•第1章 - 简介本章包含有关使用此文档的信息,最新总和版本中可用的新功能的概述,一些命名约定,并列出了一些必需的SAP注释。•第2章 - 快速指南快速指南以正确的顺序列出了所有活动。有关单个步骤的更多信息,请遵循快速指南[第13页]中的链接。•第3至6章 - 更新过程这些章节包含有关计划,准备和执行更新以及有关后续活动的详细信息。•第7章 - 使用手动准备的目录应用单个组件更新和修补程序本章包含有关使用软件更新管理器中的特殊功能应用单个组件更新和修补程序的信息。•第8章 - 在现有SAP系统中安装其他用法类型(技术用法)本章包含有关基于SAP NetWeaver Java的现有SAP系统中安装其他用法类型或技术用法的信息。•第9章 - 安装软件信息的纠正本章包含有关纠正和更新SAP系统中安装软件实例的详细信息的信息。•附录•过程概述报告包含有关总和生成的报告的信息,以分析更新过程。•故障排除包含有关已知问题的信息并将其故障排除。•引用的SAP注释列表列出了所有SAP注释,其中包含有关更新过程的其他信息,除SAP注释[第10页]与更新准备相关的SAP注释[第10页]。•引用文档的列表列出了本文档中引用的文档,并包含有关在哪里找到此文档的信息。
动机:生物学过程中的各种学科并分析了多个序列比对(MSA)和系统基因树,以评估其信息含量,推断进化事件和过程并预测基因功能。但是,由于缺乏统一的工具包,MSA和树木的自动处理仍然是一个挑战。为了填补这一差距,我们介绍了Phykit,这是一种使用30个处理MSA和树木的函数的工具包,包括但不限于估计突变率,序列组成偏见的评估,计算分子时钟的违规程度以及与下属的分子抗体(内部分支)(较低的支撑)。结果:为了证明Phykit的实用性,我们详细介绍了三种用例:(1)总结MSA和系统发育树中的信息内容,以诊断出序列或树数据的潜在偏见; (2)评估基因 - 基因的共同变异,以鉴定基因之间的功能关系,包括新颖的关系,以及(3)标志性的系统发育树中缺乏分辨率事件或多构象,这些事件暗示了快速辐射事件或缺乏数据。我们预计,植物会对处理,检查和得出生物学意义有用。可用性和实施:phykit在GitHub(https://github.com/jlsteenwyk/phykit),pypi(https://pypi.org/project/phykit/)和Anaconda Cloud(https://pro)云(https://p:org/project/phykit/)和Anaconda Cloud(https:httpps:htttps:/带有广泛文档和用户教程的Cense(https://jlsteenwyk.com/phykit)。联系人:jacob.steenwyk@vanderbilt.edu或antonis.rokas@vanderbilt.edu补充信息:补充数据可从Bioinformatics Online获得。