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Microsoft Word - Chemistry42_An_AI-based_platform_for_de_novo_molecular_design_rxiv.docx
Insilico Medicine 是一家开发用于靶标发现和生成化学的 AI 算法的公司，它是首批发布使用深度对抗模型生成新化合物的方法的团队之一（Kadurin、Aliper 等人2017 年）。从那时起，将生成算法与强化学习 (RL) 相结合的基于 DL 的架构已经得到开发并应用于化学和药理学，以生成具有预定义属性的新型分子结构。尤其令人鼓舞的是，活性分子从头设计方面的最新进展已在体外和体内试验中得到验证（Zhavoronkov 等人2019 年）。生成化学领域现在是增长最快的药物发现领域之一（Vanhaelen、Lin 和 Zhavoronkov 2020；Schneider 2018；Merk 等人2018）。Chemistry42™ 平台已在 Insilico Medicine 中被常规且成功地用于推动多个治疗领域的药物发现过程。在以下部分中，我们将描述 Chemistry42™ 平台的主要功能。
REINVENT 2.0 – 用于从头药物设计的 AI 工具
（2）Zhavoronkov，A.；伊万年科夫，Y.A.； Aliper，A.；维谢洛夫，M.S.；弗吉尼亚州阿拉丁斯基；阿拉丁斯卡娅，A.V.；弗吉尼亚州 Terentiev；波利科夫斯基，D.A.；库兹涅佐夫医学博士；阿萨杜拉耶夫，A.；沃尔科夫，Y.； Zholus，A.；沙亚赫梅托夫，R.R.；热布拉克，A.；米娜耶娃，L. I.；扎格里别尔尼，文学士；李，L. H.；索尔，R.；玛奇，D.；幸，L.；郭，T.； Aspuru-Guzik，A.深度学习能够快速识别有效的 DDR1 激酶抑制剂。纳特。生物技术。 2019，37（9），1038–1040。 https://doi.org/10.1038/s41587-019-0224-x。
衰老研究和健康寿命医学中的深度学习和生成人工智能
简介“人工智能”（AI）一词是在1956年的开创性达特茅斯会议上创造的[1]。虽然AI有多种定义，但《 2020年美国国家人工智能法》将其定义为基于机器的系统，对于给定的一组人为定义的目标，可以做出预测，尊重或决定影响真实或虚拟环境[2]。AI包括各种子场，包括机器学习（ML）和DL。图1说明了不同类型的AI及其功能和功能之间的分层关系。ML是指使计算机能够执行任务而无需明确指令的算法和统计模型，依赖于模式和推理[3]。dl是ML的子集，使用具有许多层（因此“深”）的神经网络来分析各种类型的数据[4]。dl于2015 - 2016年首次应用于A. Zhavoronkov的Group [5]，于2015 - 2016年将其发表深度衰老时钟（DAC）。从那时起，DL中的许多技术，例如生成对抗网络（GAN），大语言模型（LLM）和DeNoing扩散
衰老研究和健康寿命医学中的深度学习和生成人工智能
简介“人工智能”（AI）一词是在1956年的开创性达特茅斯会议上创造的[1]。虽然AI有多种定义，但《 2020年美国国家人工智能法》将其定义为基于机器的系统，对于给定的一组人为定义的目标，可以做出预测，尊重或决定影响真实或虚拟环境[2]。AI包括各种子场，包括机器学习（ML）和DL。图1说明了不同类型的AI及其功能和功能之间的分层关系。ML是指使计算机能够执行任务而无需明确指令的算法和统计模型，依赖于模式和推理[3]。dl是ML的子集，使用具有许多层（因此“深”）的神经网络来分析各种类型的数据[4]。dl于2015 - 2016年首次应用于A. Zhavoronkov的Group [5]，于2015 - 2016年将其发表深度衰老时钟（DAC）。从那时起，DL中的许多技术，例如生成对抗网络（GAN），大语言模型（LLM）和DeNoing扩散
教学情境中的生成式人工智能 - 学术申诉专员
11 阿尔凯西和麦克法兰，2023；阿塔鲁里等人。 2023；基督教 2023；法郎 2023；胡赛尼、拉斯穆森和雷斯尼克 2023；吉等人。 2023；基德和比尔汉 2023； Lee、Bubeck 和 Petro 2023；莱特曼等人。 2023；刘、张、梁 2023；梅加赫德等人。 2023；梅策、莫兰丁-雷斯、罗兰-梅策和弗洛林多 2023 年； OpenAI 2023 年 3 月 27 日；波里茨 2023；韦斯和梅斯 2023 年；威瑟 2023；张，等人。 2023；赵，等人。 2023； Zhavoronkov 2023。12 Busch 2023；电子隐私信息中心 2023；Huang 2023；Hosseini 和 Horbach 2023；Lauer、Constant 和 Wernimont 2023；Meskó 和 Topol 2023；美国国立卫生研究院 2023；Schwartz 和 Rogers 2022。13 请参阅 registrar.uky.edu/ferpa 和 registrar.uky.edu/ferpa/ferpa-faculty-and-staff-faq。14 请参阅 www.research.uky.edu/office-research-integrity。15 Bender、Gebru、McMillan-Major 和 Shmitchell 2021；Brown 等人 2020；Caliskan、Bryson 和 Narayanan 2017；Hovy 和 Prabhumoye 2021； Liang, Wu, Morency 和 Salakhutdinov 2021；Najibi 2020；Nazer 等人 2023；Nicholas 和 Bhatia 2023；Schwartz 等人 2022；Small 2023 年 7 月 4 日；Whittaker 等人 2019；Zhuo, Huang, Chen 和 Xing 2023。16 Appel、Neelbauer 和 Schweidel 2023；Lucchi 2023；Saveri 和 Butterick 2023；Sobel 2018；Strowel 2023；Thorbecke 2023；Zirpoli 2023。17 Chen, Zaharia 和 Zou 2023。
长寿生物技术：连接人工智能、生物标志物、老年科学和临床应用，实现健康长寿
Yu-xuan Lyu 1,2,* , qiang fu 3,4,* , dominic wick 6,125,* , kejun ying 7,* , Aaron King Kaya 13 , Andrea B. Maier 14 , Andrea Olsen 15 , Anja Groth 16 , Anna Katharina Simon 17,18 , Anne Brunet 19 , Aisyah Jamil 20 , Anton Kulaga 22 , Benjamin Yaden Örnumacher 25 , Boris DjordJervic 26,27 , Brian Kennedy 14 , Chieh Chen 28,29 , Christine Yuan Huang 30 , Christopph U. Correll 31,32 , Collin y. , Dariusz Sołdacki 40 , David Erritzoe 41 , David Meyer 25 , Sinclair 42 , Eduardo Nunesni 43 , Emma C. Teeling 48 , Evandro F. Fang 49 , Evelyne Bischof 50 , Evi M. Mercken 51 , Fabian Finger 52 , Folkert Kuipers , Frank W. Pun 54 , Gabor Gyünze , Gari Harold A. Pincus 59 , Joshua McClure 60 , James L. Kirkland 61 , James Peyer 62 , Jamie N. Justice 63 , Jan VIJG 64 , Jennifer R. Gruhn 65 , Jerry mlaughlin 66 , Joan Mannick , Joe Betts-Lacroix 70 , John M. Sedivy 71 , John R. Speakman 72 , Jordan Shlain 73 , Julia von Maltzahn 74 , Katrin I. Andreasson 75 , Krikaras fort 76 , Constantnus Palikaras for Feer 78 , Lene Juel Rasmussen 79 , Liesbeth M. Veenhoff 53 , Lisa Melton 80 , Luigi ferrucci 81 , Marco Quarta 82,83,84 , Maria Kval 85 , Maria Marinova 86 , Mark Gingel 89 , Milos Filipovic 90 , Mourad Topors 91 , Nataly Mitin 92 , Nawal Roy 93 , Nika Pintar 94 , NIR BARZILAI , ter O. Fedichev 98 , Petrina Kamya 99 , Pura Muñoz-Canoves 100 , Rafael de Cabo 101 , Richard Garagher 102 , Rob Konrad 103 , Roberto ripa 2 , Sabrina Bütttttttttttttttttttttttttttnner , Sebastian Brumeeier 107 , Sergey Jakimov 57 , Shan Luo 108 , Sharon Rosenzweig-Plipson 66 , Shih-Yin Tsai 109 , Stefanie Dimmeler 110 , Thomas R. , Tony Wyss-Coray 75 , toy finel 115 , tzispora strauss 116,117 , Vadyshev 7 , Valter D. song. Zo Sorsinino 14 , Vittorio Sebastiano 122 , Wenbin Li 123 , Yousin Suh 124 , Alex Zhavoronkov 20 , Morten Scheeketee-Knudensen 79 , Daniela Bakula
会议报告：衰老研究和药物发现
玛丽亚·泰森（Maria Thaysen）1，*，Sonmon-Bekker 2，Maria Burnet 11，Burnetary 11，Abbigail Buchwater 12， Luigi Ferrucci 20，Maria Florian 29，Riekelt H. H. Houtkooper 30，Sibylle Jager 31，Frank Jakch 32，Georges Janssens 30，Martin Borch Jensen 33， 39，Michael Kjaer 40，Guido Kroemer 41，Kai-Fu Lee 42，Jean-Marc Lemaitre 43，David Liaskos 44，Valter D. Longo 45，Yu-Xuan Lu 3，Michael R. Laura Nieder，Michael A. Petr 1.55，James A. Rando 58，Suresh Rattan 59，Christian G Olech 25，Trendelenburg 67，3：18，Eric Verdin 2，Jan Vijg 4，Rudi J.