摘要自身免疫性由于免疫耐受性和自动反应性免疫细胞的激活而发展。大多数常见的自身免疫性疾病是多基因1表明多种信号通路中的失调。相比之下,在单基因的免疫力(IEI)中,这也可能导致自身免疫性,该疾病是由单个遗传缺陷触发的。因此,在IEI中发现的致病突变允许追踪导致人类自身免疫性的分子机制,从特定基因功能的缺陷到患者的临床和免疫学表型。在这里,我们发现了一名IEI患者具有全身性自身免疫性,这是由基因ZC3H12A中的私有纯合蛋白截短突变引起的,导致Regnase-1的缺乏,Regnase-1(一种调节性RNase 2-5)。流式细胞仪,大量T细胞转录组分析和单细胞RNA测序表明表达VCAM-1和IFNγ基因的γδT细胞的扩展。我们表明,Regnase-1直接靶向VCAM1的3 rth和IFNG mRNA的编码序列。这些发现突出了人类中一种新的自身免疫机制,其中regnase-1缺乏会导致VCAM1 + IFNG + T细胞的扩展及其与整合素α4β1-表达B细胞的相互作用,这表明IFN响应基因和激活的上调上调,导致系统自身免疫性。此外,我们表明VCAM1+ T细胞存在于供体的器官中,并在全身性红斑狼疮的患者的血液中扩展,这是一种常见的自身免疫性疾病,其特征是全身自身免疫性。他的父母和他的两个哥哥也很健康。1a和补充图新的单基因自身免疫性疾病患者P1诞生于第一个堂兄的亲密婚姻,患有未知原因的自身免疫性疾病。出生后不久,他出现了严重的水性腹泻,脾肿大,自身免疫性贫血和血小板减少症,所有这些都对皮质类固醇治疗有反应,后来对抗唑啉蛋白治疗反应了自身免疫性肝炎(图。1a)。他患有多种复发性呼吸道感染,最终导致支气管扩张(补充图1B),后来患有由水痘带状疱疹病毒(VZV)引起的脑膜炎。尝试了多次治疗试验,包括霉酚酸盐,利妥昔单抗,西洛氏菌和tocilizumab,但该患者对这些治疗造成了难治性,并最终产生了严重的骨髓纤维纤维化和输血依赖性。患者从HLA匹配的相关兄弟姐妹供体接受造血干细胞移植(HSCT)后(补充图1a),他完全植入了他的疾病临床表现。尽管如此,他还是出现了严重的皮肤移植与宿主疾病,并最终屈服于感染。在他的一生中,患者的血清IgG和IgM升高,但是IgA缺乏以及对蛋白质和多糖疫苗的反应降低(补充表1)。他有多种自身抗体,包括抗六抗细胞,抗肝kidney微粒体,抗平滑肌,抗双束DNA和抗核抗体(补充表1)。此外,我们发现患者的抗IFNα和抗IFNΩ自身抗体升高(图1C)。1b),可能影响了他的IFN介导的抗病毒药反应,解释了VZV脑膜炎和对呼吸道病毒感染的敏感性。血清细胞因子的分析显示,患者的IL-6升高,偶尔会升高IFNγ,而IL-10和TNFα与对照组没有显着差异(补充图外周血单核细胞(PBMC)的流式细胞术分析显示,患者中γδT细胞的扩大,占所有PBMC的21.4%,这些细胞中有96.9%是非Vδ2(图1C;补充表2)。,有54%表达CD8(补充图2a)。此外,患者P1(T细胞的68.3%)的常规CD8+ T细胞也增加了,这些细胞中的大多数具有CD27 – CD45RA+细胞毒性终止分化的效应子记忆(TEMRA)表型(65.3%的CD8+ T细胞;
takuya uehata(日本京都大学)Yamada(日本京都大学)Daisuke Ori(日本京都大学)Alexis Vandenbon(日本京都大学,日本京都大学)Amir Giladi(以色列科学学院)Adam Jelinski(weizmann Instraizhir) (日本京都大学)Hitomi Watanabe(日本京都大学)Kazuhiro Takeuchi(日本京都大学)Kazunori Toratani(日本京托大学,日本京都大学)Takashi Mino(日本京都大学,日本)HISANORI KIRYU(日本)托尔伊大学(University the University of Tokanori kiryu) Tsujimura(日本荷马科医科大学)Tomokatsu Ikawa(日本东京科学大学)kondoh(日本京都大学)Markus Landthaler(MaxDelbrück,德国分子医学中心)阿米特(以色列魏兹曼科学学院)雅amoto(日本京都大学)Masaki Miyazaki(日本京都大学生命与医学科学研究所)Osamu Takeuchi(日本京都大学)
背景CRISPR/CAS9基因编辑以增强T细胞产物细胞thera-therapies(ACT)的抗肿瘤活性(ACT)是一种有前途的方法,用于治疗实体瘤患者。我们开发了一种体内CRISPR^2筛选方法,并询问了顶部双重编辑组合,从而增强了T细胞抗肿瘤功能。我们发现,在T细胞靶标的所有可能的双编辑组合中,Regnase-1和SOCS1的失活导致体内抗肿瘤T细胞效能的最大增强。我们将这些发现应用于发现KSQ-004,这是一种Regnase-1/ SOCS1双重编辑的人CRISPR/ CAS9工程的TIL(ETIL)疗法,目前正在开发用于治疗的使用。我们生成了随机配对的CRISPR指南图书馆(CRISPR2),以先前的单基因免疫CRISPROMICS®屏幕为目标。crispr^2库具有超过1200个基因对的 crispr^2,在相关的合成性肿瘤模型中筛选在原代小鼠OT1和PMEL-TCR-TG-T细胞中。 然后在免疫疗法 - 饮食性B16F10转移性肺肿瘤模型中评估顶部双编辑组合。 在小鼠TIL模型中进一步评估了顶部组合的功效,其中从B16-OVA肿瘤中扩展了从B16-ova肿瘤进行扩展,并在体内进行了设计,并采用转移到肿瘤轴承宿主中以进行有效评估。 在CRISPR^2屏幕中测试的1200+组合的结果,Regnase-1/SOCS1组合在顶级双重编辑中排名,与对照组相比,这种组合增强了T细胞浸润到肿瘤> 3500倍。crispr^2,在相关的合成性肿瘤模型中筛选在原代小鼠OT1和PMEL-TCR-TG-T细胞中。然后在免疫疗法 - 饮食性B16F10转移性肺肿瘤模型中评估顶部双编辑组合。在小鼠TIL模型中进一步评估了顶部组合的功效,其中从B16-OVA肿瘤中扩展了从B16-ova肿瘤进行扩展,并在体内进行了设计,并采用转移到肿瘤轴承宿主中以进行有效评估。在CRISPR^2屏幕中测试的1200+组合的结果,Regnase-1/SOCS1组合在顶级双重编辑中排名,与对照组相比,这种组合增强了T细胞浸润到肿瘤> 3500倍。在检查点治疗难治性B16F10肺转移模型中进行的研究表明,Regnase-1/SOCS1双重编辑的PMEL-TCR-TG-TG-T细胞相对于对照组赋予了显着的SUR-VIAL益处,显着将动物中位数存活从21天延长至53天。进一步,regnase-1+SOCS1编辑的小鼠直到分离并从B16-ova肿瘤扩展并扩展,在将肿瘤重新灌注后完全控制了宿主,这表明该编辑组合通过这种编辑组合恢复了肿瘤经验丰富的蒂尔斯。将这些见解用于治疗用途,我们发现了KSQ-004,一种人类的Regnase-1/SOCS1双编辑CRISPR/CAS9设计的TIL(ETIL)。的方法来制造来自黑色素瘤和NSCLC肿瘤样品的KSQ-004,其依然表现出可靠的膨胀和可行性,可与未经编辑的对照截至,两种焦油的敲除超过90%。重要的是,KSQ-004在自体肿瘤刺激后产生升高的IFNγ,并在体外对肿瘤球体施加了更大的控制。结论我们使用了一种新型的CRISPR^2屏幕方法来识别Regnase-1/SOCS1作为肿瘤微环境中T细胞功能的顶级双编辑组合。,我们将这些发现转化为治疗用途,并发现了KSQ-004(一种设计的双重编辑的ETIL疗法,旨在提高抗肿瘤效力和针对实体瘤的持久性。
结果:在 CRISPR 2 筛选中测试的 1200 多种组合中,Regnase-1/SOCS1 组合位居双编辑组合之首,与对照组相比,该组合增强了 T 细胞向肿瘤的浸润 >3500 倍。在检查点治疗难治性 B16F10 肺转移模型中进行的研究表明,Regnase-1/SOCS1 双编辑的 PMEL-TCR-Tg-T 细胞为对照组带来了显著的生存优势,显著延长了动物的中位生存期,从 21 天延长至 53 天。此外,从 B16-Ova 肿瘤中分离和扩增的 Regnase-1+SOCS1 编辑的小鼠 TIL 在重新输注到宿主体内后对肿瘤产生了完全控制,表明这种编辑组合可以使肿瘤经历的 TIL 恢复活力。为了将这些见解应用于治疗用途,我们发现了 KSQ-004,这是一种人类 Regnase-1/SOCS1 双编辑 CRISPR/Cas9 工程化 TIL (eTIL)。我们开发了从黑色素瘤和 NSCLC 肿瘤样本中制造 KSQ-004 的方法,eTIL 表现出与未编辑对照 TIL 相当的强劲扩增和活力,两个靶标均被敲除 90% 以上。重要的是,KSQ-004 在自体肿瘤刺激下产生了升高的 IFNɣ,并且在体外对肿瘤球体发挥了更大的控制作用。