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锌指核酸酶的应用
EXZACT™ 精准技术消除了植物基因组改造中的猜测。EXZACT™ 基于专有的锌指蛋白 (ZFP) 设计，是一种多功能且强大的工具包，可用于对植物进行靶向基因组改造。EXZACT™ 能够针对几乎任何 DNA 序列，从而使发现者和开发者能够快速准确地添加、删除或编辑基因。使用 EXZACT™，植物研究人员可以测试假设、开发遗传特性并将其引入植物，同时避免传统 DNA 工程工具带来的意外影响。EXZACT™ 加快了特性开发时间并降低了农产品成本，并为作物特性研发建立了新的行业标准。了解更多信息，请访问 www.exzactprecisiontechnology.com。
基因组编辑生物文件草案
bp：碱基对 CRISPR：成簇的规律间隔的短回文重复序列 Cas：CRISPR 相关系统 DNA：脱氧核糖核酸 DSB：双链断裂 GE：基因工程 GEd：基因编辑 EPA：环境保护法 HDR：同源定向修复 HR：同源重组 Indel：插入/删除 kbp：千碱基对 MN：巨核酸酶 NHEJ：非同源末端连接 nt：核苷酸 ODM：寡核苷酸定向诱变 PN：可编程核酸酶 rDNA：重组 DNA RGENs：RNA 引导的工程核酸酶 SSB：单链断裂 SDN：定点核酸酶 TALEN：转录激活因子样效应核酸酶 ZFN：锌指核酸酶 ZFP ：锌指蛋白
沉默基因可以降低胆固醇
在 Hepa 1-6 Pcsk9 tdTomato 细胞中进行的体外筛选表明，基于 ZFP 的 ETR 是 Pcsk9 表观沉默的最有效平台。a，左上角，用于比较 Hepa 1-6 Pcsk9 tdTomato 细胞系中不同 ETR 平台效率的实验程序图。右上角，Hepa 1-6 Pcsk9 tdTomato 细胞系的示意图，其中 TAV2A- tdTomato 盒式磁带以框架内的方式靶向 Pcsk9 的最后一个外显子。右下角，不同 ETR 平台的示意图，显示它们与 Pcsk9 启动子区域的 CGI 的相对结合。图片来源：Nature (2024)。DOI: 10.1038/s41586-024-07087-8
cliz：使用自适应微调数据预测为气候数据集优化有损压缩
摘要 - 从尖端的超级计算机中获得支持极大的科学模拟，气候研究在过去几十年中取得了显着发展。，在有效地存储和传输大规模的气候数据之间，出现了新的关键挑战。在本文中，我们开发了CLIZ，这是一种有效的在线错误控制有损压缩方法，具有优化的数据预测和对气候数据集跨各种气候模型的编码方法。一方面，我们探索了如何利用气候数据集的特定属性（例如蒙版信息，维度置换/融合和数据周期性模式）以提高数据预测准确性。另一方面，Cliz采用了一种新型的多霍夫曼编码方法，可以显着提高编码效率。因此显着提高了压缩比。我们根据具有不同模型的多个实地世界气候数据集评估了CLIZ与许多其他最先进的错误控制损耗压缩机（包括SZ3，ZFP，SPERR和QOZ）。实验表明，Cliz在气候数据集上的表现优于第二好的压缩机（SZ3，SPERR或QOZ1.1）的压缩比的压缩率高20％-200％。cliz可以将两个远程Globus终点之间的数据传输成本显着降低32％-38％。索引术语 - 错误控制的损耗压缩，气候数据集，分布式数据存储库/数据库
生命科学的基因组编辑革命∗
可编程的核酸酶 - ZFN，Talens和CRISPR-CAS9 - 配备了具有前所未有的能力，几乎可以随意修饰细胞和生物，在整个生命科学上都有巨大的暗示：生物学，农业，生态学和医学。基于核酸酶的基因组编辑（又称基因编辑）取决于对靶向双链断裂（DSB）的细胞反应。第一个真正可靶向的试剂是锌纤维NU-酸盐（ZFN），表明哺乳动物基因组中的任意DNA序列可以通过蛋白质工程来解决，并在基因组编辑时代介导。ZFN是锌纤维蛋白（ZFP）和FOKI裂解结构域的融合，这是由IIS型Foki型酶的基础研究产生的，该研究显示了具有可分离的DNA结合域和非特定型裂解的二重结构。对3-纤维ZFN的研究确定，预先经过的底物是配对的结合位点，这使目标识别序列的大小从9至18 bp的大小增加了一倍，足以指定植物和包括人类细胞在内的植物和哺乳动物细胞中的独特基因组基因源。随后，显示了ZFN诱导的DSB，可刺激青蛙卵中的同源性结合。基于与Foki裂解结构域融合的细菌故事的转录活化剂样核酸酶（Talens）扩大了能力。Zfn和Talens已成功地用于修改多种顽固的生物和细胞类型，这些生物和细胞类型既不是在先前证明了蛋白质工程的成功，否则很久以前就在CRISPR的到来之前很久。最近向细胞基因组传递靶向DSB的技术是RNA引导的核酸酶，如II型原核生物