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基因组级别的八分化 -
摘要古老的茶厂是珍贵的自然资源和茶叶遗传多样性的来源，对于研究植物的进化机制，多样化和驯化而具有巨大的价值。古老的茶叶植物之间的总体遗传多样性以及自然选择期间发生的遗传变化仍然很少理解。在这里，我们报告了由120个古代茶厂组成的八个不同群体的基因组重新陈述：来自吉州省的六组和云南省的两个团体。基于8,082,370个鉴定的高质量SNP，我们构建了系统发育关系，评估了种群结构并进行了全基因组关联研究（GWAS）。我们的系统发育分析表明，120个古老的茶厂主要聚集在三组和五个单个分支中，这与主成分分析（PCA）的结果一致。基于遗传结构分析，将古老的茶水进一步分为七个亚群。此外，发现古老的茶叶植物的变化不会因外部自然环境或人工育种的压力而降低（非同义/同义词= 1.05）。通过整合GWA，选择信号和基因功能预测，四个候选基因与三个叶片性状显着相关，并且两个候选基因与植物类型显着相关。这些候选基因可用于进一步的功能表征和茶植物的遗传改善。
药用层孔菌 (Fomitopsis officinalis) 蘑菇：古老的金矿......
作者 WA Elkhateeb · 2019 · 被引用 14 次 — 真菌 b-葡聚糖通过 dectin-1 在宿主防御信号传导中的免疫调节。Biomol Therapeut 2012；20：433–445。15 Yang Y、Zhao X、Li J、Jiang H、Shan X、Wang ...
对古代基因组研究的社会文化见解
摘要在过去的十年中从古代样品中获得的序列数据量大大扩展，因此现在可以使用古代DNA解决的问题类型。在人类历史领域，虽然古代DNA为有关人的主要运动的长期辩论提供了答案，但它最近也开始为人类经验的其他重要方面提供信息。该领域现在主要从主要固定大规模上区域研究转变为还采用更本地的观点，阐明了社会经济过程，遗产规则，婚姻实践和技术扩散。在这篇综述中，我们总结了最近的研究，展示了这些类型的见解，重点是用于推断人类行为的社会文化方面的方法。这通常涉及跨学科的工作，直到最近才发展为分离。我们认为，多学科对话对于对人类历史的更融合和更丰富的重建至关重要，因为它可以产生有关过去社会，生殖行为甚至生活方式习惯的非凡见解，而这些习惯也无法获得其他可能获得。引言近年来，考古学领域为古代迁移的时机和组成以及它们如何塑造当今的人类多样性1-3提供了新的启示。多亏了提取和测序古代DNA（ADNA）方法的爆炸性改进，可用的古代基因组的数量从十年前的不到5年就增加到了3,000多个。在世纪之交，ADNA提取技术的改进提高了前景生物信息学和种群遗传推断的进一步改善也有助于从这些基因组中提取宝贵的信息，包括人口增长和收缩的模式，远距离相关组之间的杂交以及在表型重要的基因座上运行的自然选择的证据4,5。古代DNA还为考古学上的长期辩论提供了信息，包括“ Demic” 6-8的作用与“文化”扩散9在技术传播中的作用。在1970年代和1980年代，分子研究和统计迁移模型的出现重点是人口运动作为技术扩张的驱动力，例如农业的传播10。相比之下，许多考古学家倾向于极大地减少如果不简单地否认过去迁移的存在和影响11。
三叠纪生活：古代两栖动物，鳄鱼亲戚，早期恐龙和哺乳动物祖先的概述
从Staatliches博物馆fürnaturkundeStuttgart（SMNS）收藏I.来自上奥列内基（A – C）和下Anisian（DF）的标本。A. parotosuchus nasutus（SMNS 5776），下solling fm。B. trematosaurus brauni（SMNS 6207a），下solling fm。C。Rhynchosauroides？schochardti，凸低音（SMNS未经致电），中部Buntsandstein。D. Chirotherium barthii，凸低音（SMNS 4228），上部Solling FM。（Thüringischerchirotheriensandstein）。E. Marcianosuchus angustifrons（SMNS 91318，全型），RötFm。F. Rhynchosauroides ISP。（rhy）和Procolophonichnium（Pro），凸低音（SMNS 51514），Vossenveld FM。信用：地球科学评论（2025）。doi：10.1016/j.earscirev.2025.105085
古代人类口腔微生物组研究范围5000年的广泛考古牙科牙科数据集
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。是
古代DNA分析的移动实验室
1联合埃科 - 人类学，民族自然历史缪斯，CNRS，典范巴黎迪德罗特大学，巴黎，法国，法国，2 Uniess-Lille，文化与传播的Ministo，CNRS UMR 8164历史，历史，Arche的学，Arche'olge and of Frances，France，France，France，3 unpe of Frase，france，france of France，france of France of France of France of Frase，H。 Perpignan大学通过Domitia，欧洲tautavel，Tautavel，法国Tautavel的欧洲历史研究中心，第4届Cole d'Inogeurs de pervan，Toulouse国家理工学院，图卢兹，图卢兹，5修改，图卢伊斯，图鲁斯·贝斯特里夫人，夫人和狂欢的实验室。出发，前历史人物的自然历史（HNHP），国家自然历史缪斯，CNRS UMR 7194，巴黎，法国，法国，8 CNRS UMR 7041，Maison de L'Arche´ology and Perthnology，Nanterre，Nanterre。法国，9 Universite的巴黎 - 萨克莱，CEA，CNR，CNRS，细胞综合生物学研究所（I2BC），GIF-SUR-YVETTE，法国，法国
也门DNA揭示了与黎凡特，阿拉伯和东非的古老联系 AI预测药物开发受体的3D结构 合成无定形金属的新方法 欧洲人信任科学吗？新调查说“是的，但是...' “有毒男性技术”有望更快的蚊子种群生物防治 AI帮助科学家发现威胁英国湖泊生物多样性的顶级污染物 气候变化驱动蜥蜴的“生活成本”挤压 新昆虫物种突出显示科索沃生物多样性热点 AI和科学家团结起来破译由Vesuvius火山烧毁的旧卷轴 倡议要求全球合作重建过去1亿年的气氛 古代气候重建阐明了未来的海洋动力学 AI驱动的订阅模型RESHAPE零售领域，新研究找到 微藻的隐藏潜力：可持续碳捕获和行业的关键 环保墨水在3D打印中扩展了石墨烯的潜力 地球的早期周期如何塑造生命的化学 给粒子检测器一个提升：新设备的作用就像超导性开关 科学家展示了怀孕如何以无数的方式改变大脑 crispr/cas9介导的橡胶蒲公英二氨蛋白生物合成的靶向诱变 微生物会影响珊瑚漂白易感性，新研究显示 磁性纳米催化剂通过电子密度调节增强肿瘤处理 新芯片以轻速打开AI计算的门 无权手动，更安全的DNA处理的语音激活系统
沿海地区在这项研究中表现出更强的非洲混合物，而北部也门也门地区的北部地区表明与阿拉伯和黎凡特有更紧密的遗传关系。在也门漫长而持续的内战中，这项研究发现，沿海和内陆分裂的历史基因组起源不同，这与当前冲突的划分线相处。
科学家揭示黄石温泉中古代生命的新发现
作者比较了海螺泉和章鱼泉微生物中发现的呼吸基因。适应极低氧水平的基因“高度表达”，这意味着它们在海螺泉中更活跃。相反，章鱼泉中的生物体表达了适应高氧水平的基因，这可能更为重要，因为在整个大氧化事件期间氧气水平都在增加。
利用 AMDirT 促进古代宏基因组数据的可访问、快速和适当的处理
1 莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研究所汉斯·诺尔研究所“微观宇宙平衡”卓越集群，阿道夫·赖希魏因大街 23 号，耶拿，图林根州，07745，德国 2 马克斯·普朗克进化人类学研究所考古遗传学系，Deutscher Pl. 6，莱比锡，萨克森州，04103，德国 3 动物学系，乌普萨拉大学，Norbyvägen 18D，乌普萨拉，752 36，瑞典 4 考古遗传学相关研究组，莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研究所 Hans Knöll 研究所，Adolf-Reichwein-Straße 23，耶拿，图林根州，07745，德国 5 古生物技术系，莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研究所 Hans Knöll 研究所，Adolf-Reichwein-Straße 23，耶拿，图林根州，07745，德国 6 比较生物医学和食品科学系，帕多瓦大学，Viale dell'Università 16，Legnaro，帕多瓦，350250，意大利 7 分子生态学科和进化，全球研究所，健康与医学科学学院，哥本哈根大学，Øster Farimagsgade 5，哥本哈根 K，1353，丹麦 8 约克大学考古系 BioArCh，英国约克，YO10 5DD，英国 9 传播、感染、多样化和进化小组，马克斯普朗克地质人类学研究所，Kahlaische Str. 10，耶拿，图林根，07745，德国 10 哥本哈根大学健康与医学科学学院全球研究所全基因组学系，Oester Voldgade 44747，哥本哈根 K，1350，丹麦 11 莱顿大学考古科学系，Einsteinweg 2，莱顿，2333 CC，荷兰 12 耶拿弗里德里希席勒大学生态与进化研究所，耶拿，图林根，07743，德国 13 巴黎大学巴斯德研究所微生物古基因组学部门，CNRS UMR 2000，Rue du Docteur Roux 25-28，巴黎，法兰西岛，F-75015，法国 14 马克斯普朗克-哈佛研究中心古地中海考古学 (MHAAM)，马克斯普朗克进化人类学研究所，Deutscher Pl. 6，莱比锡，萨克森州，04103，德国 15
référenceélectroniquejanet kelso，«communicationinvitéeduthème“ l'Asie，die de Carrefours”的洞察力洞察古代基因组的人类历史»，
和计算方法使从骨头和考古发掘中发现的其他遗体从古代DNA中获取可能，并提供了有关古代人类起源，迁移和相互作用的大量新信息。在过去的15年中，我们重建了代表尼安德特人的某些地理和时间范围的几个尼安德特人的基因组。此外，在阿尔泰（Altai）的丹尼索娃（Denisova）洞穴中发现的骨骼遗物中回收的古代DNA确定了与尼安德特人有关的先前未知的灭绝亚洲人类群的存在 - “ denisovans”。这些现在灭绝的人的基因组提供了一种独特的方法来了解其历史并了解其独特的生理学。我们已经将尼安德特人和丹尼索沃人与现代人类的基因组进行了比较，以识别每个群体独有的遗传变化，而持续的工作旨在确定这些遗传变异中的任何一个可能是尼安德特人，丹尼索夫人或现代人的特征的基础。这些基因组还表明，这些人类群体之间的混合物很常见：一些现代人类与尼安德特人交织在一起的祖先，因此非洲以外的所有当今人民都携带约2％的尼安德特人DNA。此外，亚洲的种群还携带从Denisovans遗传的DNA，这是由于多种不同的混合物和遗传多样的Denisovans遗传的。该介入的DNA已被证明具有当今载体的正面和负面结果，其基本的显然适应性表型，例如高海拔适应性，以及影响免疫和疾病风险。我将讨论