MLSEQ是用于应用机器学习算法在下一代RNA-sequecting(RNA-SEQ)数据中应用的综合软件包。研究人员出于各种目的呼吁MLSEQ,其中包括疾病结果的预测,最佳特征子集(基因,转录本,其他同工型)的识别以及根据其预测重要性对特征进行分类。使用此软件包,研究人员可以上传其原始的RNA-seq计数数据,预处理数据并执行各种机器学习算法。预处理方法包括DESEQ平均值(TMM)归一化方法的DESEQ中值和修剪平均值,以及每毫米读取计数的对数(log-CPM),方差稳定转换(VST),正规化对数转换(RLOG)和方差模型在观察级别(voy)级别(voy)变换(voy)。归一化方法可用于纠正系统变化。转换方法可用于使离散的RNA-seq数据在层次上更接近微阵列,并进行基于微阵列的层化算法。当前,MLSEQ软件包包含90多个基于微阵列的分类器,包括最近开发的基于VOOM的判别分析分类器。除了这些分类器外,MLSEQ软件包还包括基于离散的分类器,例如Poisson线性判别分析(PLDA)和负二项式线性判别分析(NBLDA)。在预处理数据上,研究人员可以构建分类模型,对这些模型进行参数优化,评估模型性能并比较不同分类模型的性能。此外,可以通过构建模型预测测试样本的类标签。MLSEQ是用户友好,简单,目前是文献中针对RNA-Seq分类开发的最全面的软件包。要开始使用此软件包,用户需要上传其计数数据,其中包含每个样本映射到每个成绩单的读数数。可以从RNA-SEQ实验中获得此类计数数据,也可以从其他测序实验(例如芯片测序或元基因组测序)中获得。提出了此小插图,以指导研究人员如何使用此软件包。
Vistra (NYSE: VST) 是一家领先的财富 500 强综合零售电力和发电公司,总部位于德克萨斯州欧文市,为从加利福尼亚州到缅因州的客户、企业和社区提供必要的电力资源。Vistra 是美国最大的竞争性发电企业,发电容量约为 41,000 兆瓦,足以为 2000 万户家庭供电,在该国所有主要的竞争性批发市场运营。Vistra 是能源转型和扩张领域的领导者,始终专注于可靠性、可负担性和可持续性,由多元化的产品组合提供支持,包括天然气、核能、煤炭、太阳能和电池储能设施。该公司继续发展其零碳资源,运营着美国第二大竞争性核电站群、大量电池储能容量和越来越多的太阳能设施。Vistra 是美国最大的竞争性电力供应商之一,采用创新、以客户为中心的零售方式,提供满足客户需求的解决方案,包括 50 多个可再生能源计划。通过其零售品牌系列,Vistra 为大约 500 万住宅、商业和工业零售客户提供服务。作为负责任的国家能源供应转型的领导者,Vistra 在实现 2030 年和 2050 年目标方面取得了重大进展。该公司承诺到 2030 年将范围 1 和 2 温室气体排放量与 2010 年基线相比减少 60%,到 2050 年实现净零碳排放,前提是实现必要的技术进步和公共政策激励。详细了解我们的环境、社会和治理工作,并阅读公司的可持续发展报告,网址为 https://vistracorp.com/sustainability/。Vistra 勤奋的团队致力于实现其宗旨,“点亮生活,为更好的前进之路提供动力”,并遵循四项核心原则:我们以正确的方式开展业务,我们团队合作,我们竞争取胜,我们关心我们的利益相关者,包括我们的客户、我们工作和生活的社区、我们的员工和我们的投资者。[固定行]