与简短的读数相比,覆盖范围仅限于ITS1或ITS2区域,HIFI读取的读数涵盖了全真菌其区域的全长。这包含800 bp,如果包括18s和/或28S基因以跨越操纵子,则可以提供约5 kb的扩增子。以及更保守的rRNA基因,这些区域允许在物种水平上降低序列相似性和更高分辨率的分类信息(Tedersoo等,2018; Tedersoo等人,2021年,图2)。除了产生更高的分类价值外,HIFI全长扩增子测序的成本与短阅读的部分扩增子测序相当。在本申请注释中,我们提供了从复杂社区DNA样品中扩增全长真核ITS和rRNA区域的一般指导。
菌根是土壤真菌和植物根部之间形成的常见互共生。共生状态以光合固定的碳的一小部分代价改善了植物矿物营养。结果,植物的生长受到积极影响以及宿主对生物和非生物胁迫的抗性。此外,菌根在农业和自然环境中提供了许多生态系统服务。的确,菌根真菌塑造微生物和植物群落,增强碳储存并改变土壤颗粒的聚集(Chen等,2018; Tedersoo等,2020)。弧形,ecto - ,兰花和eric虫菌根是四种主要的菌根类型,每种植物和共生真菌之间共同进化的多种形态和功能性状都有明显的形态和功能性特征(Genre等,2020)。超过320,000种现有的血管和非血管植物物种可以发展出菌根,其中最大,最多样化的物种属于被子植物。树木,灌木丛,草药和大多数主食(包括大米,玉米和番茄)都在其中。在这种惊人的多样性中,Arbuscular amcorrhizas特别感兴趣,因为它们在全球气候变化的背景下支持可持续作物生产的潜力。外生菌在森林管理中具有巨大的潜力,而ericoid和Orchid mycorrhizas已成功地应用于生物化和生态系统保护研究中。符合会议的主要重点,大多数研究都涉及卷肌菌根相互作用的分子方面。与第6个国际分子菌根会议(IMMM 2023)结合发起,该会议于2023年9月25日至27日在英国剑桥举行,该研究主题涵盖了七个精选的贡献,其中涵盖了大多数主题,其中大多数主题与原始研究,方法和审查了有关mycorrhizal关联的论文。