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Vitis AI 3.0 网络研讨会问答
随着 Vitis AI 3.0 的发布，我们现在支持 YOLOv5、YOLOv6 和 YOLOX。我们的工程团队正在开发 YOLOv7 支持，YOLOv8 也将紧随其后。用户必须了解，这些模型的原始版本是根据 GNU 公共许可证 (GPL) 发布的。GPL 与 Vitis AI 不兼容，后者是根据更宽松的 Apache 2.0 许可证发布的。出于上述原因，我们不会在 Vitis AI Model Zoo 中发布我们的源模型。在商业应用中使用 GPL 源应由最终用户在产品化之前进行评估。我们确实会根据要求向用户提供我们的浮点模型和训练脚本作为源代码。请联系 amd_ai_mkt@amd.com 了解更多详细信息。
葡萄“Shine Muscat”中的 Cas9
转座因子的转座会影响插入/切除基因座内或附近的基因的表达水平、剪接和表观遗传状态以及功能。例如，在葡萄中，VvMYBA1 基因座的 VvMYBA1a 等位基因启动子区中 Gret1 逆转录转座子的存在抑制了用于花青素生物合成的 VvMYBA1 转录因子基因的表达，而这种转座子的插入是日本主要葡萄品种‘Shine Muscat’浆果果皮呈绿色的原因。为了证明葡萄基因组中的转座子可以通过基因组编辑去除，我们重点研究了 VvMYBA1a 等位基因中的 Gret1，作为 CRISPR/Cas9 介导的转座子去除的靶标。PCR 扩增和测序检测到 Gret1 消除了 45 株转基因植物中的 19 株的细胞。虽然我们尚未证实对葡萄果皮颜色有任何影响，但我们成功证明切割 Gret1 两端的长末端重复序列 (LTR) 可以有效消除转座子。
一种高效的基于原生质体的葡萄属基因组编辑方案
CRISPR-Cas 技术可以对植物基因组进行精确修改，有望彻底改变农业。这些技术依赖于将编辑组件递送到植物细胞中以及完全编辑的植物的再生。在无性繁殖植物（例如葡萄）中，原生质体培养是生产非嵌合和无转基因的基因组编辑植物的最佳途径之一。然而，原生质体再生植物的能力较差，阻碍了其在基因组编辑中的应用。在这里，我们报告了一种从多个葡萄品种的原生质体再生植物的有效方案。通过将原生质体封装在海藻酸钙珠中并与饲养层培养物共培养，原生质体分裂形成愈伤组织菌落，再生成胚胎并最终生成植物。该方案在酿酒葡萄和鲜食葡萄 (Vitis vinifera) 品种以及葡萄砧木和葡萄野生近缘种 Vitis arizonica 中均成功发挥作用。此外，通过用 CRISPR 质粒或核糖核蛋白 (RNP) 复合物转染原生质体，我们在三个品种和 V. arizonica 中再生了 VvPHYTOENE DESATURASE 基因经过编辑的白化植物。结果揭示了该平台在促进葡萄属物种基因组编辑方面的潜力。
野生葡萄藤的质体基因组学（Vitis Vinifera subsp。...
种类葡萄葡萄（常见的葡萄）分为两个子种：Vitis Vinifera subsp。vinifera（培养的葡萄）和Vitis Vinifera subsp。sylvestris（野葡萄）。Vitis Vinifera subsp。Vinifera广泛用于餐桌水果，并作为生产与葡萄相关饮料的主要来源，包括葡萄酒和醋。野葡萄（Vitis Vinifera subsp。sylvestris）引起了人们的极大兴趣，因为它们被认为是培养品种的祖细胞，并且是一般理解葡萄树驯化过程的关键。为了解锁葡萄藤驯化的分子机制，基于基因组的研究被广泛进行。在这项研究中，两个格鲁吉亚野生葡萄树样品的完整叶绿体基因组受到光照射测序和计算机基因组组装，然后进行基因注释。根据结果，每个分析的叶绿体基因组的长度为160.928 bp，共有128个基因（83个蛋白质编码，37个tRNA，8 rRNA），属于遗传上独特的“ rkatsiteli'rkatsiteli'haplotype（AAA）。一项比较基因组研究揭示了叶绿体基因组中某些插入和SNP的存在。
一种高效的基于原生质体的葡萄属植物基因组编辑方案
CRISPR-Cas 技术可以对植物基因组进行精确修改，有望彻底改变农业。这些技术依赖于将编辑组件递送到植物细胞中以及再生完全编辑的植物。在无性繁殖植物（例如葡萄）中，原生质体培养是生产非嵌合和无转基因的基因组编辑植物的最佳途径之一。然而，植物从原生质体再生能力较差，阻碍了其用于基因组编辑的实施。在这里，我们报告了一种从来自多个葡萄品种的原生质体再生植物的有效方案。通过将原生质体封装在海藻酸钙珠中并与饲养层培养物共培养，原生质体分裂形成愈伤组织菌落，再生成胚胎并最终再生为植物。该方案成功应用于酿酒葡萄和鲜食葡萄（Vitis vinifera）品种，以及葡萄砧木和葡萄树野生近缘种 Vitis arizonica。此外，通过用 CRISPR-质粒或核糖核蛋白 (RNP) 复合物转染原生质体，我们在三个品种和 V. arizonica 中再生了 VvPHYTOENE DESATURASE 基因经过编辑的白化植物。结果揭示了该平台在促进葡萄属物种基因组编辑方面的潜力。
VITIS ENERGY 从 BLACK MOUNTAIN ENERGY STORAGE 收购 200MW 能源存储项目
BMES 副总裁 Witt Duncan 表达了他对该项目的热情：“我们很高兴能够为 Vitis 提高美国电网可靠性和可持续性的努力做出贡献。Apache Hill 项目为 Vitis 提供了一个独特的机会，通过位于 ERCOT 系统内有利位置的先进开发项目来加快其上市时间。我们的团队在整个执行过程中无缝协作，我们期待看到该项目在需求增长空前的时代支持德克萨斯州的可靠电力供应。”
crispr/cas9介导的VVMLO3诱变会增强葡萄藤（Vitis Vinifera）对白粉病的耐药性
摘要葡萄（Vitis Vinifera）是世界上最重要的水果作物之一，遭受了白粉病的产量损失，这是由Erysiphe Necator引起的主要真菌疾病。除了抑制宿主免疫外，植物病原体还调节宿主蛋白所称为易感性因素以促进其在植物中的增殖。在这项研究中，CRISPR/CAS9（群集定期间隔短的短文重复序列/CRISPR相关9）技术用于使MLO的靶向诱变（霉菌抗性基因座O）家族基因被认为是粉状霉菌真菌的S因子。在两个或两个葡萄树Mlo基因VVMLO3和VVMLO4的等位基因中诱导的小缺失或插入，在粉状霉菌敏感的品种Thompson无生物的转基因植物中。使用不同的CRISPR/CAS9构建体获得的编辑效率从0％到38.5％不等。在获得的20个VVMlo3/4编辑的线中，一个是单个突变的纯合子，三个备有的双重突变，突变中有7个是杂合的，九个是嵌合，嵌合是嵌合，如每个线路中有两个以上突变的等位基因所示。在20个VVMLO3/4编辑的葡萄藤线中，有6条显示出正常的生长，而其余的线则表现出衰老样的氯症和坏死。重要的是，四个VVMLO3编辑线显示出对白粉病的耐药性，这与宿主细胞死亡，细胞壁的伴侣（CWA）和H 2 O 2积累有关。综上所述，我们的结果表明，CRISPR/CAS9基因组编辑技术可成功地用于诱导感兴趣基因的靶向突变，以提高经济重要性的特征，例如葡萄藤中的抗病性。
野生葡萄（Vitis Adenoclada）和驯化葡萄（“ Shine Muscat'）之间的分歧和杂交的基因组信号
1 1葡萄和葡萄酒研究所，广西农业科学学院，南宁530007，中国2个国家主要的保护和利用亚热带农用生物库，甘蔗生物学的主要实验室广东现代农业实验室，合成生物学的主要实验室，农业和农村事务部，农业基因组学研究所，中国农业科学院农业学院，深圳518000，中国518000，中国4 liuzhou水果生产技术指导站Feicui Liang，Zhuyifu Chen *相应的作者，电子邮件：xuxiaodong@caas.cn; 18977986390@163.com1葡萄和葡萄酒研究所，广西农业科学学院，南宁530007，中国2个国家主要的保护和利用亚热带农用生物库，甘蔗生物学的主要实验室广东现代农业实验室，合成生物学的主要实验室，农业和农村事务部，农业基因组学研究所，中国农业科学院农业学院，深圳518000，中国518000，中国4 liuzhou水果生产技术指导站Feicui Liang，Zhuyifu Chen *相应的作者，电子邮件：xuxiaodong@caas.cn; 18977986390@163.com