ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。 腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。 意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。 These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。 迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。 在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。 相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。 这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。
摘要 转移 RNA (tRNA) 在蛋白质生物合成中起着核心作用。转录后 RNA 修饰影响 tRNA 的功能和稳定性。在这些修饰中,RNA 编辑是生命三个领域中广泛存在的 RNA 修饰。作用于 tRNA 的腺苷脱氨酶 (ADAT) 家族的蛋白质是在 20 多年前发现的。它们在 tRNA 成熟过程中催化腺苷脱氨为肌苷 (A - 到 - I) 或胞苷脱氨为尿苷 (C - 到 - U)。研究最多的例子是原核或真核 tRNA 反密码子中 tRNA 摆动位置的 TadA 或 ADAT2 / 3 介导的 A - 到 - I 转换。本综述提供了有关不同生命领域中 tRNA 的 A 到 I 和 C 到 U 编辑的详细信息,介绍了有关 DNA 编辑的 ADAT 的最新发现,最后评论了 ADAT3 基因突变与智力障碍之间的关联。
核酸纳米结构的自组装是由寡核苷酸模块通过互补序列之间的碱基配对选择性结合所驱动的。本文,我们报告了在腺苷配体控制下有条件组装的 RNA-DNA 混合纳米形状的开发。纳米形状的设计概念依赖于 DNA 适体的配体依赖性稳定,DNA 适体充当边缘稳定的 RNA 角模块之间的连接器。配体依赖性 RNA-DNA 纳米形状通过将腺苷结合与圆形闭合结构的形成相结合,在全有或全无的过程中进行自组装,这些结构通过在所得多边形中的连续碱基堆叠来稳定。通过筛选各种 DNA 适体构建体与 RNA 角模块的组合以形成稳定的复合物,我们确定了腺苷依赖性纳米方块,其形状通过原子力显微镜确认。作为传感器应用的概念验证,通过 DNA 适体成分的染料结合获得了对腺苷有响应的 FRET 活性纳米方块。
使用外源性向导 RNA 招募内源性腺苷脱氨酶来编辑细胞 RNA 是一种有前途的治疗策略,但使用当前的向导 RNA 设计,编辑效率和持久性仍然很低。我们设计了环状 ADAR 招募向导 RNA (cadRNA),以实现更高效的可编程 A-to-I RNA 编辑,而无需同时递送任何外源性蛋白质。使用这些 cadRNA,我们观察到在多个位点和细胞系中,在 RNA 的非翻译区和编码区中,都有稳健而持久的 RNA 编辑,并且具有高转录组特异性。此外,我们通过在反义域中整合散布的环路来增加靶腺苷的转录水平特异性,从而减少旁观者编辑。通过腺相关病毒在体内递送 cadRNA,可使 C57BL/6J 小鼠肝脏中的 mPCSK9 转录本实现 53% 的 RNA 编辑,并使 IDUA-W392X 小鼠 I 型黏多糖贮积症模型中的琥珀色无义突变实现 12% 的 UAG-UGG RNA 校正
小球形头足动物通过腺苷脱氨基表现出异常广泛的mRNA,但尚不清楚基本机制。由于作用于RNA(ADAR)酶的腺苷脱氨酶会催化这种形式的RNA编辑,因此头足类直系同源物的结构和功能可能会提供线索。最近的基因组测序项目提供了蓝图,以全面互补。我们实验室的先前结果表明,Squid表达了一个ADAR2同源物,具有两个名为SQADAR2A和SQADAR2B的剪接变体,并且这些消息经过广泛编辑。基于章鱼和鱿鱼基因组,转录组和cDNA克隆,我们发现在小卵形中表达了另外两个ADAR同源物。第一个与脊椎动物ADAR1直系同源。与其他ADAR1不同,它包含一个新型的N末端结构域,为641 AA,预测为无序,包含67个磷酸化基序,并且具有氨基酸组成,丝氨酸和碱性氨基酸的氨基酸组成异常高。编码sqadar1的mRNA本身是广泛编辑的。也存在于任何脊椎动物同工型的直系同源的sqadar/d-like酶。编码SQADAR/D类的消息未编辑。使用重组SQADAR的研究表明,仅在完美的双链dsRNA和鱿鱼钾通道mRNA底物上,只有SQADAR1和SQADAR2是活跃的腺苷脱氨酶。sqadar/d样对这些底物没有活性。对这些底物没有活性。总体而言,这些结果揭示了SQADARS中的一些独特特征,这些特征可能会导致头足类动物中观察到的高级RNA回收。
抽象的嘌呤能受体在中枢神经系统(CNS)中起重要作用。这些受体参与调节神经元,小胶质细胞和星形胶质细胞功能的细胞神经燃料反应。基于其内源配体,将嘌呤能受体分类为P1或腺苷,P2X和P2Y受体。在脑损伤或病理条件下,细胞外三磷酸腺苷(ATP)或尿苷三磷酸(UTP)从受损细胞中快速扩散,促进小胶质细胞的激活,从而导致这些受体在大脑中表达的变化。具有选择性正电子发射断层扫描(PET)放射性体的嘌呤能受体的成像,使我们对这些受体中某些受体在健康和患病的大脑中的功能作用有了我们的理解。在这篇综述中,我们已确保了当前可用的果虾能受体的PET放射线列表,这些PET受体用于阐明受体功能和参与中枢神经系统疾病。我们还审查了缺乏放射性示意剂的受体,为未来的新型PET放射性物体奠定了基础,以揭示这些受体在中枢神经系统疾病中的作用。
嘌呤能系统包括P1和P2受体,这些受体被ATP及其代谢产物激活。它们在成人神经元和神经胶质细胞中表达,在脑功能上至关重要,包括神经调节和神经元信号传导。作为P1和P2受体在整个胚胎发生和发育中都表达,纯净信号传导在周围和中枢神经系统的发展中也具有重要作用。在这篇综述中,我们介绍了嘌呤能受体的表达模式和活性及其在神经系统的胚胎和产后发育期间的信号传导方式的表达模式和活性。特别是,我们回顾了嘌呤能信号传导的参与,在大脑发育的所有关键步骤中,即在神经干细胞增殖,神经元分化和迁移以及星形胶质生成和少突胶质发生中。然后,我们回顾了显示ATP和腺苷信号通路在形成周围神经肌肉连接以及中央GABA能和谷氨酸盐突触中的关键作用的数据。最后,我们研究了开发过程中嘌呤能系统放松管制的后果,并讨论了在成人阶段靶向其在ATP和ATP和腺苷途径重新激活的疾病中的治疗潜力。
作为氮酶。ATP的16个分子(ATP =三磷酸腺苷,一种能量存储化合物)代表BNF反应发生所需的能量。形成氨(NH 3),它被转化为氨基酸,例如谷氨酰胺。氨基酸中的氮可以用于植物合成蛋白质的生长和发育。
三磷酸腺苷结合盒(ABC)转运蛋白,例如多药耐药蛋白1(MRP1),通过在质膜上输出异种化合物来预防细胞毒性。然而,构型MRP1功能阻碍了某些癌症的血脑屏障递送,而MRP1过表达导致获得的多药耐药性和化学疗法衰竭。小分子抑制剂具有阻断底物运输的潜力,但很少显示MRP1的特异性。在这里,我们鉴定出一种名为CPI1的大环肽,该肽抑制了MRP1,但显示出对相关多药物多糖转运蛋白P-糖蛋白的最小抑制作用。在3.27Å分辨率下的冷冻电子显微镜(冷冻EM)结构表明,CPI1与生理底物白细胞三烯C4(LTC 4)在同一位置结合MRP1。与两个配体相互作用的残基都包含大型,柔性的侧链,它们可以形成各种相互作用,揭示了MRP1如何识别多个结构无关的分子。CPI1结合可以防止三磷酸腺苷(ATP)水解和底物转运所需的构象变化,这表明它可能具有作为治疗候选者的潜力。
AMP腺苷单磷酸HBD氢键供体6-APA 6-氨基酸氨基酸HPLC高性能液体液体液体ATP ATP三磷酸腺苷色谱cns中枢神经系统IND研究对dagycyl-dycyl-applicatition dna dna dna dna dna deoxybibonuciity ipoxyl ipoxyl i oxylir ipoxyl imoxyl troffsyl trofffriffiend inosivir triffsixy dmshthe dmetherty dmeththe dmeththe dmeththents dmeththents posphide磷酸盐涂鸦磷酸化。静脉内EGF表皮生长因子MAOI单胺氧化酶抑制剂EGF-R表皮生长因子mRNA Messenger RNA受体NDA新药物施用EP酶结合的产物NMR核磁共振与酶 - 基层酶(酶)酶 - 基层酶(复杂)pip2 pip2 pip2 PLC phospholipase C GCP good clinical practice QSAR quantitative structure-activity GDP guanosine diphosphate relationship GLP good laboratory practice RNA ribonucleic acid GMP good manufacturing practice rRNA ribosomal RNA GTP guanosine triphosphate SAR structure-activity relationship HBA hydrogen bond acceptor tRNA transport RNA