与简短的读数相比,覆盖范围仅限于ITS1或ITS2区域,HIFI读取的读数涵盖了全真菌其区域的全长。这包含800 bp,如果包括18s和/或28S基因以跨越操纵子,则可以提供约5 kb的扩增子。以及更保守的rRNA基因,这些区域允许在物种水平上降低序列相似性和更高分辨率的分类信息(Tedersoo等,2018; Tedersoo等人,2021年,图2)。除了产生更高的分类价值外,HIFI全长扩增子测序的成本与短阅读的部分扩增子测序相当。在本申请注释中,我们提供了从复杂社区DNA样品中扩增全长真核ITS和rRNA区域的一般指导。