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罕见的编码变化提供了对自闭症的遗传结构和表型环境的见解
✉材料的信件和请求应向约瑟夫·D·布克斯鲍姆（Joseph D. Buxbaum），马克·J·戴利（Mark J.joseph.buxbaum@mssm.edu; mjdaly@atgu.mgh.harvard.edu; devlinbj@upmc.edu; roeder@andrew.cmu.edu; stephan.sanders@ucsf.edu; mtalkowski@mgh.harvard.edu。*作者及其隶属关系列表出现在本文的末尾。作者贡献M.E.T.，S.J.S，K.R.，B.D.，M.J.D，J.D.B。和S.B.G.设计了研究。M.E.T.，M.J.D.，J.D.B.，S.D.R.，S.B.G.，S.D. A.R.，F.T.，E.T.，G.C.，M.C.Y.C.，C.F.，E.G.，A.C.G. J.S.S.，E.H.C。和C.B.贡献了样本和生成的数据。M.E.T.，S.J.S.，M.J.D.，J.D.B.，S.D.R.，L.S.，B.M.，C.R.S. 和B.C. 协调的项目管理。 M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，D.J.C.，E.B.，A.N.S. S.D.，R.L.C.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 开发了方法论并进行了分析。 M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，J.D.B.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 写了这篇论文。M.E.T.，S.J.S.，M.J.D.，J.D.B.，S.D.R.，L.S.，B.M.，C.R.S.和B.C.协调的项目管理。M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，D.J.C.，E.B.，A.N.S. S.D.，R.L.C.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 开发了方法论并进行了分析。 M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，J.D.B.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 写了这篇论文。M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，D.J.C.，E.B.，A.N.S.S.D.，R.L.C.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 开发了方法论并进行了分析。 M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，J.D.B.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 写了这篇论文。S.D.，R.L.C.，H.B.，M.P.，F.K.S。和J.M.F.开发了方法论并进行了分析。M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，J.D.B.，H.B.，M.P.，F.K.S。 和J.M.F. 写了这篇论文。M.E.T.，S.J.S.，K.R.，B.D.，M.J.D.，J.D.B.，H.B.，M.P.，F.K.S。和J.M.F.写了这篇论文。
标题：跨疗法，基因的细胞类型地图集，同工型和剪接调节，在发展中的人脑作者中：辛迪·韦恩1,2,3，mi
Title: Cross-ancestry, cell-type-informed atlas of gene, isoform, and splicing regulation in the developing human brain Authors: Cindy Wen 1,2,3 , Michael Margolis 2,3 , Rujia Dai 4 , Pan Zhang 2,3 , Pawel F. Przytycki 5 , Daniel D. Vo 2,3,6,7 , Arjun Bhattacharya 8,9 , Nana Matoba 10,11，Chuan Jiao 4，Minsoo Kim 2,3，Ellen Tsai 2,3，Celine Hoh 2,3，NilAygün11111111，Rebecca L. Walker 1,2,3，Christos Chistos Chatzinakos，Chatzinakos 12,13,14，Declan Clarke 15，Declan Clarke 15，Henry Pratt Pratt 17，Marks Conscyend A. 15,18,19,20 , Nikolaos P. Daskalakis 12,13,14 , Zhiping Weng 16 , Andrew E. Jaffe 21,22,23,24,25,26,27 , Joel E. Kleinman 21,22 , Thomas M. Hyde 21,22,28 , Daniel R. Weinberger 21,22,23,24,28 , Nicholas J. Bray 29，Nenad Sestan 30,31，Daniel H. Geschwind 3,32,33，Kathryn Roeder 34,35，Alexander Gusev 36,37,38,39，Bogdan Pasaniuc，Bogdan Pasaniuc 1,3,8,33,40Love 10,41，Katherine S. Pollard 5,42,43，Chunyu Liu 4,44*，Michael J. Gandal 1,2,3,6,7*
13 干燥山羊疫苗于……被引入埃及。
1945 年，一种干燥山羊疫苗被引入埃及，作为对抗牛瘟再次入侵的大规模免疫方法，六个月后疫情被根除。山羊适应疫苗廉价有效，诱导的免疫力持久。然而，它们仍然存在低温保存的问题，即使通过干燥和真空储存提高了保存质量。在日本和韩国，兔子被用来适应病毒，用于对极易感染的牛品种进行血清同步疫苗接种（Nakamura 等人，1943 年）。经过多次传代，它仍然偶尔导致死亡，而在印度和蒙古牛中只发生轻微反应。1941 年，传代病毒在蒙古安全有效地使用，无需血清支持（Isogai，1944 年）。随后，兔化疫苗在非洲和亚洲广泛使用。 20 世纪 40 年代初，该疫苗在华北地区广泛使用，1945 年联合国善后救济总署在中国畜牧业研究局进一步研究，研制出一种疫苗（中村三号），该疫苗在牛和水牛身上只引起轻微反应。此后，随着和平的恢复，粮农组织将这种疫苗传播到埃及、泰国、印度、肯尼亚、巴基斯坦和埃塞俄比亚等许多国家（Hambidge 1955）。大约从 1950 年开始，哈尔滨兽医研究所的中国工作人员开始研制一种更令人满意的减毒活疫苗，因为中村三号疫苗难以按需要量生产。在兔、山羊和绵羊身上进行了数百次传代后，最终从淋巴结和脾脏中生产出一种疫苗，该疫苗对所有物种和品种都安全有效，甚至对牦牛和朝鲜牛也是如此。在牦牛身上，疫苗免疫持续时间经测试超过五年。这种疫苗被用于中国最后的根除行动（Roeder 等人，2006 年）。细胞培养技术的出现使工作人员能够将现有的减毒实验室牛瘟菌株改造成这种新基质，但直到 Walter Plowright 在牛肾细胞中培养出致命的 Kabete O 病毒 70 代后才取得突破；这种组织培养牛瘟疫苗 (TCRV) 既不产生病变也不产生发烧（Plowright，1962 年），并且对所有品种、年龄和性别的牛都是安全且具有免疫原性的。在日本，兔化/禽化 Nakamura III 病毒在 Vero 细胞中生长，以生产适用于日本牛的战略储备（Sonoda，1983 年）。同样，中国哈尔滨研究所目前正在羔羊肾细胞培养中生产中国兔化/山羊化/绵羊化疫苗的战略储备。 1961 年在喀布尔分离出一种致命的牛瘟病毒株，该病毒株在 37 次牛传代中得以保存，随后在哈萨克斯坦农业科学研究所的原代小牛肾细胞中进行了 70 次减毒，并于 1978 年作为疫苗推出。该疫苗在苏联与邻国之间的边境免疫带中常规使用，并在必要时用于抵御牛瘟的传入。这种疫苗被称为 K37/70，在评估期间经过了广泛的测试，随后被广泛使用，被认为对牛和牦牛是安全的。不幸的是，如前所述，在最近接种过这种疫苗的地区发生了临床牛瘟疫情。弗拉基米尔全俄动物健康研究所的科学家对 F 基因核苷酸序列（碱基 840 至 1161）进行了比较，结果表明 K37/70 病毒和喀布尔病毒只有一个碱基不同。此外，疫苗病毒和野生病毒几乎完全相同，这表明两种病毒之间存在独特的关系（Roeder 等人，2006 年），并且 K37/70 能够恢复毒力并多次重新获得在牛群中传播的能力。因此，似乎可以非常迅速地恢复毒力，而不需要积累大量的点突变。20 世纪 90 年代，在肯尼亚和坦桑尼亚，一种具有 Kabete O 基因特征的病毒似乎从出现牛瘟临床症状的牛身上分离出来。这可以表明 Plowright TCRV 具有类似的恢复毒力的潜力。可以说，TCRV 的唯一缺点是其耐热性。为了实现独立于冷链的配送系统，Mariner 等人（1990 年）通过修改干燥周期和稳定剂开发了一种更耐热的 TCRV 变体。按照新方法制成的疫苗通常被称为 Thermovax，只要避免阳光和过热，就可以在热带地区环境温度下在野外使用长达四周，无需冷链支持。恢复毒力并多次恢复在牛群中传播的能力。因此，似乎毒力可以非常迅速地恢复，而不需要积累大量的点突变。20 世纪 90 年代，肯尼亚和坦桑尼亚从出现牛瘟临床症状的牛身上分离出一种具有 Kabete O 基因特征的病毒。这可以表明 Plowright TCRV 具有类似的恢复毒力的潜力。可以说，TCRV 的唯一缺点是它的耐热性。为了实现独立于冷链的分销系统，Mariner 等人 (1990) 通过修改干燥周期和稳定剂开发了一种更耐热的 TCRV 变体。根据新方法制造的疫苗通常称为 Thermovax，可以在热带地区环境温度下在野外使用长达四周，无需冷链支持，只要避免阳光和过热即可。这恢复毒力并多次恢复在牛群中传播的能力。因此，似乎毒力可以非常迅速地恢复，而不需要积累大量的点突变。20 世纪 90 年代，肯尼亚和坦桑尼亚从出现牛瘟临床症状的牛身上分离出一种具有 Kabete O 基因特征的病毒。这可以表明 Plowright TCRV 具有类似的恢复毒力的潜力。可以说，TCRV 的唯一缺点是它的耐热性。为了实现独立于冷链的分销系统，Mariner 等人 (1990) 通过修改干燥周期和稳定剂开发了一种更耐热的 TCRV 变体。根据新方法制造的疫苗通常称为 Thermovax，可以在热带地区环境温度下在野外使用长达四周，无需冷链支持，只要避免阳光和过热即可。这
亚历山大·霍夫曼（Alexander Hoffmann） - 信号系统实验室 - UCLA
ahoffmann@ucla.edu叙述我是UCLA的微生物学和免疫学教授，信号系统实验室的PI，自2013年以来，自2013年以来，定量和计算生物科学研究所（QC Bio）（QC Bio）主任，该研究所的教育和培训跨越了50多个教育和培训，该计划是该教育和培训的培训，并培训了学生，并毕业于研究生，并毕业于研究生。我拥有物理学和动物学（剑桥大学）的本科学位，并归功于我的博士学位培训归功于Robert Roeder（Rockefeller University）在生物化学和分子生物学领域，以及我对免疫信号和系统免疫学的David Baltimore（MIT和Caltech）的博士后培训。我开发了计算生物学专业知识作为博士后，以及我在加州大学，UCSD和UCLA的许多计算学员和同事。我的实验室研究重点是控制先天和适应性免疫反应的分子和细胞机制。一个中心主题是这些网络的动力学决定了功能特异性。i首先阐明了“时间代码”的概念，该概念在信号传导字段中产生了广泛的影响。我的实验室揭示了如何通过大量反馈和其他调节基序“编码”免疫反应信号传导动力学。我们已经表明，在疾病环境中，动力学发生了变化，并且可能是针对药物的。我们已经阐明了如何通过基因调节网络解码信号动力学，以控制刺激特异性基因的表达，细胞命运决策，从而控制了免疫细胞种群动力学。目前，我指挥NIH-和NSF资助的基因组学（B.I.G.）我们的系统生物学研究正在产生多功能，上下文依赖性巨噬细胞和产生抗体库的B细胞的预测细胞模型。我旨在推进跨学科研究和教育，以利用技术，计算和定量科学的机会。到目前为止，我已经在几个层面的生物科学中追求了这一目标：（i）通过在实验室中开发系统生物学方法，重点关注控制免疫的信号和基因调节网络，（II）通过通过UCSD的生物学家研究所（2009年）和Sanivo Biositios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biolosios for Systems Biogios和2010年，以及2010年，以及（2010年），以及促进系统生物学，以及（QCB）在UCLA（2014）涉及广泛的教师招聘，空间翻新，中心和计划赠款以及教育计划，例如在UCLA（III）的多轨计算生物学专业和次要的教育计划，通过建立和/或改造UCSD的研究生培训，例如UCSD的生物信息和系统生物学（2009年），诸如UCSD加州大学洛杉矶分校的生物信息学研究生计划（2014年）和生物医学大数据培训计划（2015年）。我致力于促进作为导师的多样性，公平和包容性的范围，并为外展活动促进，以及在各种行政能力中，例如部门多样性委员会主席（2009- 2012年），学术参议院多样性与公平委员会（2005-2011）以及校长的多元化委员会（2011年 - 2011年学生）（2011年至2011年至2011年），该委员会（2005- 2011年）对危机的反应。关于反种族主义工作队（2021）我共同撰写了用于机构变革的蓝图，为VC研究提供了建议，并制定了教师评估标准。夏季本科研究计划，将申请人池多样化为生物信息学，基因组学，系统生物学的研究生计划。
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