摘要:基于质谱的有限蛋白水解化学蛋白质组学方法已成为识别和分析小分子 (SM) 与其蛋白质靶标之间相互作用的有力工具。Gracilioether A (GeA) 是一种从海绵中分离出来的聚酮化合物,我们旨在利用这种策略追踪其相互作用组。DARTS(药物亲和力响应靶标稳定性)和 t-LiP-MS(靶向有限蛋白水解质谱)代表了本研究中使用的主要技术。DARTS 应用于 HeLa 细胞裂解物以识别 GeA 靶蛋白,并使用 t-LiP-MS 研究蛋白质与 GeA 结合的区域。通过使用表面等离子体共振 (SPR) 的结合研究和计算机分子对接实验,结果得到了补充。泛素羧基末端水解酶 5 (USP5) 被确定为 GeA 的一个有希望的靶点,并解释了 USP5-GeA 复合物的相互作用特征。USP5 是一种参与蛋白质代谢途径的酶,通过将降解蛋白质上的多泛素链分解为泛素单体。这种活性与不同的细胞功能有关,包括染色质结构和受体的维持、异常蛋白质的降解和致癌进展。在此基础上,这些结构信息为后续研究开辟了道路,重点是确定 Gracilioether A 的生物学潜力以及基于新结构骨架合理开发新型 USP5 抑制剂。
摘要:个人交通工具的电气化在降低温室气体排放和减少气候变化方面具有巨大潜力。电动汽车 (EV) 有望实现这些目标,这导致了一系列支持政策的出台,旨在鼓励美国和世界各地的州和联邦层面广泛采用电动汽车。虽然电动汽车革命和电动汽车无处不在的世界的前景正在影响各个行业和日常生活的许多方面,但电网和电动汽车之间的战略互动对于成功的能源转型至关重要。然而,管理电动汽车和电网之间的相互作用仍然是一个挑战。受这种紧张关系的推动,本文调查了各种解决方案、政策和激励措施,重点是有效管理电动汽车充电行为。本文的目标是探索这些工具,以确保电动汽车车主对其个人车辆拥有最终控制权,同时允许电网减轻不利的网络影响。此外,本文还研究了充电基础设施技术及其战略布局在促进电动汽车无缝集成到电网中的作用。此外,本文强调了与电动汽车集成相关的金融机制,并讨论了这些机制的后果。
循环经济(CE)和可持续性在政治议程上很高。研究的重点是了解CE流1,但是,只有有限的研究解决了CE监测的问题和数字政府的作用[1,2]。在CE监测的背景下,对边界的作用和控制水平的作用更少。最近的报道2关于出口到肯尼亚的二手服装最终在环境中被处置了,因为废物表明了许多例子之一,这些例子迫切需要更好地了解政府在边界越过时在CE监测中的作用。
感觉神经元中电压门控钠 NaV 1.7 通道失调会导致慢性疼痛,包括三叉神经性疼痛。我们之前报告过,慢性疼痛部分是由于塌陷反应介质蛋白 2 (CRMP2) 的 SUMO 化增加所致,从而导致 CRMP2/NaV 1.7 相互作用增加和 NaV 1.7 功能活性增加。针对这种前馈调节,我们开发了化合物 194 ,它可抑制由 SUMO 结合酶 Ubc9 介导的 CRMP2 SUMO 化。我们进一步证明 194 可有效降低背根神经节神经元中 NaV 1.7 通道的功能活性并缓解炎症和神经性疼痛。在这里,我们采用了一系列全面的研究方法,包括生化、药理学、遗传学、电生理学和行为分析,以评估 CRMP2 对 Na V 1.7 调节在三叉神经节 (TG) 神经元中的功能影响。我们证实了 Scn9a 、 Dpysl2 和 UBE2I 在 TG 神经元内的表达。此外,我们发现 CRMP2 和 Na V 1.7 之间存在相互作用,其中 CRMP2 在这些感觉神经节中被 SUMO 化。用化合物 194 破坏 CRMP2 的 SUMO 化会解开 CRMP2/Na V 1.7 相互作用,阻碍 Na V 1.7 在质膜上的扩散,随后降低 Na V 1.7 活性。化合物 194 还导致 TG 神经元兴奋性降低。最后,当鼻腔内给药给患有慢性眶下神经压迫性损伤 (CCI-ION) 的大鼠时,194 显著减少了伤害性行为。总之,我们的研究结果强调了 CRMP2 在调节 TG 神经元内的 Na V 1.7 方面的关键作用,强调了这种间接调节在三叉神经性疼痛中的重要性。
目标:我们先前的研究表明,USP1抑制剂ML323在结直肠癌(CRC)细胞中下调了USP1,但特定机制仍然未知。方法:将CRC细胞裂解以进行免疫印迹以检测蛋白质表达。定量实时PCR进行检查以检查mRNA水平。进行了环己酰亚胺追逐测定法,以评估USP1的半衰期。共沉淀用于分析USP1的多泛素化。结果:CRC细胞中蛋白酶体抑制剂MG132增强了USP1蛋白稳定性。野生型USP1被MG132上调,但没有其催化突变体。此外,MG132也增强了USP1的多泛素化,这表明USP1通过泛素蛋白蛋白酶体途径降解。同时,我们证实ML323在CRC细胞中下调了USP1的表达,并且环己酰亚胺追逐测定也显示ML323降低了USP1蛋白质的稳定性。进一步的结果表明,MG132消除了ML323诱导的USP1下调和不稳定。此外,caspase抑制剂Z-VAD并未逆转USP1蛋白的不稳定,这进一步表明ML323诱导的USP1下调并不取决于CRC细胞中细胞死亡的影响。结论:我们的结果表明USP1是自动泛素化的,ML323通过CRC细胞中的泛素蛋白酶体途径不稳定USP1,为抗CRC药物的开发提供了针对USP1的理论基础。关键字:大肠癌,USP1,ML323
在某些情况下,突变致癌基因的小分子抑制剂的鉴定导致了显著的肿瘤反应。尽管取得了这些成功,但许多癌症并不含有可用药的致癌基因突变,单一药物疗法很少导致肿瘤完全消退。为了系统地鉴定出其表达对于癌细胞系亚群的增殖和/或存活必不可少的基因,我们和其他人开发了基因组规模的方法,在数百种癌细胞系中进行功能丧失[RNA干扰(RNAi)和CRISPR-Cas9]筛选,以鉴定出特定环境下的必需基因(1-7)。这些努力已鉴定出WRN是微卫星不稳定癌症中的合成致死靶点,PRMT5是MTAP缺失肿瘤中的必需基因,以及透明细胞卵巢癌中的选择性EGLN1依赖性(8-12)。这些研究大多侧重于鉴定特定环境下细胞适应性所需的单个基因。然而,其他研究已经利用这些癌细胞系的基因依赖性模式来揭示基因
合成致死是一种遗传相互作用,指两个基因(但不是单独一个基因)丢失,会导致细胞死亡,并允许靶向疗法选择性地杀死肿瘤细胞,同时在很大程度上保护正常细胞。PARP 抑制剂获批用于治疗 BRCA1/2 突变癌症,这是合成致死概念的首个临床验证 (1)。鉴于 PARP 抑制剂的成功,人们对开发下一代合成致死癌症疗法产生了浓厚的兴趣。基于 CRISPR-Cas9 的功能基因组学的最新进展,加上对癌症遗传学知识的不断加深,正在加速针对癌症中新的遗传依赖性的靶向治疗。USP1 编码一种 785 个氨基酸的半胱氨酸蛋白酶,属于 USP 去泛素化酶家族 (2)。为了优化催化活性,USP1 与 UAF1 (2) 形成异二聚体复合物,UAF1 是一种含有 WD40 重复序列的蛋白质,也能刺激 USP46 和 USP12 (3)。 USP1 – UAF1 复合物使参与 DNA 损伤反应的几种底物去泛素化,包括单泛素化的 PCNA 和 FANCD2 (2, 4 – 6)。USP1 在跨损伤合成 (TLS) 和模板转换 (TS) DNA 损伤耐受过程中起着关键作用
