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apobecs：我们的善变的朋友？
载脂蛋白B mRNA编辑催化多肽（APOBEC）家族指定多种胞苷脱氨酶。在哺乳动物中，至少5个基因编码Apobecs 1，2，3，4，而激活诱导的胞苷脱氨酶（AID）[1，2]。A1酶是第一个被重新认可的酶，并且在特定宿主mRNA的组织特异性编辑中起着至关重要的作用[3]，但是尚未确定在病毒基因的诱变中的确认作用。人类已经扩增了APOBEC3（A3）基因座，以产生7个成员：A3A，A3B，A3C，A3D，A3D，A3F，A3G，A3G和A3H。所有APOBEC蛋白似乎与单链RNA或DNA或两者都结合[1，2]。apo-bec酶在细胞学上脱氨酸单链核酸，导致C-TO-U突变。当这些突变发生在重复病毒的减去链上时，结果是病毒和链的g- to-a转变。由于这些过渡通常会导致胡说八道或误导性突变，因此基本病毒基因产物的合成被阻断，传染性颗粒产量下降[1，2]。在反应中，病毒产生多种基因，干扰A3蛋白的功能。通常，这些是蛋白质拮抗剂，包括HIV-1 VIF的众所周知的例子，它充当了E3连接酶诱导某些A3脱氨酸酶的蛋白酶体降解的适配器[4-7]。此示例提供了明确的证据，表明A3基因的功能是干扰病毒复制。A3s在淋巴样和髓样细胞中似乎以较高的量表示[8-10]，这表明这些酶是病毒入侵的前线防御者。然而，其他细胞类型（例如乳腺细胞）也表达A3 [11]。由于某些A3被包装到病毒颗粒中，因此，A3S的病毒体掺入为摄入牛奶传播病毒的新生儿提供了额外的概念。尽管逆转录病毒DNA的脱氨基可能是病毒抑制的主要机制，但已经观察到了脱氨基依赖性的APOBEC活性模式[12，13]。由于A3S与包装到病毒体中的单链RNA结合，因此这些脱氨酶为病毒DNA合成提供了路障[13-15]。A3G还与HIV-1反向转纹酶（RT）相互作用，以干扰DNA复制[16]。不同的APOBEC可能已经演变为允许与RT以外的逆转录病毒酶结合。A3酶也已显示可分别抑制含DNA和RNA的病毒，例如人乳头状瘤病毒和冠状病毒[13-15]。APOBEC与其他病毒聚合酶的结合将为阻断各种病毒的复制提供充足的机会。
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论文的主题
论文主题：BAP1/ASXLS复合物及其相互作用伙伴的生化和功能表征：对表观遗传调节，细胞周期控制和肿瘤抑制的影响。Affar博士的团队对表观遗传调节的复杂机制感兴趣，特别是与PolyComb组的蛋白质有关。BAP1/ASXLS复合物，表观遗传调节中的关键参与者是我们研究的核心。尽管它们的重要性，但仍然有很多事情可以发现BAP1/ASXLS蛋白如何促进表观遗传调节以及它们的放松管制如何影响癌症和其他疾病。使用先进的基因组学方法，生物信息学，蛋白质组学和小鼠遗传学（包括CRISPR/病例技术），我们旨在发现BAP1/ASXLS蛋白在表观遗传调节和癌症中的作用和机制。这个项目是在蛋白质组学，基因组学和细胞信号传导的最前沿学习方法和概念的绝佳机会。El Bachir Affar博士的研究团队旨在招募非常有动力的学生博士学位。候选人必须接受分子生物学，生物化学或生物医学科学或相关学科的培训，具有出色的注释，组织技能，并且对细胞信号传导和分子肿瘤学有生动的兴趣。年度奖学金28,000美元，有兴趣的候选人必须提交课程，大学笔记的陈述和单个PDF文档中的求职信，致为：El Bachir Affar，博士（El.bachir.affar@umontreal.ca） https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term= el%2C+Affar选择出版物：核链接氨基酸供应（Nature Comm 2021）https://pubmed.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/3488888888888888888888887888888715/肿瘤抑制BAP1（自然通讯2018）的去泛素酶活性工艺（自然通讯2020）https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33230107/自体泛素化保护肿瘤抑制BAP1免受胞质隔离的影响，由胞质隔离免受胞质的隔离，由dypical ubiquitin ubigitin ubase ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubeasual ubequel ubebase ubequarl ubequel ubequar ubequar ubequar ubequar ubequar ubequar ube ube 2014） https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24703950/
卵子黑色素瘤中遗传易感因子的功能基因组学表征
这项工作导致了这篇论文的起草是四年的果实，这将使我在职业和个人上都发展，而没有许多人的支持，参与和友谊，这是不可能的。我首先感谢U830，其导演奥利维尔·德拉特特（Olivier Delattre）及其所有成员，因为在这个研究部门中，我很荣幸能参与其中。也感谢Carole Drique和Keila Risal在我们的研究项目的管理中以及他们无瑕的友善中所做的至关重要的作用。我感谢我的论文委员会的所有成员，他们将通过他们的想法和我们的讨论参与了该项目的塑造，尤其是乔什·沃特（Josh Waterfall）博士，乔塞林·诺伊尔（Josselin Noirel）博士，乔塞林·诺伊尔（Josselin Noirel）博士，拉斐尔·玛格隆（Raphael Margueron）博士和奥利维尔·德拉特雷（Olivier Delattre）博士的所有建议和专业知识。以同样的方式，我要热烈地感谢那些同意参加我的论文陪审团的人，对安妮·鲍科克教授的特别认可以及劳菲·阿蒙达达蒂尔博士接受了本文论文的报告员的角色，以及罗伯特·巴洛蒂（Robert Ballotti），以及Jurgio jurgio Rosan Roman-Roman-Roman-Moman，他们是Siviners ore everman seviens is os Insemers，是该论文的主席。感谢Curie Institute的教学部门，欧洲计划H2020-MSCA IC-3I-PHD Cofund和癌症联盟的招聘和4年的支持。曾是我的导师，设计了这个项目，并以生动的兴趣紧随其后，并给了我所有的信心，我最真诚地感谢Marc-Henri。自从我开始在实验室开始以来，您的完美支持，您的专业知识，您的好奇心和科学热情对于实现我的工作至关重要。感谢您紧随该项目，以技术建议和丰富的观点进行装饰，同时也赋予我对我的日常工作以及这些结果的自由和自信，因为这种自由使我自治，自信，独立和独立。拥有鼓团队的所有成员，比同事更多，您是朋友。我不会掩饰让我写这些话的情绪。lenha，谢谢您在我开始团队时用手握住我，谢谢您的仁慈，您的耐心和您教给我的一切，因为正是您将我整合到这个团队中比任何人都多。dorine，当什么都没有进行，最好的办公室邻居时，您是必不可少的支持，最重要的是您发布的角色力量启发了我以榜样为例。Stéphane，除了我们的共同作品外，我们非常感谢我们的共同经验，您以您的利他主义，您的意志和您的自愿性为我标记了我。感谢您多次在我的知识中，当时什么都没有去实验室，以及您的所有支持。我也想到了曼农（Manon），她也参加了实验室的欢乐时刻，使我笑得如此多，并以她的善良为标志。对所有积极参与该项目的工作的人，我非常感谢您的智慧和您的工作，因为您的友谊和我们所有的喜悦时刻，这些都将始终如一地刻上：Manuel，Manuel，Olivier，Alexandre H.，Alexandre H.，Alexandre E.，感谢您的感谢，我对您的论文进行了衡量的效果，并且可以通过您的身份来衡量您的机会。与André，Thomas，Thibault，Tatiana，Anaïs，Agathe以及所有其他我不会忘记的所有其他人，这要归功于一切，每天都很容易上班，与您交流并付出最好的我自己。 感谢您的友善和利他主义，小亚历克斯（Alex），最佳的共同助手/共同的人，您的倾听和诚意，为您的所有轶事提供午餐的手册（尽管是Kimchi）（尽管是Kimchi）（即与André，Thomas，Thibault，Tatiana，Anaïs，Agathe以及所有其他我不会忘记的所有其他人，这要归功于一切，每天都很容易上班，与您交流并付出最好的我自己。感谢您的友善和利他主义，小亚历克斯（Alex），最佳的共同助手/共同的人，您的倾听和诚意，为您的所有轶事提供午餐的手册（尽管是Kimchi）（尽管是Kimchi）（即