抽象与教条相反,进化上年轻和动态基因可以编码基本功能。我们发现编码最丰富的昆虫转录因子的进化动态ZAD-ZNF基因比古代保守的ZAD-ZNF基因更有可能编码果蝇中的基本功能。我们专注于昵称ZAD-ZNF基因,该基因在进化上年轻,保留在果蝇物种中,并在强烈的阳性选择下进化。但是,我们发现在D. melanogaster中有必要进行幼虫发育。我们表明,昵称编码异染色质 - 定位蛋白(如其旁系同源物奇异果),这也是一种进化动态但必不可少的ZAD-ZNF基因。我们发现D. simulans昵称蛋白仍然可以定位于D. melanogaster异染色质,并挽救了女性的挽救生存能力,而不是男性昵称 - Null D. Melanogaster。我们的发现表明,用于快速变化的异染色质功能的创新通常可以解释昆虫中许多进化动态ZAD-ZNF基因的重要性。
锌指蛋白 (ZNF) 是一类独特而多样的蛋白质,在转录调控、染色质重塑、蛋白质/RNA 稳态和 DNA 修复等基本细胞机制中发挥着关键作用。因此,ZNF 蛋白的错误调节可导致多种人类疾病,从神经发育障碍到多种癌症。考虑到 DNA 损伤修复 (DDR) 抑制在临床上取得了良好的效果,作为同源重组 (HR) 缺陷患者的治疗策略,确定其他潜在的可靶向 DDR 蛋白作为耐药肿瘤细胞中出现的弱点至关重要,尤其是考虑到获得性耐药的负担时。重要的是,越来越多的研究确定了新的 ZNF 并揭示了它们在几种 DDR 通路中的重要性,凸显了它们作为 DDR 抑制疗法新靶点的巨大潜力。尽管如此,仍有许多未表征的含 ZNF 蛋白具有未知的生物学功能。在这篇综述中,我们重点介绍了哺乳动物细胞中 ZNF 蛋白的主要类别和观察到的生物学功能。我们简要介绍了众所周知和新发现的 ZNF,并描述了它们的分子作用以及对人类健康和疾病(尤其是癌症)的贡献。最后,我们讨论了 ZNF 在 DNA 修复机制中的重要性、它们在癌症治疗中的潜力以及利用 ZNF 蛋白作为人类疾病未来治疗靶点的进展。
抽象最近的工作与剪接体组件U2AF35的两个锌指(ZnF)的点突变与恶性转化有关。然而,令人惊讶的是,对U2AF35 ZNF域的功能知之甚少。在这里,我们分析了哺乳动物U2AF35的ZNF域及其旁系同源物U2AF26的关键功能。两个ZNF都是剪接调节所必需的,而仅ZNF2控制蛋白质稳定性,并有助于与U2AF65的相互作用。这些特征在缺乏ZnF2的U2AF26的自然存在的剪接变体中得到了证实,该变体在激活原代小鼠T细胞时强烈诱导并局部位于细胞质中。在模型T细胞系中使用Ribo-Seq我们为U2AF26在激活基因表达中的细胞质步骤中的作用提供了证据,尤其是翻译。一致地,MS2绑定测定法表明,当定位于模型mRNA的5 rtr时,细胞质U2AF26/35增加了翻译。该法规部分取决于Znf1,因此在核心剪接因子,ZNF域和翻译调节之间提供了联系。总的来说,我们的工作揭示了U2AF26/35及其ZNF领域的意外功能,从而有助于更好地理解其在哺乳动物细胞中的作用和调节。
图1-1:依赖性DNA连接酶结构域结构。对齐结构域的对齐。与DNA结合结构域(DBD,RED)一起突出显示了构成核心催化域的腺苷域和寡核苷酸结合(ob折,黄色)结构域。列出了每种蛋白质列出的活跃位点的位置。chvlig没有大的DBD,而是在OB折内包含一个小的20个氨基酸“闩锁”(闩锁,蓝色),可以帮助DNA结合。也为Lig3独有的锌指域(Znf,橙色)。n-和c末端蛋白质相互作用基序和细胞定位信号未显示。
CRISPR 技术简介:CRISPR、碱基编辑、主要编辑 基因编辑的目的是精确高效地将活细胞中的 DNA 序列转换成新的所需序列。可以使用多种内切酶切割 DNA,早期(并取得成功的)改造人类基因组的尝试使用了工程内切酶,例如转录激活因子样效应核酸酶 (TALEN) [ 7 ]、锌指核酸酶 (ZNF) [ 8 ],以及最近的成簇规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 与 CRISPR 相关蛋白 (Cas) 的结合。易于使用、成本效益高、能够进行多重基因组编辑,再加上 CRISPR/Cas 基因组编辑工具包的快速发展,引发了一场以 CRISPR/Cas 为中心的基因编辑革命,有望大大提高 T 细胞免疫疗法的疗效。CRISPR/Cas 核酸酶和衍生技术(如碱基编辑器和引物编辑器)极大地扩展了可能的基因组修饰范围,允许进行有针对性的基因插入、删除、碱基对转换或这些操作的组合 [ 9 ]。
摘要:设计师核酸酶的发现使基因组的编辑比以前更加有效。设计师核酸酶已被广泛用于机械研究,动物模型产生和基因治疗的发展。但是,潜在的靶标和宿主免疫反应是体内用途,尤其是临床应用仍需要解决问题。设计师核酸酶的短期表达对于降低两种风险是必要的。当前,正在开发各种递送方法,用于用于瞬时核酸酶的瞬时表达,包括锌指核酸酶(ZNF),转录激活剂样的效应核酸酶(TALEN)和定期间隔的短裂缝短底膜重复序列 / CRISPR与CRISPR相关(CRISPR / CAS)。最近,病毒样颗粒被用于基因编辑。在这篇综述中,我们将通过常用的基因组编辑核酸酶进行讨论,讨论基因编辑递送工具,并使用病毒样颗粒来回顾最新文献,以传递基因编辑效果。
抽象的广场荧光显微镜用于监测大脑神经元种群的峰值。广场荧光可以起源于皮质中所有深度的指标分子,而索马塔,树突和轴突的相对贡献通常是未知的。在这里,我模拟了广场照明和荧光收集,并确定几种GCAMP小鼠系的荧光的主要来源。散射强烈影响照明和收集。一个结果是,照明强度最大〜300-400 m以下,而不是在大脑表面。另一个是从皮质深处的荧光可能延伸到脑表面3–4 mm的直径,严重限制了横向分辨率。在许多小鼠线中,有助于荧光的组织体积延伸到大多数表面位置的整个皮层和荧光深度是多个皮质柱的加权平均值,通常是一个以上的皮质区域。