题的重要性被普遍认为是重要的。分子遗传学领域的一个重大进步包括利用分子标记来探索和鉴定植物遗传多样性。分子标记现在经常用于植物育种研究,从鉴定决定所需性状的基因到管理不同的回交育种策略。它们为解决农业基因组学中提到的挑战提供了实用的解决方案。在这篇综述文章中,我们全面回顾了植物遗传多样性的来源。本综述还描述并强调了 DNA 标记 AFLP、ASAP、ASO、CAPS、CAS、细胞质基因组衍生 DNA 标记、DGGE、EST、ISSR、SSR、RAPD、RBIP 和 SNP 的应用,这些标记可用作鉴定植物遗传多样性的可靠而有效的工具。关键词:遗传多样性、植物、DNA、分子标记
在大多数亚洲和撒哈拉以南国家,非洲鲶鱼(Clarias gariepinus)是第二大最常见的养殖鱼类。遗传多样性和种群结构的量化对于解释、理解和管理种群和个体至关重要。非洲鲶鱼(C. gariepinus)由于生长速度快、适应各种养殖条件的能力强、繁殖力强,于 20 世纪 50 年代首次进行了遗传改良,然后在 20 世纪 70 年代中期成为非洲水产养殖的最佳鲶鱼。非洲鲶鱼遗传学和育种研究已使用多种分子标记,如同位素酶、线粒体 DNA、SNP、RAPD、微卫星和 SDS-PAGE 标记来评估遗传差异和相似性,以确保遗传改良和 C. gariepinus 鱼种的选择性育种计划。通过使用遗传多样性和种群结构评估,还可以量化 C. gariepinus 鱼类种群内和种群之间的遗传差异。这些对于制定遗传保护和管理策略、可持续管理具有经济重要性的水产养殖鱼类(如 C. gariepinus)至关重要。遗传改良和标记辅助选择性育种计划对于广泛了解具有经济重要性的品系至关重要。
Anuradha 博士于 2011 年以 DBT JRF/SRF 奖学金获得泰米尔纳德邦农业大学哥印拜陀分校生物技术博士学位,并于 2005 年以 JNU 奖学金获得泰米尔纳德邦农业大学生物技术硕士学位。博士研究期间的专业领域包括木薯再生和遗传转化协议的标准化。她还从泰米尔纳德邦的不同地区克隆和鉴定了印度和斯里兰卡木薯花叶病毒的复制酶基因,并将这些基因提交到 NCBI 核苷酸数据库中。博士研究期间的主要重点是通过 RNA 干扰获得木薯植物的病毒抗性。她构建了专门针对印度和斯里兰卡木薯花叶病毒复制酶基因的 RNAi 载体,并生成了抗木薯花叶病毒的假定转基因木薯系。加入 KAU 之前,她曾在纳格浦尔中央柑橘研究所担任农业研究科学家。在此期间,她通过 RAPD 标记和柑橘根茎抗病差异基因表达研究,从事柑橘种质鉴定工作。目前的研究兴趣领域是植物基因组编辑以改善性状、植物表观遗传基因调控以及基因克隆和表达。
非洲鲶鱼C. gariepinus是撒哈拉以南非洲和大多数亚洲国家养殖面积第二大的鱼类。为了解释、理解和管理种群和个体,遗传多样性和种群结构及其量化非常重要。由于非洲鲶鱼C. gariepinus生长速度快、对各种养殖条件的适应能力强以及繁殖力强,在20世纪50年代首次进行了遗传改良,并在20世纪70年代中期成为非洲水产养殖的最佳鲶鱼。在非洲鲶鱼遗传和育种研究中,各种分子标记,包括同种酶标记、mtDNA标记、SNPs标记、RAPD标记、微卫星标记和SDS-PAGE标记已被用来评估遗传相似性和分歧,以确保C. garipinus鱼种的遗传改良和选择性育种计划。遗传多样性评估和种群结构评估也用于量化 C. gariepinus 鱼类种群内部和种群之间的遗传差异。这些对于制定遗传保护和管理战略、可持续管理具有经济价值的水产养殖鱼类(如 C. gariepinus)至关重要。遗传改良和标记辅助选择性育种计划对于广泛了解具有经济价值的品系至关重要。
1。为学生提供有关基因组学和蛋白质组学的基本知识2。对基因组映射,结构/功能基因组学,基因组学和蛋白质组学涉及的技术的广泛知识。课程内容单元1:OMICS的基因和基因组介绍;基因组学类型;基因:orf;外显子;内含子;原核,真核和线粒体/叶绿体基因组; shot弹枪DNA测序; c-value&paradox;人类基因组项目。单元2:基因组图和分析基因组映射的基因表达类型;涉及基因组图和基因表达分析的技术(RFLP,RAPD,SSCP,SSLP,STS,RT-PCR; DD-PCR,SNP,FISH,FISH,NUCLEASE保护测定,分子杂交)。单元3:蛋白质组学概念和蛋白质组成分的基础;蛋白质组学在生物学功能中的重要性;蛋白质 - 蛋白质相互作用和研究它的方法:蛋白质阵列,交叉链接方法,亲和力方法,酵母杂种系统。单元4:蛋白质质谱法(MS)的质谱分析 - 肽质量指印,质量精度,分辨率,灵敏度;离子来源:电喷雾电离,基质辅助激光解吸和电离;质量分析仪:四极,离子陷阱,飞行时间,圆形,傅立叶 - 转换离子回旋共振,混合分析仪;探测器; MS-MS; LC-MS。教科书:-1。基因组分析和基因组学原理S.B. Primrose和R.M. Twyman,第三版(Blackwell Publishing)。2。Liebler,“蛋白质组学简介” Humana出版社3。Conard,爱德华。 基因组学。 2.Pennington,SR,Dunn MJ,“蛋白质组学:功能的蛋白质序列”。Conard,爱德华。基因组学。2.Pennington,SR,Dunn MJ,“蛋白质组学:功能的蛋白质序列”。Apple Academics参考书:-1。ODD RW,Primrose SB,“基因操纵原理,基因工程概论”,Blackwell Science Publications。viva书3.生物技术的质谱法:Gary Siuzdak。