对放射疗法和化学疗法的晚期检测和有限的敏感性,5年的存活率小于5%。随着科学技术的发展,miRNA在癌症中的关键作用已得到证实。miRNA已迅速成为新型抗癌疗法发展的有希望的靶标。中,发现miR-107及其潜在的下游靶基因ZFPM2与各种癌症有关,但是对它们在胰腺癌中作用的研究仍然有限。它们具有改善胰腺癌早期检测和治疗中当前挑战的潜在价值。本文回顾了其他肿瘤中有关miR-107和ZFPM2的现有研究,旨在为胰腺癌的早期发现和靶向治疗提供新的见解。
远端基因座之间的相互作用,包括涉及增强子和启动子的相互作用,是哺乳动物基因调节的核心机制,但这些相互作用的蛋白质调节剂仍未确定。锌指转录因子Znf143/ZFP143被强烈牵涉到染色质相互作用的调节剂,在有或没有CTCF的情况下起作用。然而,Znf143/ZFP143在此过程中的作用及其功能,无论有或没有CTCF,都尚不清楚。在这里,我们使用双用途Degron/Imaging标签标记了CTCF和ZNF143/ZFP143,以组合其循环功能和彼此的效果。我们发现ZNF143/ZFP143在小鼠和人类细胞中没有一般循环功能,并且它在很大程度上独立于CTCF起作用。相反,ZNF143/ZFP143是具有极为稳定的染色质停留时间(> 20分钟)的必不可少且高度保守的转录因子,可调节线粒体和核糖体基因的重要子集。
转座因子 (TE) 占人类基因组的 50% 以上,许多转座因子在整个进化过程中被用来为基因表达网络提供调控功能。多种证据表明,这些网络由最大的 TE 控制家族——含 KRAB 的锌指蛋白 (KZFP) 进行微调。允许 TE 转录激活(称为“转转录”)的组织之一是成年人脑,但缺乏关于这一过程的程度及其对人脑发育的潜在贡献的全面研究。为了阐明发育中人脑的时空转转录组,我们分析了两个独立的 RNA 序列数据集,涵盖从受孕后八周到成年的 16 个大脑区域。我们揭示了独特的 KZFP:TE 转录谱,它定义了从产前晚期到产后早期的过渡,以及驱动神经发生相关基因表达的 TE 衍生的替代启动子的时空和细胞类型特异性激活。长读测序证实了这些 TE 驱动的异构体是神经源性转录本的重要贡献者。我们还通过实验表明,一个被选择的反义 L2 元素驱动时间蛋白从内质网中重新定位,这暗示了灵长类动物进化中存在新的 TE 依赖性蛋白功能。这项工作突出了时空 KZFP:TE 转录组的广泛动态性质及其在 TE 介导的基因组创新和神经典型人类大脑发育中的重要性。为了促进对这些时空基因和 TE 表达动态的交互式探索,我们提供了“Brain TExplorer”网络应用程序,供社区免费使用。
