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在生命的头三年中对肠道菌群的纵向研究：与学龄前年龄的问题行为和执行功能联系
早期生活是一个敏感时期，当微生物群 - 脑相互作用可能对发展产生重要影响。这项研究调查了肠道微生物群在生命的头三年（两年，六个和12周，一年和三年）与n = 64个三岁儿童的问题行为和执行功能有关。链球菌在两周时的相对丰度较高，以及随着时间的推移（包括二，六周和12周以及一年和三年）的轨迹，与执行功能较差有关。[Ruminococcus]三岁的[Ruminococcus] torques组的相对丰度及其轨迹从一到三岁，与内在的行为较少有关。此外，还确定了几个健壮的年龄特异性关联：较高的双歧杆菌相对丰度（三岁）与更多内在化和外在化问题有关；较高的Blautia相对丰度（三岁）与较少的内在行为有关。不鉴定的肠杆菌科（两周）的相对丰度增加与更外在的行为有关。我们的发现提供了重要的纵向证据，表明早期肠道微生物群可能与低风险儿童的行为和认知发展有关。
肠道轴：研究肠道菌群的肠道菌群和大胆的幽灵
肠道菌群营养不良与多种自身免疫性疾病和炎症性皮肤病理相关。本研究是一项叙述性综述，旨在检查肠道菌群和大胆pemphigoid患者的肠道菌群失调，探讨这些改变如何有助于疾病的发育和/或进展。Significant alterations in the composition of intestinal micro biota were identified in patients with pemphigus and bullous pemphigoid: reduction in short-chain fatty acid-producing bacteria: Faecalibac terium prausnitzii, Lachnospiraceae and Coprococcus spp., which are known for their anti-inflammatory effects, and increased abundance of Escherichia大肠杆菌，Shigella spp。，Klebsiella spp。，Bacteroides Fragilis和Flavonifractor spp。，它们因其促炎的影响而被认可。肠道菌群的组成可能会影响自身免疫性大胆疾病的发病机理。修饰的细菌水平可能成为检测高危个体，监测疾病进展并预测对治疗反应的创新生物标志物。此外，调节细菌水平可能对减少炎症和疾病的进步具有治疗作用，并将其作为未来的治疗策略。
通过饲养gilthead Sea Bream（Sparus aurata）中的库存密度和氧气可利用皮肤和肠道菌群的差异重塑：一种行为和基于网络的集成方法
Abstract: Fish were kept for six weeks at three different initial stocking densities and water O 2 concentrations (low-LD, 8.5 kg/m 3 and 95–70% O 2 saturation; medium-MD, 17 kg/m 3 and 55–75% O 2 saturation; high-HD, 25 kg/m 3 and 60–45% O 2 saturation), with water temperature increasing from 19 ◦ C to 26–27 ◦ C. The improvement in growth performance随着库存密度的降低，与皮肤和肠粘膜微生物组的变化有关。微生物组组成的变化在皮肤中较高，而高清鱼类中拟南天异和马西里亚的丰度增加。然而，这些细菌属是互斥的，拟南芥的丰度与通过肝GH/IGF系统的反应性行为和全身生长调节有关，而Massilia与主动行为以及对肌肉而不是肝脏的生长调节过渡相关。在肠道水平上，微生物的丰度显示出两个细菌分类群的相反趋势，使雷氏菌的丰度低，而高清鱼中的prauserella含量很高。这种趋势与上调的宿主基因表达相关，影响免疫反应，上皮细胞更新和非生物应激反应。大多数观察到的反应本质上都是适应性的，它们将推断出新的福利指标，以提高压力弹性。
TreePólya拆分分布用于多元计数数据
在本文中，我们开发了一个新的多元分布，该分布适用于计数数据，称为树p´olya拆分。该类是由沿固定分区树的单变量分布和单数多变量分布的组合而产生的。已知的分布，包括Dirichlet-Multinomial，广义的Dirichlet-Multinomial和Dirichlet-Tree多项式，是此类中的特殊情况。正如我们将要证明的那样，这些分布是灵活的，可以在观测水平上建模复杂的依赖性结构（正，负或空）。具体来说，我们通过主要关注边缘分布，段落矩和依赖性结构（协方差和相关性）来介绍树p´olya分裂分布的理论特性。A dataset of abundance of Trichoptera is used, on one hand, as a benchmark to illustrate the theoretical properties developed in this article, and on the other hand, to demonstrate the interest of these types of models, notably by comparing them to other approaches for fitting multivariate data, such as the Poisson-lognormal model in ecology or singular multivariate distributions used in microbiome.
高频环境DNA元法编码可快速有效地监测鱼类社区动力学
fi g u r e 2 edna测序读数的变化（Hellinger被改造并用作代理人的丰度），用于包括（A）Lee河和（B）Richmond Lock的Thames Sites的鱼类的鱼类。颜色强度和较大的点都表明了测序读数的丰度。丰富性基于3个生物学重复中的2种中存在的物种。
肿瘤内微生物群调节肾上腺皮质癌对Mitotane
浸润菌群代表实体瘤微环境的新型细胞成分，可以影响肿瘤进展和对治疗的反应。肾上腺皮质癌（ACC）是一种罕见且侵略性的内分泌恶性肿瘤，米托烷（MTT）治疗代表一线治疗，尽管其疗效仅限于治疗窗口水平（14-20 mg/L）。迫切需要预测那些能够从MTT治疗中受益的患者的新颖标记以改善患者的管理。我们研究的目的是评估26种人类ACC组织中肿瘤内细菌菌群DNA的存在与9个健康肾上腺；此外，还探索了相对细菌组成谱，肿瘤质量特征和在治疗早期达到高循环水平的MTT能力之间的关联。我们发现在肿瘤和健康皮质标本的所有肾上腺样品中都存在细菌DNA，记录了恶性肿瘤和正常肾上腺之间微生物组成的显着差异：详细说明，ACC组织的特征是较高的proteeobacteria the Proteeobacteria the Proteebacteria the Proteudobobacteria（尤其是Pseudomonanas and serratia and serratia nersa and serratia enera）。此外，蛋白质细菌的低丰度与肿瘤大小，Ki67和皮质醇分泌负相关。MTT水平在9个月的时间较高的蛋白质细菌，假单胞菌和颈椎的ACC患者中达到较高的水平，并且杆菌，Firmicutes和链球菌的丰度较低。这些发现是第一个迹象表明，人类ACC的特征是细菌浸润，其特定的丰度概况似乎会影响9个月时循环MTT水平的增加。
评估16S-ITS-23S操纵子测序的效率
使用0.01％的相对丰度截止的应用导致大多数物种级分类方法的提高F1得分（图。3a.i）。值得注意的是，在ATCC模拟社区的情况下，四种MM方法中的三种，MM_Fangorn-G，MM_Fangorn-R和MM_MIRROR在ONT和PACBIO数据集中均显示出大幅度的F1分数。但是，对于MCAP和MCGD社区，仅在ONT数据集中观察到这一显着增加。专门应用于PACBIO数据的QB方法在ATCC社区的所有五个相对丰度截止值中保持了一致的F1分数。但是，对于MCAP和MCGD社区的相同方法最初在NO（0％）和0.001％的截止值下表现出一致的F1分数，随后逐渐下降了0.001％的临界值。通常，在三个模拟社区中，相对丰度截止的实施没有
尼日利亚博尔诺州立大学Maiduguri科学学院
摘要这项研究调查了尼日利亚东北部Yobe State Adansonia物种的丰度和分布。采用了一种目的的抽样方法，将研究区域分为20个大小的四倍（100x100m至500x500m），由物种区域的关系和图形绘图确定。在每个四边形内进行了物种识别和枚举，产生了791棵树。结果表明，Adansonia digitata（775个人）和乞力马纳（Adansonia Kilima）（16个个体）是研究Quadrats地区仅有的两个物种，与先前的研究一致，表明它们在撒哈拉以南非洲地区的独家存在。频率分析表明，Adansonia digitata在所有20个中均表现出100％的存在，而Adansonia kilima在6个四边形中占30％。物种区域曲线表现出四边形的大小和树木丰度之间存在正相关关系，表明较大的区域支持更多的物种。这一发现对保护工作具有重要意义，强调了保护更大领域以维持生物多样性的必要性。该研究的结果对了解尼日利亚东北部的阿丁森氏菌种类多样性和丰度做出了重大贡献。这些发现为保护和管理努力提供了宝贵的见解，强调了保护其余的Adansonia物种及其栖息地的重要性。此外，这项研究强调了对影响adansonia物种的生态和环境因素的持续研究的必要性。该研究的方法和发现对尼日利亚东北部的阿丁森氏症种类制定有效的保护策略具有影响。结果也有助于更广泛地理解撒哈拉以南非洲阿丁森氏症物种的多样性和丰富性。通讯作者：Yahaya Ishaya Kuku，电子邮件：kukuishaya@yahoo.com尼日利亚尼日利亚国防学院地理部，尼日利亚卡杜纳
路易体疾病导致人类大脑中的 m6A mRNA 甲基化被破坏
图3 脑区以及健康老年人、PD、DLB 和 MCI 组织中 m 6 A 修饰 RNA 和 YTHDF1 及 YTHDF3 读取蛋白丰度变化的热图。m 6 A 修饰 RNA 丰度以及 YTHDF1 和 YTHDF3 表达在各个区域和疾病类别中红色增加、黄色正常、绿色减少。与健康对照组织相比，发现 DLB 组织在所有脑组织区域中 m 6 A 修饰 RNA 丰度持续增加，并且 YTHDF1 和 YTHDF3 表达普遍增加。相反，PD 组织在三个脑区中显示 m 6 A 修饰 RNA 显著减少，并且 YTHDF 读取蛋白表达没有一致的变化模式。DLB，路易体痴呆；MCI，轻度认知障碍；PD，帕金森病。