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蛋白核酸(NA)相互作用是控制基因调节的关键。在理解这些相互作用的目标上是一个强大的动力,其目的是设计这些相互作用以解决生物学问题。量化蛋白质核酸的当前方法主要是实验性的,需要大量时间和金钱。为了减轻这种情况,最近已应用深度学习方法来预测蛋白质-DNA接触。尽管很有希望,但这些方法在计算上是昂贵的,并且在准确性上面临挑战。为了应对这些挑战,我们构成了SEQ2-Contact,这是一种预测单核苷酸(DNA)和单个氨基酸(蛋白质)水平的蛋白质NA结合的新方法。seq2Contact建立在蛋白质和DNA粉底模型上,以获得核苷酸和氨基酸特异性嵌入,然后引入一个交叉意见模块以获得结合接触图。我们采用一种基于序列相似的聚类方法来拆分火车测试数据,并从经验上说明Seq2-Contact可以实现状态的性能,以使现有基本线对蛋白质-DNA结合预测的预测近20%(F1得分)。我们的方法在计算上更有效,记忆成本少80%,推理时间少90%以上。代码可在https://github.com/dhruvarajwade/seq2contact上找到。

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