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微生物学年度回顾 抗真菌药物靶标识别和验证的基因组方法
过去几十年来，耐药性真菌感染激增，对人类健康构成了严重威胁。虽然可用于治疗全身性感染的药物有限，但科学的进步为发现新型抗真菌药物带来了新的希望。利用酿酒酵母进行化学基因组检测的开发为识别活细胞中分子的作用机制提供了强有力的方法。分子生物学技术的进步使得人们能够在真菌病原体（包括白色念珠菌和新型隐球菌）中开发互补检测方法。这些方法能够识别候选药物的靶基因以及参与缓冲药物靶向途径的基因。在这里，我们研究酵母化学基因组分析，并强调如何利用这些资源来预测化合物的作用机制，研究不同真菌病原体的毒力属性，并加强抗真菌管道。
基于可重编程的配体结合特异性的基于PYR1的矫形CID模块
植物使用化学诱导的二聚化（CID）模块（包括受体pyr1和HAB1）感知脱落酸（ABA），这是由配体激活的pyr1抑制的磷酸酶。此系统是唯一的，因为可以重新编程配体识别的相对容易。为了扩展Pyr1系统，我们设计了一个正交的“*”模块，该模块携带了二聚体界面盐桥； X射线晶体学，生化和体内分析证实了其正交性。我们使用此模块创建了Pyr1* mandi /hab1*和pyr1* azin /hab1*，它们对其激活的配体曼陀果实和偶氮甲基具有纳摩尔敏感性。在拟南芥和酿酒酵母中进行的实验证明了使用活物生物传感器和构建多输入/输出遗传电路的抗抑郁剂污染物的敏感检测。我们的新模块启用了用于植物和真核合成生物学的可编码的多渠道CID系统，可以增强新的基于植物和微生物的感应方式。
过程参数，保护剂和载体材料对片剂的流动性床颗粒过程中酵母细胞存活的影响
摘要：生命微生物的给药是特别感兴趣的，就益生菌的微生物提供了对患者的健康益处的益生菌微生物。有效剂型需要保留微生物活力，直到给药为止。可以通过干燥来提高存储稳定性，并且由于其易于给药和良好的患者依从性，片剂是一种特别有吸引力的最终固体剂型。在这项研究中，研究了通过流体床喷雾剂干燥酿酒酵母的酿酒酵母，因为益生菌的糖果疗法是多种多样的。流化的床颗粒可以比一方面的冻干更快地干燥，另一方面比喷雾干燥更高，这是两种主要使用的微生物生命干燥的技术。酵母细胞悬浮液喷涂到普通片剂赋形剂的载体颗粒上，即磷酸二氨基二硫酸二酸酯（DCP），乳糖（LAC）和微晶纤维素（MCC）。测试了不同的保护剂，例如单，二糖和多糖，但也测试了脱脂奶粉和一只醛醇；从其他干燥技术中知道，它们本身或化学相似的分子可以稳定生物结构，例如细胞膜，从而提高脱水过程中的生存。随着海藻糖和脱脂奶粉的合并使用，生存率是使用保护添加剂的300倍。除了这些配方方面，还考虑了过程参数（例如入口温度和喷雾速率）的影响。颗粒产物的粒度分布，水分含量和酵母细胞的生存能力进行了表征。已经表明，微生物的热应力尤其重要，例如，可以通过降低入口温度或增加喷雾速率来减少。但是，诸如细胞浓度之类的制剂参数也影响了生存。结果用于指定在流体化床颗粒过程中微生物存活的影响因素，并得出它们的联系。颗粒，并评估了微生物的存活，并将其与达到的片剂拉伸强度联系起来。使用LAC实现了整个考虑过程链中微生物的最高生存率。
益生菌编程：工程化布拉氏酵母菌中的饮食反应性基因表达和定植控制
摘要：布拉氏酵母菌 (Sb) 是一种新兴的益生菌底盘，用于将生物分子递送到哺乳动物肠道，作为唯一的真核益生菌，具有独特的优势。然而，精确控制 Sb 中的基因表达和肠道停留时间仍然具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了五个配体响应基因表达系统并修复了 Sb 中的半乳糖代谢，从而实现了该菌株中的可诱导基因表达。通过设计这些系统，我们可以构建 AND 逻辑门，控制蛋白质的表面展示，并启动小鼠肠道对饮食糖的反应，从而产生蛋白质。此外，修复半乳糖代谢扩大了 Sb 在肠道内的栖息地，并实现了对肠道停留时间的半乳糖响应控制。这项工作通过控制其体内基因表达水平和胃肠道内的定位，为 Sb 精确给药开辟了新途径。关键词：合成生物学、酵母、微生物组 ■ 简介
香蕉酒的生产及评价（...
香蕉可以作为香蕉汁或与其他果汁混合，凭借其风味和香气在市场上竞争。香蕉酒是一种香气甜美的自制饮料，具有淡淡的水果味、蜂蜜色和独特的口感。所需的主要成分是成熟的香蕉。它可以根据使用的配方制成甜的或干的，你可以将它与其他葡萄酒混合以增加酒体和风味。香蕉酒是一种极好的健康补品，也有助于消化。这种口味独特的果酒富含维生素、钾和锰。它是注重健康的人的最爱。酿酒酵母是参与葡萄酒发酵的最重要的酵母菌种。传统上，由于其最佳的发酵特性，该菌种已被用作进行酒精发酵的发酵剂。出于这个原因，如今酿酒酵母被商业化为活性酵母，并在世界各地的酿酒厂中用于改善发酵过程和葡萄酒质量。
粘蛋白复合物寡聚在DNA双链断裂
DNA双链断裂（DSB），以确保基因组稳定性。至关重要的是，必须将DSB末端保持在一起才能及时修复。在酿酒酵母中，两种知之甚少的途径介导了DSB的终端。使用MRE11-RAD50-XRS2（MRX）复合物在物理上桥接DSB末端。另一个要求DSB通过EXO1转换为单链DNA（ssDNA），但桥接蛋白是未知的。我们发现该粘着蛋白，其加载器和SMC5/6用EXO1作用于Tether DSB末端。非常明显的是，寡聚中特异性受损的粘着蛋白未能束缚DSB，从而揭示了粘着蛋白寡聚的新功能。除了姐妹染色单体内聚力的已知重要性外，基于显微镜的微流体实验通过确保DSB终端连接来揭示凝聚蛋白在修复中的新作用。总的来说，我们的发现表明，粘着蛋白的低聚可防止DSB的末端分离并促进DSB修复，从而揭示了粘连在保护基因组完整性中的新型作用和作用。
酵母基因组定向进化的最新进展
摘要：酿酒酵母作为一种公认安全 (GRAS) 真菌，已成为工业应用和基础研究中最广泛使用的底盘细胞之一。然而，由于其复杂的遗传背景和相互交织的代谢网络，仍然有许多障碍需要克服，以改善所需特性并成功地将基因型与表型联系起来。在此背景下，基因组编辑和进化技术在过去几十年中迅速发展，以促进快速产生定制特性以及精确确定调节生理功能的相关基因靶标，包括抗逆性、代谢途径优化和生物体适应性。定向基因组进化已成为一种多功能工具，使研究人员能够获得所需特性并研究日益复杂的现象。本文回顾了酿酒酵母定向基因组进化的发展，重点介绍了推动进化工程的不同技术。
影响米酒生产区域中环境微生物的多样性和组成的环境因素
摘要：Shaoxing大米葡萄酒是中国米酒的著名典范。它的优质质量与土著自然环境密切相关。结果表明，富公司（75％），肌动杆菌（15％），蛋白质杆菌（5％）和杆菌植物（3％）构成了普遍的细菌组。在主要细菌属中，乳酸杆菌是最丰富的，占49.4％，其次是乳酸菌（11.9％），糖精孢子虫（13.1％），白肿瘤（4.1％）和热乳房（1.1％）。主要的真菌门是Ascomycota和zygomycota。在主要的属中，葡萄糖（59.3％）占据了最丰富的占主导地位，其次是saccharomycopsis（10.7％），曲霉菌（7.1％），温疗（6.2％），根瘤菌（4.9％），梯形（4.9％），梯形（2.2％）和妈妈（1.3％）。发现细菌和真菌群落的结构在环境中保持稳定，其多样性受到气候条件的强烈影响。环境因素（例如温度，气压，湿度，降雨和光线）的连续波动显着影响微生物种群的组成和多样性，尤其是主要的细菌群落。
产生物膜芽孢杆菌的分子鉴定
众所周知，发酵食品中的微生物含有代谢产物，可能改善人类和动物的健康。然而，尽管对发酵食品的功能作用进行了一些研究，但有效芽孢杆菌菌株的分离和鉴定仍在进行中。本研究的目的是从分子上鉴定发酵食品来源中产生生物膜的芽孢杆菌属 (BPB) 和酵母，并研究它们与 Lysinibacillus louembei 菌株的相互作用。共获得 133 个芽孢杆菌分离株以及 32 个酵母分离株，以进行详细鉴定和研究。根据使用 fibE 聚合酶链式反应 (PCR) 多重和 ITS-PCR 技术的表型和分子表征，芽孢杆菌属的种类被鉴定为短小芽孢杆菌 (12%)、枯草芽孢杆菌 (12%)、萨法芽孢杆菌 (6%)、解淀粉芽孢杆菌 (6%)、地衣芽孢杆菌 (6%) 和酿酒酵母 (0.05%)。使用多重 PCR 扩增了枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌和短小芽孢杆菌中参与生物膜形成过程的 yfi Q、eps H、ymc A 和 tas A 基因，并对其进行了鉴定和确认。作为表型结果，使用刚果红琼脂法 (CRA) 鉴定了 45% 的 BPB 分离株。使用乳化指数 (EI24) 测试了芽孢杆菌和酵母生产生物表面活性剂的能力。65% 和 69% 的芽孢杆菌和酵母分离株能够乳化汽油。56% 的芽孢杆菌分离株生物表面活性剂粗提取物对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和沙门氏菌表现出抗菌活性。在芽孢杆菌属、酿酒酵母和 L. louembei 之间进行了培养。结果，在酵母菌株 V3 与 B. pumilus 菌株 VB15 以及 L. louembei 与解淀粉芽孢杆菌中获得了类共生相互作用，在酿酒酵母菌株 P3 和芽孢杆菌属中获得了类竞争相互作用。菌株 VP11，以及与 B. pumilus 和 S. cerevisiae 以及芽孢杆菌属菌株 VP34 和 S. cerevisiae 菌株 P1 的类反式相互作用。这些结果表明，微生物在发酵过程中保持着不同的关系。关键词：芽孢杆菌、酿酒酵母、Lysinibacillus louembei、发酵食品、微生物相互作用、生物表面活性剂、生物膜。引言微生物对各种食品的发酵是最古老的食品生物保存形式之一（Diaz-
用于生产2-苯基乙醇的代谢和酶促工程方法
2-苯基乙醇以其玫瑰般的气味和抗菌活性而闻名，通过苯基丙酮酸脱羧酶（PDC）和醛还原酶的顺序反应通过外源苯基丙酮酸合成。我们首先靶向ARO10，这是酿酒酵母的苯基丙酮酸脱羧酶基因，并鉴定出合适的醛还原酶基因。大肠杆菌转化体中ARO10和YAHK的共表达在批处理培养中产生1.1 g/L的2-苯基乙醇。我们假设PDC活动可能有瓶颈。利用基于计算机的酶进化来增强产量。与野生型ARO10相比，在ARO10（ARO10 I544W）中引入氨基酸取代（ARO10 I544W）稳定了苯基丙酮酸底物的芳族环，增加了2-苯基乙醇的产量4.1倍。培养ARO10 I544W表达大肠杆菌的培养2.5 g/l的2-苯基乙醇，在72小时后，葡萄糖的产量为0.16 g/g。这种方法代表着显着的进步，迄今为止使用微生物从葡萄糖中获得了2-苯基乙醇的最高收率。培养ARO10 I544W表达大肠杆菌的培养2.5 g/l的2-苯基乙醇，在72小时后，葡萄糖的产量为0.16 g/g。这种方法代表着显着的进步，迄今为止使用微生物从葡萄糖中获得了2-苯基乙醇的最高收率。