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1/17 Curriculum Vitae Miguel Torres，博士 - cnic
西班牙马德里。电子邮件：mtorres@cnic.es专业数据当前职位2007年至今的高级科学家，Centro Nacional de Investiones Cardianeaseses（CNIC）2022-CNIC CNICASIASECUAL RECENERANION RENENERATION RENEMERAINE REMENERATION教育计划M.电子邮件：mtorres@cnic.es专业数据当前职位2007年至今的高级科学家，Centro Nacional de Investiones Cardianeaseses（CNIC）2022-CNIC CNICASIASECUAL RECENERANION RENENERATION RENEMERAINE REMENERATION教育计划M.CSIC。 马德里1999 - CSIC。 马德里1996年 - 1999年CSIC小组负责人。CSIC。 马德里1999 - CSIC。 马德里1996年 - 1999年CSIC小组负责人。CSIC。马德里1999 -CSIC。马德里1996年 - 1999年CSIC小组负责人。马德里1984年 - 1987年，在西班牙教育和科学部，1988年，马德里的CSIC CENTRO de RevistryesBiológicas，CSIC选择荣誉和奖项1988 “ 1000” 2003年 - 发育动力学编辑委员会成员2004-2008 2004年的成员，生物技术科学局治疗委员会成员，2009年成本行动的主席“发展与疾病中的hox/ tale tale tresscription因素在发展与疾病中的hox/ tale tryscription因素” 2011年 - 2011年 - 当前的编辑委员该奖获得了2012年Severo Ochoa奖，以“ La vanguardia”价格“年度科学突破” 2012-国际发育生物学杂志编辑委员会成员
研究论文
摘要 水稻细菌性叶枯病 (BLB) 被认为是一种具有经济价值的疾病，因为该疾病会导致所有水稻种植区产量严重下降。病原菌水稻白斑病 (Xoo) 产生的转录激活因子样效应物 (TALE) 分子与 SWEET 基因启动子的效应物结合元件 (EBE) 结合并激活 SWEET 基因的转录，使植物易患该疾病。某些水稻基因型对 Xoo 的先天抗性是由于 SWEET 基因上游调控区中的 EBE 发生突变。CRISPR 介导的易感基因/启动子的靶向修饰是提高水稻 BLB 抗性的有效方法。本研究尝试通过在当地流行的水稻基因型 CO51 中引入 OsSWEET13 基因的 EBE 插入缺失来抑制 TALE 触发的信号传导，采用 CRISPR/Cas9 介导的基因组编辑工具，以赋予 BLB 抗性。使用未成熟胚进行农杆菌介导的转化，然后进行再生，产生了四个独立的转化事件。发现代表三个事件的五株植物在目标序列中有一个核苷酸缺失。EBE 中的这些缺失突变可能会干扰相应 TALE 的结合，从而赋予对某些 BLB 菌株的抗性。
可持续农业生物农药的微生物生产
1印度信息技术学院生物技术系UNA，UNA，UNA 177209，喜马al尔邦，印度喜马al尔邦2 ICAR-Indian Seed Science，Kushmaur，Mau 275103，印度北方邦，印度； ashu.nbaim@gmail.com（a.k. ）; jeevan.kumar@icar.gov.in（P.J.K.S.） 3 Vignan科学，技术与研究基金会，Vadlamudi，Guntur 522213，印度安得拉邦； ad3_res@vignan.ac.in 4 411036，印度马哈拉施特拉邦浦那411036 ICAR-DIRECTIORATE，5 INRAE，Pathologievégégégétale，Montfavet，84140，法国Avignon，法国； Marc.bardin@inrae.fr 6中国Xi'an Jiotong University的电力工程多相关流量实验室，中国710049； eric.lichtfouse@icloud.com *通信：madanverma@iiitu.ac.in或madanverma@gmail.com1印度信息技术学院生物技术系UNA，UNA，UNA 177209，喜马al尔邦，印度喜马al尔邦2 ICAR-Indian Seed Science，Kushmaur，Mau 275103，印度北方邦，印度； ashu.nbaim@gmail.com（a.k.）; jeevan.kumar@icar.gov.in（P.J.K.S.）3 Vignan科学，技术与研究基金会，Vadlamudi，Guntur 522213，印度安得拉邦； ad3_res@vignan.ac.in 4 411036，印度马哈拉施特拉邦浦那411036 ICAR-DIRECTIORATE，5 INRAE，Pathologievégégégétale，Montfavet，84140，法国Avignon，法国； Marc.bardin@inrae.fr 6中国Xi'an Jiotong University的电力工程多相关流量实验室，中国710049； eric.lichtfouse@icloud.com *通信：madanverma@iiitu.ac.in或madanverma@gmail.com3 Vignan科学，技术与研究基金会，Vadlamudi，Guntur 522213，印度安得拉邦； ad3_res@vignan.ac.in 4 411036，印度马哈拉施特拉邦浦那411036 ICAR-DIRECTIORATE，5 INRAE，Pathologievégégégétale，Montfavet，84140，法国Avignon，法国； Marc.bardin@inrae.fr 6中国Xi'an Jiotong University的电力工程多相关流量实验室，中国710049； eric.lichtfouse@icloud.com *通信：madanverma@iiitu.ac.in或madanverma@gmail.com
使用 TALE-BE 进行高效的多工具/多重基因工程
TALE 碱基编辑器是最近添加到基因组编辑工具箱中的。这些分子工具是转录激活因子样效应结构域 (TALE)、分裂 DddA 脱氨酶半体和尿嘧啶糖基化酶抑制剂 (UGI) 的融合，它们具有直接编辑双链 DNA 的独特能力，将胞嘧啶 (C) 转化为胸腺嘧啶 (T)。为了剖析 TALE-BE 的编辑规则，我们将数十个靶向核基因组位点的 TALE-BE 的筛选与基于将 TALE-BE 靶位点集合精确敲入细胞基因组的中/高通量策略相结合。后一种方法使我们能够深入了解 cellulo 中的编辑规则，同时排除不同基因组位点之间的表观遗传和微环境差异等混杂因素。利用获得的知识，我们设计了靶向 CD52 的 TALE-BE，并实现了非常高的基因敲除频率（高达 80% 的表型 CD52 敲除）。我们进一步证明 TALE-BE 仅产生微不足道的插入/缺失和副产物。最后，我们将两种分子工具（TALE-BE 和 TALEN）结合起来进行多重基因组工程，产生高水平的双基因敲除（~75%），而不会在两个靶位点之间产生易位。
引文 Qiu J, Wu H, Xie Q, Zhou Y, Gao Y, Liu J, Jiang X, Suo L 和 Kuang Y (2024), 利用 D 介导的精确线粒体 DNA 碱基编辑
社会。最重要的是，迄今为止，针对这一系列致残或限制生命的疾病，获得许可的治疗方法极其有限（Chinnery，2015；Viscomi 等人，2023）。线粒体疾病的治疗方法包括对症治疗以改善生活质量或延长寿命，以及基因治疗以减少异质体并治愈细胞生化缺陷。对症治疗包括操纵线粒体的细胞含量、通过雷帕霉素诱导线粒体周转、恢复 NAD + 水平、调节活性氧的产生和氧化应激等（Russell 等人，2020）。基因治疗包括直接编辑线粒体基因组、基因替代疗法（Silva-Pinheiro 等，2020；Ling 等，2021）和线粒体移植疗法（Green field 等，2017）。基因编辑技术作为一种潜在的治疗选择，在过去十年中已在核遗传疾病的治疗中得到广泛研究（Sharma 等，2015；Nelson 等，2016；De Ravin 等，2017；Zheng 等，2022），越来越多的临床试验正在进行中（Arabi 等，2022）。然而，由于缺乏有效的工具来操纵 mtDNA（ Silva-Pinheiro 和 Minczuk，2022 年），其在由 mtDNA 突变引起的线粒体疾病中的意义受到阻碍，除非通过锌指融合（ Minczuk et al., 2008; Gammage et al., 2014; Gammage et al., 2016a; Gammage et al., 2016b; Gammage et al., 2018b ）或 TALE 融合的 fokI 核酸酶（ Bacman et al., 2013; Reddy et al., 2015; Bacman et al., 2018; Pereira et al., 2018; Yang et al., 2019）或 TALE 融合的 fokI 核酸酶（ Bacman et al., 2013; Reddy et al., 2015; Bacman et al., 2018; Pereira et al., 2018; Yang et al., 2019）切割和消除有害的 mtDNA 拷贝。线粒体DNA碱基编辑技术目前已发展成为生物技术中最常用的编辑技术之一（Pereira et al., 2018），以及基于TALE系统的单体酶（Pereira et al., 2018）。近年来，基于TALE的线粒体DNA碱基编辑工具陆续被引入，第一种是DddA衍生的胞嘧啶碱基编辑器（DdCBE）（Mok et al., 2020），它为按预期操纵线粒体DNA打开了大门。DddA系统来源于伯克霍尔德菌，DdCBE由两半无毒的TALE融合分裂DddA（DddA-N和DddA-C）组成，通过将这两半分裂的DddA重新组装成功能性脱氨酶，催化间隔区域内的胞嘧啶脱氨。目前，DdCBE 已成功应用于植物 (Kang et al., 2021)、哺乳动物细胞 (Mok et al., 2020)、斑马鱼 (Guo et al., 2021)、小鼠 (Lee et al., 2021; Lee et al., 2022a; Guo et al., 2022)、大鼠 (Qi et al., 2021) 甚至人类生殖细胞 (Wei et al., 2022a; Chen et al., 2022) 的线粒体 DNA 编辑。在我们的实验室中，它还已成功用于小鼠早期卵泡阶段的有效生殖系线粒体 DNA 编辑（已提交数据）。不幸的是，它在挽救线粒体疾病方面的应用极其罕见，无论是用于治疗研究（Silva-Pinheiro 等人，2022 年）还是用于临床试验（Chen 和 Yu-Wai-Man，2022 )。众所周知，潜在基因编辑结果的可预测性对于基因编辑技术在临床上用于基因治疗至关重要。为此，已经进行了大量的工作来了解CRISPR系统在核基因组编辑中对不同靶标的编辑规则，并且已经证明对于每个被CRISPR/Cas9编辑的原型间隔物来说，其结果是完全可预测的（van Overbeek et al., 2016 ; Shen et al., 2018 ; Shou et al., 2018 ; Allen et al., 2019 ; Chakrabarti et al., 2019 ; Chen et al., 2019 ; Long, 2019 ; Shi et al., 2019 ），这使我们能够提前知道每种策略在临床上应用的潜在结果。然而，对于线粒体基因组，由于缺乏 DNA 修复，CRISPR/Cas9 尚未参与 mtDNA 编辑
LbCas12a-D156R 有效编辑 LOB1 效应结合元件，以产生抗溃疡病的柑橘植物
摘要：由柑橘黄单胞菌（Xcc）引起的柑橘溃疡病是全球大多数柑橘产区的重要经济病害。Xcc 分泌一种转录激活因子样效应物 (TALE) PthA4，与溃疡病易感基因 LOB1 启动子区的效应物结合元件 (EBE) 结合，激活其表达，从而引起溃疡症状。利用 Cas9/gRNA 编辑 EBE 区域已用于生成抗溃疡病的柑橘植株。然而，生成的大多数 EBE 编辑株系含有 1–2 bp 的插入/缺失，这更有可能通过 PthA4 适应来克服。TALE 的适应能力与与 EBE 的错配数量呈负相关。已知 LbCas12a/crRNA 产生的缺失比 Cas9 更长。在本研究中，我们使用了一种耐高温且更高效的 LbCas12a 变体 (ttLbCas12a)，该变体含有单个替换 D156R，用于修改 LOB1 的 EBE 区域。我们首先构建了 GFP-p1380N-ttLbCas12a:LOBP，经证实，该变体在柚子 (Citrus maxima) 叶片中通过 Xcc 促进的农杆菌渗滤而发挥功能。随后，我们在柚子中稳定表达了 ttLbCas12a:LOBP。生成了八个转基因株系，其中七个株系显示 EBE 的 100% 突变，其中一个株系是纯合的。EBE 编辑株系具有高达 10 bp 的 ttLbCas12a 介导的缺失。重要的是，这七个株系具有抗溃疡病性，并且未检测到脱靶。综上所述，ttLbCas12a 可有效利用来生成具有短缺失的双等位基因/纯合柑橘突变系，从而为柑橘的功能研究和育种提供有用的工具。
MajaLermarkSchøn学术简历
在不同饮食上的黑人士兵的增长和代谢的抚养” 2022：Aarhus University的生物学毕业党2021年生物学演讲者：Aarhus University的学生演讲者https://wwww.dansketleter.dansketaler.dk/tale/maja-lermark-lermark-schons-schons-schons-tale-vertiation fundertiation 202 (Sep.): Horizon Europe FARM2FORK, Animal nutritional requirements and nutritional va- lue of feed under different production management conditions 2023 (Sep.): AUFF NOVA, Aarhus University Research Foundation (Granted: 80.000 €) BSc and MSc Thesis Topics 2020-2022: Master's thesis 60 ECTS │ Nutritional geometry │ Fatty acids │ Optimization │ Waste