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AlphaFold3了解了什么是关于抗体和纳米型对接的，什么尚未解决？
适体是单链寡核苷酸，它们结合具有高亲和力和特异性的分子靶标。但是，他们的发现和进化仍被限制在常规的SELEX方法上。在这里，我们提出了一种适体结合语言（可易于使用的）模型，该模型通过将预处理的蛋白质和核酸序列编码与跨注意结构相结合，以捕获适体 - 蛋白结合的决定因素，从而实现跨不同蛋白质靶标的结合相互作用的可靠预测。该模型采用具有多头跨意义机制的基于变压器的结构，优化了序列特定特征和位置嵌入，以学习适体及其蛋白质靶标之间的复杂结合模式，同时维持跨不同适应性库的序列长度多样性。我们跨不同基准测试的广泛评估表明，在概括实验结合曲线方面的现有方法相对于现有方法的优势。可易于观察的蛋白质和产生的适体表现出强烈/有利的概括性。在现实世界中，可易于识别的是几种经过实验验证的CD117 ssDNA Apatamers先前被传统SELEX遗漏的，并产生了一种新型的SSDNA Apatamer，该Aptna Aptamer与APP62与人类CD4共享具有可比的结合曲线。这些结果展示了可捕获捕获适体蛋白结合的分子相互作用的能力。
开发具有扩散的SELEX模拟器
背景：通过指数富集（SELEX）对配体的系统演变是一种发现具有高亲和力和特异性的新型配体的强大方法。但是，实验过程是耗时的，资源密集的，并且涉及许多可以显着影响结果的参数。本论文旨在使用扩散模型开发一个内部的SELEX模拟器，这些模型是一类生成模型，通过一系列通过一系列降噪步骤迭代精炼信号来学会降解数据。通过利用扩散模型的功能，我们可以简化配体发现并优化实验条件。
针对眼表面和脂质体药物递送表面的适体的角膜 - 塞莱克斯
抽象的角膜是注射药物的主要障碍，这导致局部眼部治疗的生物幻想低和效力不佳。在这项工作中，我们首先使用猪角膜上的纸巾选择角膜结合适体。顶部两个丰富的适体（Cornea-S1和Cornea-S2）可能与猪角膜结合，其K D值与人角膜上皮细胞（HCEC）分别为361和174 n。适体官能化的脂质体载有环孢菌素A（CSA）作为干眼疾病的治疗方法。由于多价结合，角膜-S1或角膜-S2官能化的脂质体分别降低至1.2和15.1 n。在HCEC中，角膜-S1或Cornea-S2在15分钟内增强了脂质体的摄取，并将保留率延长至24小时。适体CSA脂质体获得了相似的抗炎和紧密连接调节效应，CSA的CSA比免费药物少十倍。在兔干眼病模型中，与商业CSA眼滴相比，Cornea-S1 CSA脂质体在维持角膜完整性和撕裂破裂时间方面表现出等效性，同时使用较低的CSA剂量。从角膜 - 塞莱克斯获得的适体可以用作眼药递送的一般配体，这表明有希望治疗各种眼部疾病甚至其他疾病的途径。
SELEX的适体具有SARS-COV-2 的诊断和进入抑制剂治疗潜力
分析使我们能够选择一个病毒寡肽序列，其侧面的可变区域（VR）作为合适的目标（图。1a）用于使用SELEX隔离和识别适体（如图1b）。在筛选期间，