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图 4. SeqStudio Flex 和 3500xL 仪器在 MSI 分析中产生了相似的数据。(A)TrueMark MSI 检测分析了 13 个微卫星基因座的不稳定性,包括广泛使用的 Bethesda 标准。确定为不稳定的基因座可以自动调用;然后软件将使用全部调用对样本进行总体调用。该检测包括两个高度可变的短串联重复 (STR) 序列 (THO1 和 PentaD),可用于确认样本身份。该软件使用的专有算法不需要并行分析正常的非肿瘤组织即可进行稳定/不稳定调用。(B)使用 TrueMark MSI 检测分析了九个肿瘤/正常相邻对和一个仅肿瘤样本。使用两种仪器的数据,软件调用的基因座数量非常相似。样本 S07-001886-A5 回收的 gDNA 不理想;并非所有基因座都以同等方式扩增,因此在两种仪器上产生的结果略有不同。
图 3. SeqStudio Flex 和 3500xL 仪器在 MSI 分析中产生了相似的数据。(A)TrueMark MSI 检测分析了 13 个微卫星基因座的不稳定性,包括广泛使用的 Bethesda 标准。确定为不稳定的基因座可以自动调用;然后软件将使用全部调用对样本进行总体调用。该检测包括两个高度可变的短串联重复 (STR) 序列 (THO1 和 PentaD),可用于确认样本身份。该软件使用的专有算法不需要并行分析正常的非肿瘤组织即可进行稳定/不稳定调用。(B)使用 TrueMark MSI 检测分析了九个肿瘤/正常相邻对和一个仅肿瘤样本。使用两种仪器的数据,软件调用的基因座数量非常相似。样本 S07-001886-A5 回收的 gDNA 不理想;并非所有基因座都以同等方式扩增,因此在两种仪器上产生的结果略有不同。
