摘要在胃肠道中,神经rest细胞在神经板边界处指定为PAX7表达。使用单细胞RNA测序与高分辨率原位杂交结合以识别新型的转录调节剂,我们表明染色质重塑剂HMGA1在规格之前高度表达并保持在迁移的鸡神经trest细胞中。暂时控制的CRISPR-CAS9介导的敲除在神经Crest发育中发现了HMGA1的两个不同功能。在神经板边界,HMGA1调节依赖PAX7的神经rest谱系规范。在移民阶段,第二个角色表现出HMGA1损失减少了独立于PAX7的背神经管的颅顶移民。有趣的是,这是通过稳定的ß-catenin挽救的,因此将HMGA1作为规范WNT激活剂。一起,我们的结果表明,HMGA1在神经Crest发育过程中以双峰方式起作用,以调节神经板边界的规范,然后通过规范WNT信号传导从神经管中移民。
简介血管壁是一种复杂的多层组织,其中包含许多细胞群,可协调维持血管稳态并调节疾病状态下的血管重塑。主要动脉的最外层,Tunica Adventitia,由周细胞,成纤维细胞,脂肪细胞,WBC和常驻祖细胞/干细胞组成,均由细胞外基质,血管周围脂肪和Vasa vasorum(1-5)组成。外在重塑发生在慢性血管疾病或急性血管损伤之后,随着外在细胞的增殖,分泌促炎性细胞因子募集循环循环的白细胞,并增加细胞外基质沉积,从而导致慢性血管炎症和慢性血管炎症和僵硬(6,7)。在膜中发现的细胞群体,干细胞抗原-1 +祖细胞(ADVSCA1细胞)已成为兴趣增加的群体,因为这些多能细胞表现出具有特定分化能力的显着异源性基因性,因此对于病理脉管脉冲重塑和血管造成的维修可能很重要(3)。使用平滑肌细胞 - 特异性谱系跟踪和RNA-Seq,我们的组表征了通过原位重编程过程(称为ADVSCA1-SM细胞)来源于成熟平滑肌细胞(SMC)的Advsca1细胞的亚群(8)。与其他
简介血管壁是一种复杂的多层组织,其中包含许多细胞群,可协调维持血管稳态并调节疾病状态下的血管重塑。主要动脉的最外层,Tunica Adventitia,由周细胞,成纤维细胞,脂肪细胞,WBC和常驻祖细胞/干细胞组成,均由细胞外基质,血管周围脂肪和Vasa vasorum(1-5)组成。外在重塑发生在慢性血管疾病或急性血管损伤之后,随着外在细胞的增殖,分泌促炎性细胞因子募集循环循环的白细胞,并增加细胞外基质沉积,从而导致慢性血管炎症和慢性血管炎症和僵硬(6,7)。在膜中发现的细胞群体,干细胞抗原-1 +祖细胞(ADVSCA1细胞)已成为兴趣增加的群体,因为这些多能细胞表现出具有特定分化能力的显着异源性基因性,因此对于病理脉管脉冲重塑和血管造成的维修可能很重要(3)。使用平滑肌细胞 - 特异性谱系跟踪和RNA-Seq,我们的组表征了通过原位重编程过程(称为ADVSCA1-SM细胞)来源于成熟平滑肌细胞(SMC)的Advsca1细胞的亚群(8)。与其他
附有 26 英寸安装挂钩(Remodeler 版本除外)可选 HB49 - 可提供最小 29 英寸到最大 49 英寸的挂钩 有边饰灯具:用于格栅或石膏板天花板,标准为 5/8 英寸 - 最大 2 英寸(SLW 边饰最大为 1 英寸)无边饰灯具:用于石膏板天花板,天花板最大厚度为 5/8 英寸木制品灯具:木制品延长环根据天花板材料的规格和厚度而定。提供与天花板材料齐平的边饰外观。天花板厚度为 1/2 英寸 - 11/16 英寸。有关厚度超过 11/16 英寸的天花板的使用方法,请咨询厂家。不适用于 Remodeler 型号。
理解染色质功能对于不清除欧洲核心中基因组调节的复杂性至关重要。染色质的基本亚基是Nu-Cleosome,它是由包裹在八个组蛋白蛋白的DNA形成的。Berger组的研究重点是研究组蛋白变体和重塑剂的进化论和功能,这是染色质调节的关键成分。在去年,Berger组证明了组蛋白变体与组蛋白的翻译后修饰至关重要,从而塑造了染色质指示转录调控。His-Tone变体H2A.X在维修DNA的机械中起着关键作用。Berger Group在拟南芥中确定了这一途径的两个关键参与者。此外,他们还表征了与调节转座活性的特定类型组蛋白变体的沉积相关的染色质重塑剂。最近该组还表明,在陆地植物的进化过程中,翻译后修饰H3K27me3将其靶标从转座子转换为控制基因沉默的顺式元素。H3K27me3的新功能有可能重塑植物的基因组。
摘要BRG1/BRM相关因子(BAF)复合物是一种染色质重塑,对于维持许多癌症的细胞活力至关重要。这包括急性髓细胞性白血病(AML),其中BAF保持爆炸细胞的茎样转录状态。FHD-286是BAF ATPase亚基BRG1和BRM的双重抑制剂,目前正在复发或难治性AML和骨髓增生综合征中进行研究。先前已经证明,FHD-286在长时间用亚循环剂量处理后在临床前模型中诱导髓样分化标记CD11b的表达。在这里,我们进一步表征了通过RNA-Seq和全基因组CRISPR-CAS9敲除筛选在AML细胞系中低剂量FHD-286引起的分化表型。这些数据集和机械随访研究表明,用FHD-286处理的AML细胞系在功能上可以区分以获得产生超氧化阴离子并进行吞噬作用的能力。我们还发现,FHD-286治疗破坏了mRNA剪接,这可能是由BRG1/BRM抑制引起的AML细胞生长缺陷的原因。这项研究提出了多种机制,通过这些机制,FHD-286能够破坏AML爆炸的茎样转录状态,从而导致分化并最终导致细胞死亡。
胰腺神经内分泌肿瘤(PNET)是第二常见的胰腺肿瘤。然而,除了涉及多个内分泌肿瘤1(MEN1),ATRX染色质重塑剂和死亡结构域相关蛋白基因的突变之外,对它们的肿瘤驱动因素的了解鲜为人知,这些突变在约40%的散发性PNET中发现。PNET的突变负担低,因此表明其他因素可能有助于其发展,包括表观遗传调节剂。这样的表观遗传过程,DNA甲基化,通过5'methylcytosine(5MC)的沉默基因转录,这通常是由基因启动子周围富含CPG的富含CPG的DNA甲基转移酶促进的。然而,5'Hydroxym甲基胞嘧啶是胞质脱甲基化过程中的第一个表观遗传标记,并且反对5MC的功能与基因转录相关,尽管其意义尚不清楚,因为它与常规的Bisulfite转换技术相关,因为它与5MC没有区别。基于阵列的技术的进步促进了PNET甲基甲基组的研究,并使PNETs通过甲基化体特征聚集,这有助于预后和发现新的异常调节基因,这些基因有助于肿瘤。本综述将讨论DNA甲基化的生物学,其在PNET发育中的作用以及对表观基因组靶向疗法的预后和发现的影响。
具有CRISPR-CAS9的基因组工程中的长期障碍一直无法衡量Cas9编辑结果及其在单细胞分辨率下的功能效应。在这里,我们提出了Superb-Seq,这是一种利用T7原位转录和单细胞RNA测序的新技术,以共同测量靶向靶标Cas9编辑及其对基因表达的影响。我们在10,000 k562细胞上进行了高级seq,靶向了四个用七个引导RNA的染色质重塑基因。Superb-Seq在所有七个目标站点和其他36个非目标位点上确定了11,891个编辑事件。尽管选择了七个指南的高特异性,但其中有六个导致靶向脱靶编辑,频率从0.03%到18.6%的细胞范围不等。在USP9X的第一个内含子中,明显的脱靶编辑破坏了该基因的表达和超过150个下游基因。总而言之,由于罕见和常见的编辑事件的结合,CAS9非目标是普遍存在的,主要发生在靶向基因的内含子内,并且可以对基因表达产生广泛的影响。Superb-Seq使用现成的套件,标准设备,并且不需要病毒,这将使全基因组CRISPR屏幕能够在不同的细胞类型中以及与临床相关的指南的功能表征。
胰腺神经内分泌肿瘤 (PNET) 是第二大最常见的胰腺肿瘤。然而,除了涉及多发性内分泌肿瘤 1 (MEN1)、ATRX 染色质重塑基因和死亡结构域相关蛋白基因的突变(约 40% 的散发性 PNET 中存在这些基因突变)之外,人们对其致瘤驱动因素知之甚少。PNET 的突变负担较低,因此表明其他因素可能促使其发展,包括表观遗传调节因子。DNA 甲基化是一种这样的表观遗传过程,它通过 5'甲基胞嘧啶 (5mC) 沉默基因转录,这通常由基因启动子周围富含 CpG 区域的 DNA 甲基转移酶促进。然而,5'羟甲基胞嘧啶是胞嘧啶去甲基化过程中的第一个表观遗传标记,与 5mC 的功能相反,与基因转录有关,尽管其重要性尚不清楚,因为当仅使用常规亚硫酸氢盐转化技术时,它与 5mC 难以区分。基于阵列的技术的进步促进了 PNET 甲基化组的研究,并使 PNET 能够通过甲基化组特征进行聚类,这有助于预测和发现导致肿瘤发生的新的异常调控基因。本综述将讨论 DNA 甲基化的生物学、其在 PNET 发展中的作用以及对预测和发现表观基因组靶向疗法的影响。
具有CRISPR-CAS9的基因组工程中的长期障碍一直无法衡量Cas9编辑结果及其在单细胞分辨率下的功能效应。在这里,我们提出了Superb-Seq,这是一种利用T7原位转录和单细胞RNA测序的新技术,以共同测量靶向靶标Cas9编辑及其对基因表达的影响。我们在10,000 k562细胞上进行了高级seq,靶向了四个用七个引导RNA的染色质重塑基因。Superb-Seq在所有七个目标站点和其他36个非目标位点上确定了11,891个编辑事件。尽管选择了七个指南的高特异性,但其中有六个导致靶向脱靶编辑,频率从0.03%到18.6%的细胞范围不等。在USP9X的第一个内含子中,明显的脱靶编辑破坏了该基因的表达和超过150个下游基因。总而言之,由于罕见和常见的编辑事件的结合,CAS9非目标是普遍存在的,主要发生在靶向基因的内含子内,并且可以对基因表达产生广泛的影响。Superb-Seq使用现成的套件,标准设备,并且不需要病毒,这将使全基因组CRISPR屏幕能够在不同的细胞类型中以及与临床相关的指南的功能表征。