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用于识别肾癌治疗的BRD4和STAT3的新型和高效的双目标抑制剂的组合筛选方案
同时抑制含溴脱域的蛋白4（BRD4）和信号转导子和转录3（STAT3）激活因子可能是针对肾细胞癌（RCC）的有效策略。在这里，我们使用组合筛选协议成功地识别了五个双靶标BRD4/STAT3抑制剂（BSTS 1-5）。尤其是BST-4是最有效的抑制剂，同时靶向BRD4（IC 50 = 2.45±0.11 nm）和STAT3（IC 50 = 8.07±0.51 nm）。MD模拟表明，BST-4稳定与BRD4和STAT3的活动位点结合。细胞毒性测定表明，BST-4针对RCC细胞系具有显着的抗增殖活性，尤其是CAKI-2细胞（IC 50 = 0.76±0.05μm）。此外，与阳性对照RVX-208和CJ-1383相比，体内实验表明，BST-4更有效地抑制异种移植肿瘤的生长。总体而言，这些数据表明BST-4可能是RCC治疗的有前途的候选化合物。
组蛋白去乙酰化酶抑制剂 Largazole 抑制 SP1 和 BRD4，使一组超级增强子失活，并导致有丝分裂染色体错位
组蛋白去乙酰化酶抑制剂已被研究作为癌症和其他疾病的潜在治疗剂。已知 HDI 可促进组蛋白乙酰化，从而导致开放染色质构象并通常增加基因表达。在之前的研究中，我们报告了一组基因，特别是那些由超级增强子调控的基因，可以被 HDAC 抑制剂拉格唑抑制。为了阐明拉格唑抑制基因的分子机制，我们进行了转座酶可及染色质测序、ChIP-seq 和 RNA-seq 研究。我们的研究结果表明，虽然拉格唑治疗通常会增强染色质的可及性，但它会选择性地降低一组超级增强子区域的可及性。这些基因组区域在拉格唑存在下表现出最显著的变化，富含 SP1、BRD4、CTCF 和 YY1 的转录因子结合基序。 ChIP-seq 分析证实 BRD4 和 SP1 在染色质上各自位点的结合减少，特别是在调节基因（如 ID1、c-Myc 和 MCM）的超级增强子上。拉格唑通过抑制 DNA 复制、RNA 加工和细胞周期进程发挥作用，部分是通过抑制 SP1 表达来实现的。shRNA 消耗 SP1 可模拟拉格唑的几种关键生物学效应并增加细胞对该药物的敏感性。针对细胞周期调控，我们证明拉格唑通过干扰中期染色体排列来破坏 G/M 转换，这种表型在 SP1 消耗时也观察到。我们的结果表明，拉格唑通过抑制超级增强子上的 BRD4 和 SP1 发挥其生长抑制作用，导致细胞抑制反应和有丝分裂功能障碍。
20250120_INAOE_加入DRD4_v0的请求.pdf
Daniel Durini 博士目前是 INAOE 微电子和辐射探测领域的终身研究科学家 B（相当于教授）。2019 年 9 月至 2024 年 1 月期间，他担任该研究所的研发总监。他于 2002 年获得墨西哥国立自治大学电气电子工程学士学位，2003 年获得 INAOE 微电子硕士学位，2009 年获得德国杜伊斯堡-埃森大学微电子博士学位。2004 年至 2013 年期间，他就职于德国杜伊斯堡的弗劳恩霍夫微电子电路与系统研究所 (IMS)，在过去四年中，他领导了一个团队，致力于开发用于高性能光电检测设备、像素结构和成像器的特殊 CMOS 工艺模块。在担任现职之前，他曾在德国于利希研究中心中央工程、电子和分析研究所 ZEA-2 - 电子系统部任职，2015 年至 2018 年初期间，他负责开发专用于科学应用的探测器系统（闪烁探测器）。他撰写和合著了 90 多篇科学出版物，并在 CMOS 图像传感器和辐射探测器领域拥有六项专利（和两项专利申请）。他是 IEEE 高级会员，自 2014 年起成为墨西哥国家研究人员系统 (SNI) 的成员。
2025; 15(4): 1238-1254. doi: 10.7150/thno.102531 研究论文 一种新型 ROR1 靶向抗体-PROTAC 偶联物促进 BRD4 降解，用于固体 t
原理：蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 是一种双功能化合物，因其在靶向蛋白质降解 (TPD) 中的作用而受到广泛研究。降解已验证或不可成药的靶标的能力使 PROTAC 在癌症治疗中具有显着的效力。然而，PROTAC 的临床应用受到其体内效力差和药代动力学特性不利的限制。方法：在本研究中，通过将 BRD4 降解 PROTAC 与 ROR1（受体酪氨酸激酶样孤儿受体 1）抗体结合，开发了一种新型降解剂-抗体偶联物 (DAC)。评估了 ROR1 DAC 的体外亲和力、内化功效、降解和细胞毒活性。在小鼠模型中评估了 ROR1 DAC 的药代动力学、抗肿瘤活性和急性毒性。通过RNA测序（RNA-seq）和免疫组织化学方法分析ROR1 DAC与抗鼠程序性细胞死亡蛋白1（αmPD1）mAb联合治疗的疗效。
CDK12/13 和 BRD4 分子胶降解剂的合理设计
摘要：靶向蛋白质降解 (TPD) 是一种新兴的治疗方法，用于选择性消除与疾病相关的蛋白质。虽然分子胶水降解剂表现出类似药物的特性，但它们的发现传统上是偶然的，并且通常需要事后合理化。在这项研究中，我们展示了使用粘合部分合理设计分子胶水降解剂的方法。通过将化学粘合部分附加到几种小分子抑制剂上，我们成功地将它们转化为降解剂，从而无需特定的 E3 泛素连接酶募集剂。具体而言，我们发现将疏水性粘合部分整合到细胞周期依赖性激酶 12 和 13 (CDK12/13) 双重抑制剂中可以募集 DNA 损伤结合蛋白 1 (DDB1)，从而将高分子量二价 CDK12 降解剂转化为有效的单价 CDK12/13 分子胶水降解剂。我们还展示了将半胱氨酸反应弹头连接到 BRD4 抑制剂上，通过招募 DDB1 和 CUL4 相关因子 16 (DCAF16) E3 连接酶将其转化为降解剂。
结合数据驱动和基于结构的方法设计用于乳腺癌治疗的双重 PARP1-BRD4 抑制剂
摘要：聚（ADP-核糖）聚合酶 1（PARP1）抑制剂通过合成致死彻底改变了许多具有 DNA 修复缺陷的癌症的治疗方法。在多药理学概念的倡导下，最近的证据发现，同时扰乱溴结构域蛋白 4（BRD4）和 PARP1 的酶活性可显著增加癌细胞的死亡率。在此，我们开发了一种新颖的化学信息学方法，结合基于结构的方法，旨在促进双 PARP1-BRD4 抑制剂的设计。所开发的方法不是连接药效团，而是首先识别合并药效团（一组含酰胺的环系统），然后进一步从中优先考虑菲啶-6(5 H )-酮。基于此出发点，合理设计了几种小分子，其中HF4对BRD4和PARP1表现出低微摩尔抑制活性，特别是对BRD4 BD1表现出强烈的抑制作用，IC 50值为204 nM。此外，它通过阻止细胞周期进程和阻止DNA损伤修复，对乳腺癌基因缺陷和乳腺癌细胞系表现出强大的抗增殖作用。总之，我们设计类先导分子的系统努力有可能为探索双重PARP1-BRD4抑制剂作为乳腺癌治疗的有希望的途径打开大门。此外，所开发的方法可以扩展到系统地设计针对PARP1和其他相关靶标的抑制剂。■简介传统的药物发现主要侧重于设计对其主要靶标具有高度选择性和效力的化学实体。这种单靶点治疗策略强烈地遵循将疾病表型与特定蛋白质功能丧失联系起来的直接因果关系。 1 − 3 然而，疾病尤其是多因素疾病通常被认为是涉及多个目标的生理网络通路中的异常信号转导。 4 因此，基于网络药理学概念，5 化合物的多靶点谱在近几十年的药物发现过程中日益受到重视，并代表了治疗包括肿瘤学和神经退行性疾病在内的复杂和多因素疾病的有效策略。 6 − 9
全基因组CRISPR屏幕将BRD4识别为心肌细胞分化的调节
人类诱导的多能干细胞（HIPSC）到心肌细胞（CM）分化具有研究心脏发育和疾病的重塑方法。在这项研究中，我们在HIPSC中采用了一个基因组宽CRISPR筛选到CM分化系统，并在这里透露BRD4是溴化群和外部（BET）家族的成员，可以调节CM分化。对小鼠胚胎干细胞（MESC）中BET蛋白的化学抑制作用 - 衍生或HIPSC衍生的心脏祖细胞（CPC）导致CM分化和表达祖细胞标记细胞的持久性降低。在体内，第二心脏场（SHF）CPC中的BRD4缺失导致胚胎或早期产后致死性，突变体表现出心肌发育不全和CPC的增加。单细胞转录组学鉴定了对BRD4损失敏感的SHF CPC的亚群，并且与衰减的CM谱系特异性基因程序有关。这些结果突出了BRD4在开发过程中确定CM命运的先前未认识到的作用，而SHF CPC中BRD4的异质要求。
BRD4 降解剂可能有效抵消 AML 和 ALL 中白血病干细胞的治疗耐药性
图 1 BRD4 靶向药物对 AML 细胞增殖和存活的影响。（A）AML 细胞系和（B）从 AML 患者（FLT3 wt，n = 10；FLT3 ITD，n = 7）获得的原代 MNC 在对照培养基（co）或含有不同浓度 JQ1、dBET1 或 dBET6 的培养基中在 37°C 下孵育 48 小时。此后，测量 3 H-胸苷摄取量。细胞系的结果表示为对照（co）的百分比，代表三个独立实验的平均值 ± SD。原代 MNC 的结果表示为对照（co）的百分比，代表不同患者样本的平均值 ± SD。星号 (*)：与对照相比，p < .05。 (C) AML 细胞系和 (D) 原代 AML MNC（FLT3 wt，n = 2；FLT3 ITD，n = 2）在 37°C 下在对照培养基 (co) 或含有不同浓度 JQ1、dBET1 或 dBET6 的培养基中孵育 48 小时。然后，通过流式细胞术检查细胞以确定 Annexin V 阳性细胞的百分比。细胞系的结果以 Annexin V 阳性细胞的百分比表示，代表三个独立实验的平均值 ± SD。原代 MNC 的结果以 CD34 + /CD38 /Annexin V + 细胞（白血病干细胞）的百分比表示。星号 (*)：与对照相比，p < .05。AML，急性髓细胞白血病；FLT3 ITD，fms 样酪氨酸激酶 3 内部串联重复；FLT3 wt，fms 样酪氨酸激酶 3 野生型；MNC，单核细胞。
2024; 20（5）：1547-1562。 doi：10.7150/ijbs.83040研究论文抑制BRD4的抑制作用抑制ER应激诱导的肾脏缺血性灌注损伤
1。转化免疫学，西班牙Oviedo 33011 Asturias（ISPA）的研究研究所。2。ricors2040（肾脏病），萨鲁德·卡洛斯三世研究所，西班牙马德里28029。3。脂质在人类病理学中，巴利阿里群岛健康研究所（IDISBA），研究部门，大学医院儿子ESP，07120西班牙帕尔马。4。实验性肾脏学研讨会I trasplantoment（Lenit），调查研究所生物组织August pi I Sunyer（Idibaps），西班牙巴塞罗那。5。自噬和代谢实验室，西班牙奥维迪多·阿特里亚斯（ISPA）的研究研究所。6。deNeprología实验室实验，研究Instituto de Respuctionun Health-FundaciónJiménezDíaz，西班牙马德里的Autónomade Madrid大学。7。Serficio deNefrología，中央De Asturias，Oviedo，Asturias，西班牙大学医院。8。肾脏疾病实验室中的细胞生物学，Iis-FundaciónJiménezDíaz，马德里大学，马德里大学28040，西班牙马德里。9。肾脏科，肾脏肾脏，肾脏研究所，肾脏病学院I泌尿科，泌尿外科，巴塞罗那克莱尼奇医院，西班牙巴塞罗那10。基因组分析平台，CIC Biogune-BRTA，德里奥，西班牙。11。Centro deResjuctionciónBiomédicen Red en el el e el e e e e e enfermedadeshepáticas（ciberehd），西班牙马德里，西班牙。