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ASPSCR1-TFE3 调控肺泡软组织肉瘤的血管生成程序
并且肿瘤中超过5个gRNA减少2倍的63个基因座被认为是阳性候选者（图4b，扩展数据图4c和补充表9）。通过Hi-C分析定义拓扑相关域（TAD）（图4c），并选择与每个SE包含在同一TAD中的345个候选靶基因。通过在ASPS-null细胞中下调的表达和功能注释进一步选择了56个候选基因（图4d和补充表10）。对Ccbe1、Pdgfb、Rab27a、Syngr1、Sytl2和Vwf六个候选基因进行了体内验证试验（扩展数据图4d）。验证每个基因有效敲除后（扩展数据图4e），将肿瘤克隆移植到裸鼠体内。尽管体外增殖率相当（扩展数据图 4f），但 Pdgfb、Rab27a、Sytl2 和
肿瘤衍生的小细胞囊泡充当治疗性纳米粒子递送的障碍
纳米颗粒有望用于药物输送应用，并具有多种临床批准的产品。但是，在实体瘤中获得高纳米颗粒的积累仍然具有挑战性。在这里我们表明，肿瘤细胞衍生的小细胞外囊泡（SEV）将纳米颗粒递送到肿瘤，揭示了基于纳米颗粒的肿瘤疗法的另一个障碍。肿瘤细胞在肿瘤微环境中分泌大量的SEV，然后结合进入肿瘤组织的纳米颗粒并将其传递到肝库普弗细胞中以降解。敲低Rab27a是一种控制SEV分泌的基因，可降低SEV水平并改善肿瘤组织中纳米颗粒的积累。与Rab27a在脂质纳米颗粒中共同包裹的抑制肿瘤和炎性蛋白质的信使RNA的治疗功效大大提高。一起，我们的结果表明，肿瘤细胞衍生的SEV是针对纳米颗粒肿瘤递送的防御系统，并且该系统可能是改善基于纳米颗粒的肿瘤疗法的潜在靶标。
卡塔尔原发性和家族性 HLH 的遗传背景
背景：家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症 (FHLH) 是一种遗传性、危及生命的疾病。该病已确定有五种类型，此外还有以 HLH 为典型表现的先天性免疫缺陷综合征。中东地区关于此病的文献非常稀少，只有少数零散报道。方法：我们报告了过去 10 年卡塔尔 28 名被诊断患有原发性和家族性 HLH 的患者的详细人口统计学、临床和基因组数据。对卡塔尔基因组计划 (QGP) 队列中的 14,669 名卡塔尔个体中的 12 种原发性和家族性 HLH 致病基因的有害变异的等位基因频率进行了评估。结果：15 名患者获得了基因诊断，发现穿孔素 1 ( PRF1 )、UNC13D 、LYST 和 RAB27A 基因中有四种新的突变。我们在这 12 个基因中发现了 22,945 个在卡塔尔 GP 中显著富集的低/高/中等/修饰影响变异。我们患者队列中发现的 PRF1 中的 rs1271079313 变异和 RAB27A 中的 rs753966933 变异在卡塔尔 GP 中显著更为普遍，与基因组聚合数据库 (gnomAD) 数据库相比，卡塔尔人群的携带者频率较高。结论：我们在海湾地区建立了第一个原发性和家族性 HLH 登记处，并发现了在卡塔尔人群中频率较高的新型可能致病变异，可用于筛查目的。提高对原发性和家族性 HLH 的认识并在卡塔尔高度近亲繁殖人群中实施筛查活动，可以带来更全面的婚前和产前评估以及更快的诊断。
使用Cell -Profiler
是研究数字，维度，内容和分泌细胞器的定位的最常用和通用的方法之一是共聚焦显微镜分析。然而，可以在细胞中引起的分泌细胞器的数量，大小和形状中存在相当大的异质性。因此，需要分析大量细胞器以进行有效量化。正确评估这些参数需要一种自动，无偏的方法来处理和定量分析显微镜数据。在这里，我们描述了由Cell -Profiler软件运行的两个管道，称为OrganleleProfiler和OrganeLlecontentProfiler。这些管道线用于内皮菌落形成细胞（ECFC）的共聚焦图像，其中包含独特的分泌细胞器，称为Weibel-Palade体（WPB），以及ECFC和ECFC和人类胚胎肾脏293T（HEK293T）细胞的早期内体。结果表明，管道可以量化细胞计数，大小，细胞器计数，细胞器的大小，形状，与细胞和细胞的关系，以及在内皮和HEK293T细胞中与这些物体的距离。此外，使用管道来测量高尔基体破裂后WPB大小的减小，并在ECFC中触发CAMP介导的信号通路后量化WPB的核周聚类。此外，管道能够量化位于细胞器或细胞质中的二级信号，例如小的WPB GTPase RAB27A。使用斐济检查了细胞剖面测量值的有效性。确定，这些管道为多个细胞和细胞器类型的特性提供了强大的，高处理的定量工具。这些管道是免费的，可以在不同的细胞类型或细胞器上易于使用，并且易于编辑。