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抗碳青霉苯甲酸杆菌鲍曼尼（Baumannii）：生物膜 -
摘要：这项研究旨在研究抗碳青霉培养素的生物膜产生能力鲍曼尼（Baumannii）（CRAB）（CRAB），70％乙醇和0.5％钠次氯酸钠的生物膜膜片潜力在生物膜产生和细菌基因型之间。测试了总共111个螃蟹分离株的抗菌易感性，生物膜形成，编码碳青霉酶的基因的存在以及与生物FILM相关的毒力因子。还测试了消毒剂和SENP对CRAB分离株的抗纤维膜作用。绝大多数测试的分离株是生物膜生产者（91.9％）。在57％，70％和76％的螃蟹分离株中发现了BAP，OMPA和CSUE基因，与非生物产生的生产者（25％）相比，在生物纤维生产国（78.6％）中，CSUE在生物纤维生产国（78.6％）中的普遍性更高。测试的消毒剂比对弱生产者的抗纤维膜对中度和强生物膜产生的影响更好（p <0.01）。SENP对所有测试的浮游症状（MIC范围：0.00015至> 1.25 mg/ml）和生物纤维膜包含的蟹表现出抑制作用，最低生物膜抑制浓度低于0.15 mg/ml，生物纤维抑制浓度低于0.15 mg/ml。总而言之，SENP可以用作有前途的治疗和医疗设备涂料剂，因此是预防生物膜相关感染的替代方法。
Acinetobacter Baumannii的Great Escape
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年12月26日。 https://doi.org/10.1101/2024.12.26.630398 doi：Biorxiv Preprint
鲍曼不动杆菌 IC2 和 IC5 分离株与 Co ...
1 墨西哥国立自治大学医学院实验医学研究单位感染学、微生物学和临床免疫学实验室，墨西哥城 06720，墨西哥； juliamorenomanjon@gmail.com（JM-M.）; catalina_gayosso@yahoo.com.mx（CG-V.）； joseluis_f@hotmail.com (JLF-V.) 2 墨西哥国家政治科学研究所生物科学研究生院医学细菌学实验室，墨西哥城 11350，墨西哥 3 墨西哥国立自治大学遗传进化项目，库埃纳瓦卡 62209，墨西哥； iago@ccg.unam.mx（SC-R.）； vmateo@lcg.unam.mx (VM-E.) 4 牛津大学生物系，牛津 OX1 3SZ，英国； keith.jolley@biology.ox.ac.uk （KAJ）； martin.maiden@biology.ox.ac.uk (MCJM) * 通信地址：sgiono@yahoo.com (SG-C.); alcantar@unam.mx (MDA-C.)
baumannii vieuvirus噬菌体的丰度和多样性的地理变化
病毒是地球上最丰富的生物学实体（Breitbart和Rohwer，2005年）。噬菌体或噬菌体，特别是感染了脑原生物的微生物。这些噬菌体通过裂解循环复制，裂解循环是典型的有毒噬菌体的，或以预言整合到宿主基因组中，或者在宿主细胞质中复制为质粒（Piligrigimova等，2021）。综合噬菌体基因组（预言）与宿主染色体一起复制，并通过细胞分裂从初始感染细胞转移到其后代（Maurice等，2013）。整合到细菌染色体中可以改变宿主表型，并将新基因和功能引入细菌代谢库中（Ramisetty和Sudhakari，2019年）。预言编码负责抗生素耐药性和/或毒力因子的基因（Costa等，2018; Kondo等，2021;López-Leal等，2020;Piña-González等，2024，2024），为其细菌宿主提供适应性益处（Li et al。
基于CRISPR的基因编辑鲍曼尼（Baumannii
摘要：抗菌素抵抗（AMR）在全球范围内对健康，社会，环境和经济部门构成了显着威胁，并且需要认真关注解决这一问题。鲍曼尼氏杆菌在传染性细菌中被赋予了头等大事，因为它几乎对所有抗生素类别和治疗选择都具有广泛的耐药性。耐碳青霉苯甲酸杆菌的baumannii被分类为世界卫生组织（WHO）优先级的抗生素耐药菌细菌的重点清单之一。尽管可用的遗传操纵方法在鲍曼尼曲霉的实验室菌株中取得了成功，但在新获得的临床菌株中使用时，它们受到限制，因为这种菌株的AMR水平高于用于选择它们进行基因操作的AMR。最近，CRISPR-CAS（群集定期间隔短的短粒子重复序列/CRISPR相关蛋白）系统已成为基因组编辑的最有效，最有效，最精确的方法之一，并提供了靶标针对AMR基因在特定的细菌菌株中的AMR基因。基于CRISPR的基因组编辑已成功应用于各种细菌菌株中以对抗AMR。但是，在鲍曼曼尼（A. Baumannii）中尚未广泛探索该策略。本评论提供了详细的见解，了解CRISPR-CAS使用对A. Baumannii中与AMR相关的基因操纵的进度，现有情况和未来潜力。
利用人工智能发现抗生素用于治疗鲍曼不动杆菌感染
摘要 多重耐药性鲍曼不动杆菌感染带来的全球挑战刺激了新治疗策略的发展。我们报道外膜蛋白 W（OmpW）是鲍曼不动杆菌的潜在治疗靶点。本文使用从 ChEMBL 数据集生成的定量结构-活性关系 (QSAR) 模型对 11,648 种天然化合物库进行初步筛选，该数据集包含 >7,000 种化合物，并报告了它们对鲍曼不动杆菌的最低抑菌浓度 (MIC) 值，然后对 OmpW 进行基于结构的虚拟筛选。进行了计算机药代动力学评估以评估这些化合物的药物相似性。发现排名最高的十种化合物的结合能量得分范围为 -7.8 至 -7.0 kcal/mol，其中大多数属于姜黄素类化合物。为了验证这些发现，我们使用微量稀释和时间-杀灭曲线测定法，对一种表现出良好结合稳定性和药代动力学特性的先导化合物——脱甲氧基姜黄素——进行了针对一组鲍曼不动杆菌菌株的测试，以确定其抗菌活性。为了验证该化合物是否与选定的靶标结合，研究了一种 OmpW 缺陷型突变体并将其与野生型进行了比较。我们的结果表明，脱甲氧基姜黄素单一疗法和与粘菌素联合使用对所有鲍曼不动杆菌菌株均有效。最后，发现该化合物可显著降低鲍曼不动杆菌与宿主细胞的相互作用，表明其具有抗毒力特性。总之，这项研究证明了机器学习是一种有前途的策略，可用于发现姜黄素类化合物作为对抗鲍曼不动杆菌感染的抗菌剂。
氨基酸竞争形状的鲍曼尼杆菌肠道肠道
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本于2024年10月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.10.19.619093 doi：Biorxiv Preprint
肽聚糖编辑在细菌战中为鲍曼不动杆菌提供免疫力
肽聚糖 (PG) 在大多数细菌中是必需的。因此，它经常成为各种攻击的目标，包括通过 VI 型分泌系统 (T6SS) 的细菌间攻击。本文中，我们报告了革兰氏阴性细菌鲍曼不动杆菌菌株 ATCC 17978 在稳定期产生、分泌并将非规范 d -氨基酸 d -赖氨酸掺入其 PG 中。我们表明，PG 编辑通过提供针对各种细菌竞争对手的肽聚糖靶向 T6SS 效应物的免疫力，提高了鲍曼不动杆菌在细菌战中的竞争力。相反，我们发现 d -Lys 的产生不利于致病机制，至少部分原因是人类酶 d -氨基酸氧化酶 (DAO) 的活性，它会降解 d -Lys 并产生对细菌有毒的 H 2 O 2。系统发育分析表明，鲍曼不动杆菌的最后共同祖先具有产生 d -Lys 的能力。然而，这种特性已独立丧失多次，可能反映了鲍曼不动杆菌作为人类病原体的进化。
鲍曼不动杆菌 ST374 的基因组见解揭示了广泛且不断增加的耐药组和病毒组
基于 WGS 的监测大大提高了追踪临床相关病原体多药耐药克隆的全球传播和出现的能力。在本研究中，我们对属于序列类型 ST374 的鲍曼不动杆菌 (菌株 Ac56) 进行了基因组表征和比较分析，该菌株于 1996 年首次在巴西分离。Ac56 的基因组分析预测了总共 5373 个基因，其中 3012 个基因在来自欧洲、亚洲、北美和南美国家的 ST374 鲍曼不动杆菌分离株的九个基因组中是相同的。GoeBURST 分析将 ST374 谱系分为克隆复合体 CC3（国际克隆 IC-III）。ST374 克隆的抗性基因组分析预测了与重金属和临床相关的 β-内酰胺类和氨基糖苷类抗生素耐药性相关的基因。在这方面，在两种密切相关的鲍曼不动杆菌菌株中，内在的 bla ADC 基因与插入序列 IS Aba1 相关；包括 Ac56 菌株，该基因可能与对美罗培南的中等敏感性相关。其他四种耐卡巴培南的鲍曼不动杆菌菌株携带 IS Aba1/bla OXA-23 基因阵列，该基因阵列与转座子 Tn 2008 或 AbaR4 型耐药岛中的 Tn 2006 相关。虽然 ST374 的鲍曼不动杆菌菌株大多数毒力基因是相同的，但来自泰国的三种分离株含有 KL49 荚膜基因座，该基因座先前在高毒力鲍曼不动杆菌 LAC-4 菌株中发现。对三十四种预测质粒的分析显示八个主要组，其中 GR-6（LN − 1）和 GR-2（LN − 2）占主导地位。所有菌株（包括最早的分离株 Ac56）都含有至少一个完整的原噬菌体，但未检测到任何 CRISPR 相关 (cas) 基因。总之，A. baumannii ST374 的基因组数据显示该谱系有潜力成为成功的克隆。
通过计算机驱动的化学基因组学再利用发现针对鲍曼不动杆菌的新型抗菌候选药物
鲍曼不动杆菌是一种世界范围内分布的高耐药率革兰氏阴性细菌，是造成多种医院内感染的元凶。我们应用计算化学基因组学框架来研究将已获批准的药物重新用于治疗鲍曼不动杆菌。这种综合方法包括汇编和准备蛋白质组学数据、识别药物-靶标数据库中的同源蛋白、评估靶标的进化保守性、进行分子对接研究和体外试验。我们选取了七种药物进行实验测定。其中，他伐硼罗表现出最有希望的抗菌活性，最低抑菌浓度 (MIC) 值为 2 μ g/ml，对几种临床相关菌株具有强效活性，在 16 μ g/ml 浓度下对多重耐药菌株的生物膜具有强大的功效。分子对接研究阐明了他伐硼罗在亮氨酰-tRNA 合成酶的编辑和活性域中的结合模式，从而深入了解了其抗菌活性的结构基础。他伐硼罗有望成为一种对抗鲍曼不动杆菌感染的抗菌剂，值得在临床前研究中进一步研究。