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酿酒酵母和新兴酵母菌种合成生物学工具和组装方法的标准化
摘要：利用工程原理重新设计生物体是合成生物学 (SynBio) 的目的之一，因此实验方法和 DNA 部件的标准化变得越来越必要。专注于酿酒酵母工程的合成生物学界一直处于这一领域的前沿，构想出了几种被该界广泛采用的特征明确的合成生物学工具包。在本综述中，我们将讨论为酿酒酵母开发的分子方法和工具包对所需标准化工作的贡献。此外，我们还回顾了为新兴非常规酵母物种设计的工具包，包括解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica)、Komagataella phaffii 和马克斯克鲁维酵母 (Kluyveromyces marxianus)。毫无疑问，这些工具包中强调的特征化 DNA 部件与标准化组装策略相结合，极大地促进了许多代谢工程和诊断应用等的快速发展。尽管在常见酵母基因组工程中部署合成生物学的能力不断增强，但酵母界在生物自动化等更复杂、更精细的应用中还有很长的路要走。关键词：标准化、特性、生物部件、酵母工具包、合成生物学、自动化
HOS6932-植物合成生物学的进步，秋季2024
3个毕业生会议：10：40-11：30 AM星期一，星期三，星期五；通过Zoom同步课程，在线上有95％的画布上的材料； 5％的任务需要在UF讲师（园艺科学系）中进行身体上的存在：Cătălinvoiniciuc（协调员）大厦。 885，0003b; （352）273-4782，cvoiniciuc@ufl.edu Andrew Hanson Fifield Hall，2143； （352）273-4856，adha@ufl.edu Edmar R. Oliveira-Filho Fifield Hall，2302； （352）273-4859，Ramosdeoli.edmar@ufl.edu课程描述本课程旨在向研究生介绍合成生物学（Synbio）的基本原理以及此新兴领域的最新进展。 主题将包括实施用于代谢通路和调节回路，定向进化以及生物基础驱动的自动化的设计建造测试循环。 重点将放在植物系统上，在适当的情况下，还包括细菌和酵母系统，以加速植物酶和产品的研究。 此在线课程将使在全州范围内参与，并将讲座与互动讨论和活动相结合，但是空间受到限制，因此请尽早注册。 最终任务的一部分（课程级的5％）将涉及面对面的外展活动。 该课程将使学生能够识别，评估并有效地提出应对农业挑战的Synbio创新。 知识先决条件：没有严格的先决条件，但是需要在活生物体中的分子生物学的基本知识，例如信息流（DNA→RNA→蛋白）。 学习目标：成功完成本课程后，学生将能够：3个毕业生会议：10：40-11：30 AM星期一，星期三，星期五；通过Zoom同步课程，在线上有95％的画布上的材料； 5％的任务需要在UF讲师（园艺科学系）中进行身体上的存在：Cătălinvoiniciuc（协调员）大厦。885，0003b; （352）273-4782，cvoiniciuc@ufl.edu Andrew Hanson Fifield Hall，2143； （352）273-4856，adha@ufl.edu Edmar R. Oliveira-Filho Fifield Hall，2302； （352）273-4859，Ramosdeoli.edmar@ufl.edu课程描述本课程旨在向研究生介绍合成生物学（Synbio）的基本原理以及此新兴领域的最新进展。主题将包括实施用于代谢通路和调节回路，定向进化以及生物基础驱动的自动化的设计建造测试循环。重点将放在植物系统上，在适当的情况下，还包括细菌和酵母系统，以加速植物酶和产品的研究。此在线课程将使在全州范围内参与，并将讲座与互动讨论和活动相结合，但是空间受到限制，因此请尽早注册。最终任务的一部分（课程级的5％）将涉及面对面的外展活动。该课程将使学生能够识别，评估并有效地提出应对农业挑战的Synbio创新。知识先决条件：没有严格的先决条件，但是需要在活生物体中的分子生物学的基本知识，例如信息流（DNA→RNA→蛋白）。学习目标：成功完成本课程后，学生将能够：
在...
研究教授基里尔·亚历山德罗夫（Kirill Alexandrov）于1995年在德国Embl海德堡获得细胞生物学博士学位。他继续在德国多特蒙德的Max-Planck Institute的物理生物化学系进行研究生工作，并在该研究所任职12年，成为1999年的小组负责人。他于1998年共同创立了德国生物技术公司Jenabioscience和2015年英国/澳大利亚Synbio Company Molecular Warehouse Ltd。他于2008年加入了澳大利亚昆士兰州大学澳大利亚大学的澳大利亚生物工程与生物技术研究所，并成为澳大利亚研究委员会的未来研究员。2018年，他加入昆士兰州技术大学，担任CSIRO-QUT典型合成生物学教授。他的小组对人工传感和信号转导的蛋白质工程感兴趣，以及生物学和电子产品之间的双向连通性。
合成生物学= ...
生态系统/食物网的不可逆转损害：超出目标人群以外的转基因生物的脱落和意想不到的传播可能会带来不可预测且深远的后果。Synbio应用的潜在不利影响将以不可预测的模式从这些共生相互作用中出现。这些生物系统不能仅通过查看单个部分（一个生物本身）和孤立的零件来评估，它们都必须被视为较大的单位。此外，生态系统中物种内部和之间的复杂相互依赖性尚未完全理解，意想不到的互动可能会破坏食物网，从而导致不可逆转的损害。这些破坏可能会损害生态系统功能，并可能对各个生物体和整个生态系统造成伤害，而后果可能很难或不可能逆转。
主题投资：到月球（镜头）！ - 未来的技术底漆
Moonshot描述里程碑6G下一代电信网络比5G更快，其下载速度更快，下载速度2028：数据量达到5G网络的容量BCI BCI与计算机连接到人类的人类认知 /思想2021：2021：在进步的情感AI越来越多地捕获人类的人类中的人类越来越多的人类的人类试验，并回应人类的情感2020： pervasive in everyday life Synthetic Biology Harnessing nature by redesigning organisms through genetic engineering to have new applications 2030: most people will have eaten, worn, or used synbio Immortality Breakthroughs in health/ biotech, anti-ageing drugs for radical life extension that ‘disrupts death' 2029: humans could become ‘immortal' and live forever Bionic Humans Technology that augments physical human capabilities e.g.exoskeletons, biohacking, implants 2021: world's first artificial cornea implanted eVTOL Electrical vertical take-off and landing vehicles that provides alternative mobility to road transport 2023: three eVTOL certified for commercial launch Wireless Electricity The use of magnetic fields or radio waves to transmit electricity wirelessly without cables 2025: 10 connected devices per person that needs charging Holograms Light imagery projections without headsets for digital interactions not requiring physical presence 2021: world's first hologram dining experience Metaverse Virtual worlds universe that interoperate with each other superseding the internet/physical world 2030s: spending more time in virtual world than real world Nextgen Batteries Next EV technologies after lithium-ion batteries such as solid state, sodium ion, vanadium flow etc 2020: one million mile battery pack breakthrough Oceantech Blue Economy where technology is deployed in the sea (ocean energy, precision fishing etc) 2030: global ocean economy equivalent to 2010 German GDP Green Mining Climate change is metals intensive requiring sustainable mining (sea, agro, wastewater, asteroid) 2024: commercial deep-sea mining set to start CCS Negative emissions technologies that captures and stores CO2 before release into the atmosphere 2040/50: $1 trillion in cumulative capex对CCS的投资
Paula Tamagnini教授蓝绿色的可持续性
摘要：制药和化学工业提供社会大部分日常使用的材料，但是它们是主要污染者，对碳排放量产生了重大贡献，并且产生了比产品多5-100倍。在这种情况下，生物催化成为一种有前途的方法，可以发展出蓝细菌作为当前使用的异养费用的替代底盘的绿色，更可持续和更便宜的化学制造。旨在表达与工业相关的异源酶，例如氢化酶和单加氧化酶[1]，产生了几种具有流线性光合电子流量的综合囊体突变体。我们的目标包括编码推定竞争电子水槽的基因，例如：双向氢化酶HOX，Flavodiiron蛋白FLV1/3，NDH-1复合物的NDHD2亚基，Cox终端氧化酶和天然CYP120A1。当前，这些底盘的有效性，从电子流向氧化还原酶方面，正在通过P450传感器蛋白（CYP1A1）通过乙氧基resorufin-O-二甲基酶（EROD）测定进行评估。初步结果表明，与野生型相比，突变体的CYP1A1活性更高。并行，生成并测试了合成装置的合成装置，并生成了合成装置，并生成了并测试并测试了合成装置，并具有合成装置，并测试了。 与野生型相比，该装置在综合囊体突变体中缺乏生产的生产中缺乏天然兼容溶质葡萄糖基甘油（δGGP）增强了3％NaCl的生长[2,3]。 参考文献1。 Mascia等。 Ferreira等。 （2018）Synt。。与野生型相比，该装置在综合囊体突变体中缺乏生产的生产中缺乏天然兼容溶质葡萄糖基甘油（δGGP）增强了3％NaCl的生长[2,3]。参考文献1。Mascia等。Ferreira等。（2018）Synt。通过将AHBET装置引入EPS生产中的突变体中，评估了推定碳竞争途径的损害，即细胞外聚合物（EPS）对甘氨酸甜菜碱的产生的影响。Δkpsm_AHBET突变体比δGGPS_AHBET产生的甘氨酸蛋白甜味蛋白多2倍，并增加了前体甘氨酸的可用性，从而产生了更高的甘氨酸菜碱的产生。然而，作为δGGPS_AHBET，δkpsm_AHBET突变体在3％NaCl以下的生长没有增加。因此，针对海水中的大规模培养，例如AHBET被引入染色体中性位点[4]。（2022）绿色化学，doi.org/10.1039/d1gc04714k 2。biol。，doi.org/10.1093/synbio/ysy014 3。Ferreira等。（2022）正面。Bioeng。Biotechnol。，doi.org/10.3389/fbioe.2021.821075 4。Pinto等。（2015）DNA res。，doi.org/ 10.1093/dnares/dsv024