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•使用启发式式启发式序列对齐序列，该序列逐渐从一系列成对对齐中构建多个序列对齐。•此方法通过分析整个序列，然后利用UPGMA /邻居加入方法生成距离矩阵来起作用。•然后根据矩阵中的序列的得分计算一个指南树，然后按相似性顺序逐步对齐序列•基本上，Clustal通过三个主要步骤创建多个序列对齐：
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