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泛素介导的蛋白水解：通过破坏的生物调节
总结泛素蛋白水解系统在一系列基本的细胞过程中起重要作用。是细胞周期的调节，免疫反应和炎症反应的调节，信号转导途径的控制，发育和分化。这些复杂过程通过单个或子集的蛋白质的特异性降解来控制。deg含量涉及两个连续的步骤，共轭泛素的多种部分以及26S蛋白酶体对标记蛋白的降解。一个重要的问题涉及基于系统特异性的机制的身份。底物识别受一个大型家族泛素连接酶的控制，该连接酶可以认识底物，结合它们并催化/促进它们与泛素的相互作用。生物评估22：442±451，2000。β2000 John Wiley＆Sons，Inc。
2025; 21（4）：1801-1818。 doi：10.7150/ijbs.104067研究论文FBXW7直接泛素化并降解ctnnb1介导eNkur
1。肿瘤科，南科医学院医院，中国医学院综合综合传统医学，广州510315，中国。2。妇产科系，第三个附属医院/南科尔大学南部医科大学第三临床医学院，中国510315。3。中国Huaihua癌症医院妇科和肿瘤学系418100。 4。 南科医学院（Shunde Hospital）放疗部，南科医学院（Shunde Hospital of Shunde Foshan的第一人民医院），1＃Jiazi Road，Foshan，528300，中国广东。 5。 山东癌症医院胃肠道肿瘤学系和山东第一医科大学和山东医学学院，吉南250117，中国。 6。 中国高利525200的高佐人民医院。中国Huaihua癌症医院妇科和肿瘤学系418100。4。南科医学院（Shunde Hospital）放疗部，南科医学院（Shunde Hospital of Shunde Foshan的第一人民医院），1＃Jiazi Road，Foshan，528300，中国广东。5。山东癌症医院胃肠道肿瘤学系和山东第一医科大学和山东医学学院，吉南250117，中国。 6。 中国高利525200的高佐人民医院。山东癌症医院胃肠道肿瘤学系和山东第一医科大学和山东医学学院，吉南250117，中国。6。中国高利525200的高佐人民医院。
在致病性变形虫中控制泛素样蛋白下的繁殖和应力反应
1 POITIERS，国家科学研究中心UMR7267，《互动生态与生物学实验室》，TSA51106，86073 POITIERS，法国2学院2帕斯德研究所，生物图像分析单元，国家科学研究中心UMR3691，ParisCité大学，国家科学研究中心elisabeth.labruyere@pastteur.fr（E.L。）; jean-christophe.olivo-marin@pastteur.fr（J.-C.O.-M。）3 Pasteur，蛋白质组学核心设施，生物学质谱单元质谱单元，国家科学中心，2024年2024年，巴黎大学Cité大学，法国75015 Paris，法国，法国，法国75015 Paris； Mariette.matondo@pastteur.fr 4国家科学研究中心药理学与结构生物学研究所UMR 5089，图卢兹大学IIIII-PAUL SABATIER，法国31077，法国图卢兹； Marie.locard-paulet@ipbs.fr 5 Proteomique Profi的国家基础设施-FR2048，2048法国Toulouse 6 C. nguillen@pastteur.fr（n.g。）;这样的。： +33-（0）549454013（A.S.-L。）; +33-（0）145688675（N.G.）
泛素和相思性作为急性髓样白血病的生物标志物对化学疗法的反应
泛素和类似泛素的SUMO共价结合到数千种蛋白质以调节其功能和命运。与其偶联的许多酶在癌症中均具有异化，并参与癌细胞对疗法的反应。我们在这里描述了这些酶活性的生物标志物及其用于预测急性髓样白血病（AML）对标准化疗（Daunorubicin-DNR和Cytarabine-ARA-CAR）的反应。我们比较了从化学敏感和化学耐药的AML细胞中提取物在蛋白质阵列上发现的9,000种蛋白质上偶联的泛素或SUMO-1的提取物的能力。我们识别了122个蛋白质，这些蛋白质通过这些翻译后的修改器的结合标记了对DNR和/或ARA-C的抗性。基于此签名，我们定义了预测AML患者对标准CHEMAPER的反应的坚定评分。我们最终开发了一种小型化测定，允许轻松评估所选生物标记物的修改水平，并在患者细胞提取物中验证了它。因此，我们的工作确定了一种新型的基于泛素的生物标志物，可用于预测癌症患者对治疗的反应。
2025; 21（4）：1436-1458。 doi：10.7150/ijbs.109187研究论文SEC61G通过拮抗PGAM1泛素化和免疫M
背景：脑转移是非小细胞肺癌（NSCLC）死亡率的主要原因，但它们的分子机制尚不清楚。sec61g是SEC61转运的亚基，与肿瘤进展有关，但其在脑转移中的作用尚不清楚。本研究探讨了SEC61G如何通过推动代谢重编程和免疫微环境重塑来对脑转移造成贡献。方法：通过小鼠模型中的体内选择建立了脑部转移性NSCLC细胞系。sec61g表达。功能分析用于评估SEC61G在糖酵解，TLS形成和免疫相互作用中的作用，重点是SEC61G-PGAM1轴。使用药理学抑制剂和共培养系统来验证发现。结果：基于来自患者衍生的样品和小鼠模型的转录组数据，将SEC61G鉴定为脑转移中的关键上调基因。脑转移中的SEC61G表达较高，与晚期肿瘤阶段相关，NSCLC患者的存活率差。从机械上讲，SEC61G通过稳定关键的糖酵解酶PGAM1来促进脑转移。这是通过竞争性抑制PGAM1泛素化的新机制发生的：SEC61G直接拮抗E3泛素连接酶UBE3C，从而防止了PGAM1通过蛋白酶体途径降解。稳定的PGAM1增强了糖酵解和调节的氧化磷酸化，驱动了支持脑转移性定植的代谢重编程。此外，SEC61G通过促进小胶质细胞极化并抑制M1极化，重塑了肿瘤免疫微环境，并伴随着IL-6和IL-10的分泌增加。这些免疫作用取决于PGAM1，因为其药理抑制作用逆转了SEC61G诱导的M2极化并恢复了CD8 + T细胞浸润。体内和临床研究证实，脑转移中的Sec61g高表达与过量的M2小胶质细胞相关，免疫监测降低和患者结局差。免疫药物显示，跨三级淋巴结结构（TLS）成熟阶段的SEC61G表达梯度显着梯度：在TLS散布样品中，SEC61G水平最高，CD206 + CD206 +小胶质细胞浸润，中间的TLS中间，并且具有不成熟的TLS，并且在Mature Tls中较低。
泛素化和去泛素化
a 海南医学院基础医学与生命科学学院海南省干细胞研究院、海南省热带转化医学教育部重点实验室、海南省热带环境脑科学研究与转化重点实验室，海口 571199 b 香港理工大学工程学院生物医学工程系，香港，中国 c 海南医学院第二附属医院整形外科，海口 570100，中国 d 中科综合医疗转化中心研究院（海南）有限公司，海口 571199，中国 e 淄博市中医院药理科，淄博 255300，中国 f 济宁医学院临床医学院，济宁 272002，中国 g 海南省生物智能材料与生物医疗器械工程研究中心、海南省功能材料与分子影像重点实验室、海南省医学科学院急救与创伤学院海南医学院，海口 571199 h 海南医学院急救与创伤教育部重点实验室，海口市创伤重点实验室，海南省创伤与灾难救援重点实验室，海南医学院第一附属医院，海口 571199 i 海南医学院第二临床学院，海口 571199
基于KAN的混合深神经网络，用于准确鉴定转录因子结合位点
其他声明：利益冲突：RJB是Dian-Tu的董事和Dian和Dian-Tu-001试验的首席研究员。Unrelated to this study, for the DIAN-TU, he receives research support from the NIA, Eli Lilly and Company, F. Hoffman-La Roche, Ltd., Eisai, Alzheimer's Association, GHR Foundation, Anonymous Organization, DIAN-TU Pharma Consortium (Active Members: Biogen, Eisai, Eli Lilly and Company, Janssen, F. Hoffmann-La Roche, Ltd./genentech）。JH是Parabon Nanolabs，Roche，Prothena和Alzpath的付费顾问/顾问。 gyrh报告没有与这项工作直接相关的竞争利益。 他已经获得了CIHR，NIA/NIH的赠款或合同，是Biogen，Cassava和Lilly支持的临床试验研究人员，已参加了Biogen，Roche和Novonordisk支持的专家咨询委员会，并且是C5R（现任C5R联合会（Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadical Cognical Cognitial Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognitions Conseys））。 EMM从NIA获得赠款； Eisai Hoffmann-La Roche Eli Lilly的机构资助。 他是Alector的DSMB成员（直接付款）；伊利礼来科学顾问委员会成员（直接支付给我）为阿尔茨海默氏症的阿尔扎明。 他是Sage Therapeutics，Eli Lilly，Sanofi，Astrazeneca，Hoffmann La-Roche的顾问/顾问。 CC已获得GSK和EISAI的研究支持。 该研究的资助者在数据的收集，分析或解释中没有作用；在报告的写作中；或决定提交论文出版。 CC是循环基因组学顾问委员会的成员，并在这些公司中拥有股票。JH是Parabon Nanolabs，Roche，Prothena和Alzpath的付费顾问/顾问。gyrh报告没有与这项工作直接相关的竞争利益。他已经获得了CIHR，NIA/NIH的赠款或合同，是Biogen，Cassava和Lilly支持的临床试验研究人员，已参加了Biogen，Roche和Novonordisk支持的专家咨询委员会，并且是C5R（现任C5R联合会（Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadian of Canadical Cognical Cognitial Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognition Cognitions Conseys））。EMM从NIA获得赠款； Eisai Hoffmann-La Roche Eli Lilly的机构资助。他是Alector的DSMB成员（直接付款）；伊利礼来科学顾问委员会成员（直接支付给我）为阿尔茨海默氏症的阿尔扎明。他是Sage Therapeutics，Eli Lilly，Sanofi，Astrazeneca，Hoffmann La-Roche的顾问/顾问。 CC已获得GSK和EISAI的研究支持。 该研究的资助者在数据的收集，分析或解释中没有作用；在报告的写作中；或决定提交论文出版。 CC是循环基因组学顾问委员会的成员，并在这些公司中拥有股票。他是Sage Therapeutics，Eli Lilly，Sanofi，Astrazeneca，Hoffmann La-Roche的顾问/顾问。CC已获得GSK和EISAI的研究支持。该研究的资助者在数据的收集，分析或解释中没有作用；在报告的写作中；或决定提交论文出版。CC是循环基因组学顾问委员会的成员，并在这些公司中拥有股票。DP是Glaxosmithkline（GSK）的员工，并在GSK中持有库存。CX得到国家老化研究所（NIA）授予R01 AG067505和R01 AG053550的支持。所有其他作者都没有披露。JCM是弗里德曼（Friedman）杰出的神经病学教授，骑士ADRC副主任； Dian副主任和Dian的创始首席研究员。他由NIH赠款＃P30 AG066444资助； P01AG003991; P01AG026276;和U19 AG024904。他和他的家人都没有在任何药品或生物技术公司拥有股票或拥有股权（在共同基金或其他外部指示帐户之外）。TLSB拥有研究人员从NIH，阿尔茨海默氏症协会，Barnes-Jewish医院基金会和Avid Radiopharmaceuticals发起了研究资金。Benzinger博士参加了由Avid Radiopharmaceuticals，Eli Lilly and Company，Biogen，Eisai，Eisai，Jaansen和F. Hoffmann-La Roche Ltd的临床试验参与临床试验。AER报告没有竞争利益。他从美国国家老化研究所（R01AG053267，U19AG032438）收到了这项工作的研究支持。他从AMED获得了这项工作的研究支持（JP23DK0207066和JP23DK0207049）。GSD报告与这项工作直接相关的竞争利益。他的研究得到NIH的支持（K23AG064029，U01AG057195，U01NS120901，U19AG032438）。他是Parabon Nanolabs Inc的顾问，并担任动态（EBSCO）的主题编辑（痴呆症）。他是抗NMDAR脑炎临床试验的参与PI，该试验获得了Amgen Pharmaceuticals的支持，也是ARIALYS Therapeutics的顾问。他已经为Peerveriew Media，Inc和Consighating Education Inc.开发了教育材料。他拥有ANI Pharmaceuticals中的股票。DAR博士的机构已获得Eli Lilly的支持，以开发和参与教育事件，以促进
Cullin环泛素连接酶在心脏发育中的新作用
摘要：心脏发育是一个时空调节的过程，从胚胎阶段延伸到产后阶段。这种高度精心策划的过程的破坏会导致先天性心脏病或使心脏疾病或心脏衰竭使心脏易受。因此，对控制心脏发育的分子机制有深入的了解，对开发各种心脏疾病的创新疗法具有很大的希望。尽管已经取得了心脏发育的新型转录和表观遗传调节剂的重大进展，但探索影响这一过程的翻译后机制却滞后。culling环E3泛素连接酶（CRLS）是最大的泛素连接酶家族，控制约20％的细胞内蛋白的泛素化和降解。新兴证据发现了CRL在调节广泛的细胞，生理和病理过程中的关键作用。在这篇综述中，我们总结了有关CRL对心脏形态发生和成熟的多功能调节的最新发现，并呈现未来的观点，以促进我们对CRLS如何管理心脏发育过程的全面理解。
E3泛素蛋白连接酶lincr放大了tlr- ...
摘要：通过激活诸如MAP激酶和NF-κB信号途径等细胞内信号传导途径的激活，类似Toll样受体（TLR）诱导先天免疫反应，并在针对细菌或病毒感染的宿主防御中起重要作用。同时，TLR信号的过度激活导致各种炎症性疾病，包括自身免疫性疾病。TLR信号传导以平衡最佳免疫反应和炎症。但是，其平衡机制尚未完全理解。在这项研究中，我们将E3泛素连接酶lincr/ neurl3识别为TLR信号传导的关键调节剂。在有效的细胞中，因激动剂诱导的TLR3，TLR4和TLR5引起的JNK和p38 MAPK的持续激活显然被减弱。与这些观察结果一致，TLR诱导的一系列炎性细胞因子的产生显着减弱，这表明LINCR通过促进JNK和P38的激活来积极调节先天免疫反应。有趣的是，我们进一步的机械研究确定了MAP激酶的负调节剂MAPK磷酸酶-1（MKP1），是LINCR的泛素化靶标。因此，我们的结果表明，通过平衡LINCR（阳性调节剂）和MKP1（阴性调节器），TLR可以激活MAP激酶途径，这可能有助于诱导最佳免疫反应。
化学蛋白质组学揭示 USP5（泛素羧基...
摘要：基于质谱的有限蛋白水解化学蛋白质组学方法已成为识别和分析小分子 (SM) 与其蛋白质靶标之间相互作用的有力工具。Gracilioether A (GeA) 是一种从海绵中分离出来的聚酮化合物，我们旨在利用这种策略追踪其相互作用组。DARTS（药物亲和力响应靶标稳定性）和 t-LiP-MS（靶向有限蛋白水解质谱）代表了本研究中使用的主要技术。DARTS 应用于 HeLa 细胞裂解物以识别 GeA 靶蛋白，并使用 t-LiP-MS 研究蛋白质与 GeA 结合的区域。通过使用表面等离子体共振 (SPR) 的结合研究和计算机分子对接实验，结果得到了补充。泛素羧基末端水解酶 5 (USP5) 被确定为 GeA 的一个有希望的靶点，并解释了 USP5-GeA 复合物的相互作用特征。USP5 是一种参与蛋白质代谢途径的酶，通过将降解蛋白质上的多泛素链分解为泛素单体。这种活性与不同的细胞功能有关，包括染色质结构和受体的维持、异常蛋白质的降解和致癌进展。在此基础上，这些结构信息为后续研究开辟了道路，重点是确定 Gracilioether A 的生物学潜力以及基于新结构骨架合理开发新型 USP5 抑制剂。