收到2024年2月2日; 2024年5月7日接受;于2024年6月7日发布:1 Doherty应用微生物基因组学,微生物学和免疫学系,墨尔本大学Peter Doherty感染与免疫学研究所,792 Elizabeth Street,Melbourne VIC 3000,澳大利亚澳大利亚墨尔本街792号; 2爱尔兰科克摩尔帕克的Teagasc食品研究中心; 3爱尔兰科克大学科克大学科克大学科克大学的APC微生物组和微生物学院; 4 Vistamilk SFI研究中心,爱尔兰科克Teagasc Moorepark。*信件:John G. Kenny,John。Kenny@teagasc。IE关键字:Amplicons;数据库;长阅读测序;微生物组;纳米孔; rRNA。缩写:COV,变异系数; ESV,精确的序列变体; Grond,基因组衍生的核糖体操纵子数据库; GTDB,基因组分类数据库; IQR,四分位数范围;它的内部转录垫片; NR,非冗余; ONT,牛津纳米孔技术; RRN,16S-ITS-23S rRNA操纵子; rRNA,核糖体RNA; SD,标准偏差; Taxlca,集群中所有序列的最低祖先; Taxmaj,最低的分类学等级,其中所有序列中的所有序列都具有简单的多数协议; Taxrep,集群代表序列的源基因组分类学; UMIS,唯一的分子标识符。数据语句:文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用两个补充表。001255©2024作者
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