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高度改良的肩突硬蜱基因组，含有 X 和 Y 假染色体
肩突硬蜱，即黑腿蜱，是莱姆病螺旋体伯氏疏螺旋体的主要媒介，是美国每年约 47 万例莱姆病病例中的大多数是由其引起的。肩突硬蜱可以传播另外六种对人类健康有影响的病原体。由于其医学重要性，肩突硬蜱是第一个被测序和注释的蜱基因组。然而，由于节肢动物基因组特有的长重复基因组序列以及缺乏长读长测序技术所带来的技术挑战，第一个组装体肩突硬蜱 Wikel (IscaW) 高度碎片化。尽管由于胚胎注射和 CRISPR-Cas9 介导的基因编辑等新工具的出现，肩胛带蜱已成为蜱研究的模型，但缺乏染色体级支架减缓了蜱生物学的进展和控制工具的开发。在这里，我们结合了多种技术来制作肩胛带蜱 Gulia-Nuss (IscGN) 基因组组装和基因组。我们使用了来自卵和雄性和雌性成年蜱的 DNA，并利用 Hi-C、PacBio HiFi 测序和 Illumina 短读测序技术来制作染色体水平的组装。在这项工作中，我们展示了由 13 条常染色体和性假染色体组成的预测假染色体：X 和 Y，以及与现有组装和注释相比显着改进的基因组注释。
细胞和基因治疗弹射器
英国先进治疗药物¹ (ATMP) 临床试验的数量继续逐年增加，2022 年报告的正在进行的试验数量为 178 项，高于去年的 168 项。虽然与前一年的增长相比增长幅度不大，但英国的稳定状态与全球正在进行的 ATMP 临床试验数量下降 13% 形成鲜明对比。其中北美和亚太地区均减少了 15%，欧洲正在进行的 ATMP 临床试验活动也减少了 14%²。商业赞助的试验约占英国所有 ATMP 临床试验的 80%（从 2021 年的 131 项试验增加到 2022 年的 145 项），表明英国对商业赞助商的吸引力。
通过胚胎注射和 ReMOT 控制对黑腿蜱（Ixodes scapularis）进行 Cas9 介导的基因编辑
摘要 尽管蜱虫能够获得和传播多种致病病原体，但对蜱虫的研究却落后于蚊子等其他节肢动物媒介，这主要是因为在应用现有的遗传和分子工具方面存在挑战。CRISPR-Cas9 正在改变非模式生物研究；然而，尚未有蜱虫成功进行基因编辑的报道。注射蜱虫胚胎进行基因编辑的技术挑战进一步减缓了研究进展。目前，尚无针对任何螯合动物物种（包括蜱虫）的胚胎注射方案。在此，我们报告了一种针对黑腿蜱（Ixodes scapularis）的成功胚胎注射方案，以及使用此方案通过 CRISPR-Cas9 进行基因组编辑。我们还证明 ReMOT 控制技术可成功用于在昆虫纲之外产生基因组突变。我们的研究结果为蜱研究界提供了创新工具，对于促进我们对蜱虫传播病原体的分子机制以及宿主-媒介-病原体相互作用的潜在生物学的理解至关重要。
BAd-CRISPR：在成年小鼠肩胛间棕色脂肪组织中诱导基因敲除
CRISPR/Cas9 已实现多种组织中的可诱导基因敲除；然而，尚未有其在棕色脂肪组织 (BAT) 中的应用报道。在此，我们开发了棕色脂肪细胞 CRISPR (BAd-CRISPR) 方法来快速检测一个或多个基因的功能。使用 BAd-CRISPR，将表达单向导 RNA (sgRNA) 的腺相关病毒 (AAV8) 直接施用于在棕色脂肪细胞中表达 Cas9 的小鼠的 BAT。我们表明，将 AAV8-sgRNA 局部施用于成年小鼠的肩胛间 BAT 可强有力地转导棕色脂肪细胞，并使脂联素、脂肪甘油三酯脂肪酶、脂肪酸合酶、周脂素 1 或硬脂酰辅酶 A 去饱和酶 1 的表达降低 90% 以上。施用多个 AAV8 sgRNA 可同时敲除多达三个基因。 BAd-CRISPR 诱导移码突变并抑制靶基因 mRNA 表达，但不会导致 BAT 中脱靶突变的大量积累。我们利用 BAd-CRISPR 创建了可诱导的解偶联蛋白 1 (Ucp1) 敲除小鼠，以评估 UCP1 缺失对成年小鼠适应性产热的影响。可诱导的 Ucp1 敲除不会改变核心体温；然而，BAd-CRISPR Ucp1 小鼠的成纤维细胞生长因子 21 循环浓度升高，并且 BAT 基因表达发生变化，与通过增加过氧化物酶体脂质氧化而产生的热量一致。其他分子适应性预示着额外的细胞效率低下，蛋白质合成和周转增加，线粒体对线粒体编码基因表达的依赖降低，核编码线粒体基因表达增加。这些数据表明 BAd-CRISPR 是一种加速脂肪组织生物学发现的有效工具。
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Covid-19：生物网络和结构建模...
莱姆毛毛虫病是北半球最常见的载体传播疾病，是由螺旋体伯氏伯氏菌SL引起的，该疾病是由ixodes tick传播的。疫苗接种将是预防莱姆病的有效方法。目前没有人类疫苗。疫苗可防止伯氏伯氏菌感染感染，可以通过两种方式起作用：杀死病原体以阻止感染或靶向载体以防止成功传播。因此，研究着重于源自病原体，B。burgdorferisl或载体的保护性抗原，ixodes tick（1）。专注于伯氏菌的可能的保护性抗原时，人类疫苗研究中最有希望的候选者是外表面蛋白。尤其是OSPA，主要由Borrelia在未用壁虱中表达的OSPA已被广泛研究，并且是退出的人Lymerix™疫苗的主要组成部分（2-6）。在从壁虱到宿主的传播过程中，伯氏螺旋体下调了OSPA并上调外表面蛋白C，这对于促进迁移到滴答唾液腺，并且在哺乳动物宿主的螺旋体感染中起作用。OSPC也被证明是有效的疫苗靶标，但在不同的B. burgdorferi sl物种和菌株之间具有很高的异质性（7，8）。在针对壁虱向量的替代方法中，tick唾液可以发挥关键作用。tick唾液中包含几种蛋白质，通过使用抗炎，抗凝蛋白和免疫抑制能力，可促进tick传播病原体的传播和存活（9，10）。dai等。Borrelia burgdorferi Sl利用tick唾液腺蛋白来促进其从tick到宿主的传播，反之亦然，以增加其在tick中的生存机会（11，12）。例如，OSPC与ixodes capularis唾液蛋白salp15结合，该蛋白质Salp15可保护螺旋体免受抗体介导的杀伤的侵害（12-14）。此外，SALP15在抑制CD4 + T细胞和树突状细胞活化方面还具有免疫抑制特性（15，16）。有趣的是，针对SALP15的疫苗已显示出部分阻断B. burgdorferi Ss感染（14，17）。还表征了tick组胺的释放因子，这是tick唾液中的，对于滴答喂食很重要（18）。当RNA干扰沉默时，他们显示出对小鼠的滴答物的显着受损。在THRF免疫小鼠中也显着减少了B. burgdorferi Ss的滴答喂养和传播（18）。Schuijt等。识别tick虫唾液凝集素途径抑制剂（TSLPI），一种肩cap骨唾液蛋白，该蛋白质被证明会损害补体介导的爆发爆发芽孢杆菌。B. Burgdorferi传输是
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引用 Bouwman、LF、Maarel、Van Der、SM 和 Greef、JC de。 （2020 年）。针对 DUX4 治疗面肩肱型肌营养不良症的前景。
双同源框 4 (DUX4) 是一种转录因子，与人类胚胎四细胞阶段的合子基因组激活 (ZGA) 有关，在该阶段，它充当重复元件和分裂特异性基因的激活剂 [1,2]。人们认为 DUX4 在大多数躯体组织中受到表观遗传抑制，包括骨骼肌。面肩肱型肌营养不良症 (FSHD；MIM 158900) 是一种进行性神经肌肉疾病，其特征是面部、肩胛骨和肱骨肌肉不对称无力和萎缩 [3]，D4Z4 大卫星重复序列的表观遗传抑制丧失。这导致 DUX4 基因座的转录活性，该基因座在每个 D4Z4 重复单元内编码 [4,5]。 DUX4 激活未受影响的骨骼肌中通常不表达的基因，包括在 ZGA 期间激活的基因和免疫系统基因 [6,7]。成肌细胞中 DUX4 过表达会诱导不同的毒性级联反应，包括氧化应激增加、无义介导的衰变抑制和肌肉生成抑制。这些变化最终