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中心诊断测试准确性研究：STARD-AI...
摘要 引言 诊断准确性研究报告标准 (STARD) 的制定是为了提高诊断测试准确性研究报告的完整性和透明度。然而，其当前形式 STARD 2015 并未解决以人工智能 (AI) 为中心的干预措施所提出的问题和挑战。因此，我们提出了一个针对 AI 的 STARD 清单版本 (STARD-AI)，该版本侧重于报告 AI 诊断测试准确性研究。本文介绍了开发 STARD-AI 的方法。 方法与分析 STARD-AI 清单的开发可分为六个阶段。 (1) 已进入项目组织阶段，在此期间成立了项目组和指导委员会； (2) 在文献综述、患者和公众参与和参与活动以及国际专家的在线范围界定调查之后，项目生成过程已经完成； (3) 三轮修改后的德尔菲共识方法正在进行中，最终将在专家的电话会议共识会议中结束； (4) 随后，项目组将起草初步的 STARD-AI 清单和随附文件； (5) 将在专家用户中开展试点，以确定不清楚或缺失的项目。这一过程包括调查和半结构化访谈，将有助于编写解释和阐述文件； (6) 在完成手稿后，该小组将努力制定有组织的传播和实施战略，以最大限度地提高最终用户的采用率。 伦理与传播 伦敦帝国理工学院联合研究合规办公室已授予伦理批准（编号：19IC5679）。传播策略将针对五组利益相关者：（1）学术界、（2）政策、（3）指南和法规、（4）行业和（5）公众和非特定
中心诊断测试准确性研究：STARD-AI 协议
摘要 引言 诊断准确性研究报告标准 (STARD) 的制定是为了提高诊断测试准确性研究报告的完整性和透明度。然而，其当前形式 STARD 2015 并未解决以人工智能 (AI) 为中心的干预措施所提出的问题和挑战。因此，我们提出了一个针对 AI 的 STARD 清单版本 (STARD-AI)，该版本侧重于报告 AI 诊断测试准确性研究。本文介绍了开发 STARD-AI 的方法。 方法与分析 STARD-AI 清单的开发可分为六个阶段。 (1) 已进入项目组织阶段，在此期间成立了项目组和指导委员会； (2) 在文献综述、患者和公众参与和参与活动以及国际专家的在线范围界定调查之后，项目生成过程已经完成； (3) 三轮修改后的德尔菲共识方法正在进行中，最终将在专家的电话会议共识会议中结束； (4) 随后，项目组将起草初步的 STARD-AI 清单和随附文件； (5) 将在专家用户中开展试点，以确定不清楚或缺失的项目。这一过程包括调查和半结构化访谈，将有助于编写解释和阐述文件； (6) 在完成手稿后，该小组将努力制定有组织的传播和实施战略，以最大限度地提高最终用户的采用率。 伦理与传播 伦敦帝国理工学院联合研究合规办公室已授予伦理批准（编号：19IC5679）。传播策略将针对五组利益相关者：（1）学术界、（2）政策、（3）指南和法规、（4）行业和（5）公众和非特定
STARD10 基因座的染色质 3D 相互作用分析揭示 FCHSD2 是胰岛素分泌的调节剂
Ming Hu,1 In ^ es Cebola,2 Gaelle Carrat,1 Shuying Jiang,1 Sameena Nawaz,3 Amna Khamis,4 Mickae¨ l Canouil,4 Philippe Froguel,4 Anke Schulte,5 Michele Solimena,6 Mark Ibberson,7 Piero Marchetti,8 Fabian L. Cardenas-Diaz,9,10 Paul J. Gadue,9,10 Benoit Hastoy,3 Leonardo Almeida-Souza,11 Harvey McMahon,12 和 Guy A. Rutter 1,13,14,* 1 英国伦敦帝国理工学院医学系细胞生物学和功能基因组学科，汉默史密斯医院，杜凯恩路，伦敦 W12 0NN，英国 2 英国伦敦帝国理工学院代谢、消化和生殖系遗传学和基因组学科，汉默史密斯医院，杜凯恩路，伦敦 W12 0NN，英国英国伦敦 Cane Road W12 0NN 3 牛津大学糖尿病内分泌与代谢中心，牛津大学丘吉尔医院，牛津海丁顿 OX3 7LE，英国 4 里尔大学，法国国立科学研究院，里尔 CHU，里尔巴斯德研究所，UMR 8199 - EGID，59000 里尔，法国 5 赛诺菲-安万特德国有限公司，65926 法兰克福，德国 6 德累斯顿工业大学医学院慕尼黑亥姆霍兹中心保罗兰格汉斯研究所，01307 德累斯顿，德国 7 Vital-IT 集团，SIB 瑞士生物信息学研究所，1015 洛桑，瑞士 8 比萨大学内分泌与代谢系，56126 比萨，意大利 9 宾夕法尼亚大学病理学与实验室医学系，费城，宾夕法尼亚州，美国10 美国宾夕法尼亚州费城费城儿童医院细胞与分子治疗中心 11 芬兰赫尔辛基赫尔辛基大学 HiLIFE 生物技术研究所和生物与环境科学学院 12 英国剑桥弗朗西斯克里克大道 MRC 分子生物学实验室 CB2 0QH 13 新加坡南洋理工大学李光前医学院 14 主要联系人 *通信地址：g.rutter@imperial.ac.uk https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.108703
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英国首席医疗官克里斯·惠蒂 (Chris Whitty) 也表示：“如果它们非常准确，我们将以最快的方式发布它们。如果它们不准确，我们将不会发布任何一个。”2 考虑到检测的需要，3 最终目标是快速、准确和廉价的检测。凭借科学创新，我们将及时实现这一目标。但“最好”正成为“好”的敌人。与此同时，可避免的感染正在增加。COVID-19 的“黄金标准” RT-PCR 检测高度准确且可重复，但成本高昂（每个检测试剂盒 125 美元，建立一个处理实验室需超过 15,000 美元）且速度慢（处理时间为 4-6 小时，包括运输在内需要 2-4 天的周转时间）4 。另一个极端是，据报道，孟加拉国的一家实验室开发了一种售价 3 美元的快速检测试剂盒，可在 15 分钟内给出结果（参考文献 4 ）。但这种即时检测的准确性值得怀疑。聪明的策略可以帮助打破成本和质量之间的这种权衡。首先，考虑两个快速、廉价且不准确的测试，每个测试都由不同的实验室开发，并且基于对
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致编辑——截至 2020 年 4 月 10 日，SARS-CoV-2 大流行已造成 160 多万确诊病例和 95,000 多例确诊死亡（参考文献 1）。尽管目前尚无批准用于预防或治疗 SARS-CoV-2 感染的药物 2，但最近的一份报告表明，羟氯喹和阿奇霉素 (HY/ AZ) 的组合可能对感染患者的临床结果和病毒载量产生有利影响 3 ；这导致世界各地的临床医生大量采用该方案。然而，这两种药物都被独立证明会增加其他人群发生 QT 间期延长、药物引起的尖端扭转型室性心动过速（一种多形性室性心动过速）和药物引起的心源性猝死的风险 4 – 6。在我们中心，患有呼吸道综合征 COVID-19 的患者因下呼吸道疾病入院，其特征包括咳嗽不消退、X 光检查发现胸部浸润和持续发烧，无论是否伴有血氧饱和度降低，均接受 HY/AZ 治疗。我们查看了图表，并在连续 84 名接受该方案的患者中跟踪了校正的 QT (QTc) 间期。HY 和 AZ 口服给药 5 天。第一天 HY 的剂量为每天两次 400 毫克，然后每天两次 200 毫克。AZ 的剂量为每天 500 毫克。HY/AZ 暴露后心电图 (ECG) 随访的平均时间为 4.3 ± 1.7 天。我们观察到 QTc 从基线平均值 435 ± 24 毫秒（平均值 ± 标准差）延长至最大平均值 463 ± 32 毫秒（P < 0.001（单样本 t 检验）），发生在治疗的第 3.6 ± 1.6 天（图 1）。在其中 9 名（11%）患者中，QTc 严重延长至 > 500 毫秒，这是恶性心律失常和心源性猝死高风险的已知标志 7 。在这个高风险组中，QTc 从基线平均值增加
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致编辑 — COVID-19 疫情凸显了收集和处理冠状病毒 SARS-CoV-2 状态不明的人类生物样本的风险，无论是出于诊断、治疗还是研究目的。在疫情期间，继续收集并存储在生物库中的癌症患者生物样本很可能感染了 SARS-CoV-2。除尿液外，所有类型的生物样本（组织、生物流体和拭子）和器官都可能受到影响 1 – 6 。加热至 56 °C (133 °F) 7 的福尔马林固定石蜡包埋样本可能会灭活 SARS-CoV-2。然而，由于 SARS-CoV-2 可以在各种类型的表面上存活，因此尚不清楚这是否也适用于含有福尔马林固定、石蜡包埋样本的盒式磁带 8 。出于这个原因，并且由于 SARS-CoV-2 具有高度传染性，必须准备、储存、处理和运输人体样本，以确保接触生物样本的人不仅熟悉处理潜在传染性液体或组织样本的适当安全程序，而且有能力并愿意实施这些程序。
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同样，如果两个检测结果独立，则出现两个假阴性结果的可能性会降至 9%。含义很明显：即使是不准确的检测也能告诉我们一些信息。或者，引用世界卫生组织的话：“检测，再检测，再检测”。如果有一个实时更新的数据库，记录世界各地实验室的即时检测，这一策略的使用将变得更加容易。该数据库可由世界卫生组织等国际组织建立，其中将列出实验室和检测名称、检测检测到的抗体（例如 IgG、IgN 或两者 7 ）、检测方法（例如横向流动免疫测定）及其准确性和可重复性、周转时间、检测试剂盒成本和样品处理成本。有了这些信息，政府和国际组织就可以为科学家提供建议，告诉他们哪种廉价检测组合最适合特定国家。第三，考虑一种快速廉价的测试，假阳性率为 30%，为简单起见，假阴性结果为零。首先，可以用这种测试测试许多人，然后用高精度测试测试阳性的子集。这节省了稀缺但准确的测试试剂盒的使用，同时允许比使用少数准确测试试剂盒进行更广泛的测试。简而言之：“测试、分类、重新测试”。最后，如果获得的样本可以“支持”多次测试，那么聪明的策略可以使昂贵的 RT-PCR 测试更便宜。一些德国医院正在使用从十个医院收集的样本进行“区块测试”。
FCN 和 FCJ 自主控制器明星产品
我们开发了两种型号的自主控制器，作为 STARDOM 网络制造解决方案的核心：FCN（现场控制节点的缩写）是一种具有出色可扩展性的模块化控制器，而 FCJ（现场控制连接点的缩写）是一种专为分布式现场安装而设计的一体式控制器。两种控制器都采用了“开放”和标准化技术，并具有实现符合国际电工委员会 IEC61131-3 标准的控制逻辑的功能以及基于 Web 的通信功能，例如自主电子邮件传输和与网页通信，所有这些都包含在紧凑而坚固的机身中。这些功能实现了最新网络技术的全面实用、稳定运行的高可靠性架构以及提高工程效率以及灵活应对系统变化的功能。