图9:哺乳动物转录的调节。通过形成染色体环的形成,使DNA的活跃增强子调节区域可与靶基因的启动子DNA区域相互作用。这可以通过RNA聚合酶II(RNAP II)启动Messenger RNA(mRNA)合成,并在基因的转录开始位点与启动子结合。通过锚定在增强子上的一个结构蛋白稳定环,一个固定在启动子上的蛋白质,将这些蛋白固定在启动子上,并连接到形成二聚体(红色锯齿形)。特定的调节转录因子与增强子上的DNA序列基序结合。一般转录因子与启动子结合。当转录因子被信号激活时(此处指示为增强子上的转录因子上的小红色星形所示的磷酸化),增强子被激活,现在可以激活其目标启动子。通过绑定的RNAP IIS在相反的方向上在DNA的每条链上转录活性增强子。介体(一个由相互作用结构中约26个蛋白质组成的复合物)将调节信号从增强子DNA结合的转录因子传达给启动子。
自然杀伤 (NK) 和 CD4 + T 细胞分化为 CD4 + Th1 表型。IL-23 是一种含有 p40 亚基的异二聚体蛋白质,p40 亚基通过二硫键与 p19 亚基相连。IL-23 通过激活 IL-6 和 TGF-b 来诱导 Th17 细胞与 TNF- α 的产生,从而发挥作用。IL-12 和 IL-23 的 p40 亚基均与 IL-12 受体- β 1 (IL-12R β 1) 结合。IL-12p35 和 IL-23p19 亚基分别与 IL-12R β 2 和 IL-23R 结合。这样,IL-12 和 IL-23 尽管在结构上有一些相似之处,但它们控制着不同的免疫途径。通过刺激 CD4 + T 细胞分化为 CD4 + Th1 表型,IL-12 促进 IFN- γ 、TNF- α 和 IL-2 的分泌。相反,IL-23 与 IL-21 和 TGF- β 结合,导致 CD4 + Th17 细胞分化,从而导致其他细胞因子的分泌,例如 L-17、IL-22、TNF- α 和 IL-1 β 。乌司奴单抗是一种抑制 p40 蛋白的人重组 G1 (lgG1) 单克隆抗体。它通过这种 p40 抑制来发挥作用,从而阻断 IL-12 和 IL-23 3,4 。
摘要:为了设计出在进一步优化阶段有较高成功率的先导化合物,应解决药物-靶标相互作用、细胞内化和靶标参与问题。因此,我们设计了叶酸与抗癌肽的结合物,它能够结合人胸苷酸合酶 (hTS) 并通过几种癌细胞高表达的叶酸受体 α (FR α ) 进入癌细胞。机制分析和分子建模模拟表明,这些结合物与 hTS 单体-单体界面的结合力比酶活性位点大 20 倍以上。在几种癌细胞模型上测试时,这些结合物在纳摩尔浓度下表现出 FR α 选择性。当结合物与抗癌剂以协同或附加组合方式递送时,观察到类似的选择性。与 5-氟尿嘧啶和其他靶向 hTS 催化口袋的抗癌药物不同,这些结合物不会诱导该蛋白质的过度表达,因此可以帮助对抗与高 hTS 水平相关的耐药性。■ 简介
1生物医学,神经科学和高级诊断学系(BIND),巴勒莫大学,意大利90127,意大利90127; vincenzo19689@gmail.com(V.D.S.); francesco.prinzi@unipa.it(f.p。); alongep95@gmail.com(p.a.); salvatore.vitabile@unipa.it(s.v.)2 Fondazione Policlinico Universitorio A,Gemelli-Irccs,UOC Neurologia,00168罗马,意大利; mluigetti@gmail.com(M.L。); Angela.Romano12@gmail.com(A.R.); a.sciarrone97@gmail.com(M.A.S.); vitali.francesca95@gmail.com(F.V.)3 Cattolica del Sacro Cuore大学神经科学系,意大利罗马00168 4临床和实验医学系,墨西拿大学,意大利98182 Messina,意大利; russom@unime.it(M.R. ); annamazzeo@yahoo.it(a.m.); luca.gentile@unime.it(l.g。) 5 Naples“ Federico II”的神经科学系,生殖和Odontostomatologicy Science,意大利80131 Naples; ste.tozza@gmail.com(S.T。 ); gio.palu1995@gmail.com(G.P. ); firemanganelli@gmail.com(F.M.) *信函:fiplipo.brighina@unipa.it;电话。 : +39-3392118412;传真: +39-09165529743 Cattolica del Sacro Cuore大学神经科学系,意大利罗马00168 4临床和实验医学系,墨西拿大学,意大利98182 Messina,意大利; russom@unime.it(M.R.); annamazzeo@yahoo.it(a.m.); luca.gentile@unime.it(l.g。)5 Naples“ Federico II”的神经科学系,生殖和Odontostomatologicy Science,意大利80131 Naples; ste.tozza@gmail.com(S.T。); gio.palu1995@gmail.com(G.P.); firemanganelli@gmail.com(F.M.)*信函:fiplipo.brighina@unipa.it;电话。: +39-3392118412;传真: +39-0916552974
CRISPR 干扰 (CRISPRi) 是一种在哺乳动物细胞中沉默基因的高效方法,它采用酶失活形式的 Cas9 (dCas9) 与一个或多个与靶基因转录起始位点互补 20 个核苷酸 (nt) 的向导 RNA (gRNA) 复合。此类 gRNA/dCas9 复合物与 DNA 结合,阻碍目标基因座的转录。在这里,我们提出了一种替代的基因抑制策略,即使用活性 Cas9 与截短的 gRNA (tgRNA) 复合。Cas9/tgRNA 复合物与特定靶位点结合而不会触发 DNA 切割。当靶向转录起始位点附近时,这些短的 14-15 nts tgRNA 可有效抑制果蝇体细胞组织中几种靶基因的表达,而不会产生任何可检测到的靶位点突变。 tgRNA 在与 Cas9-VPR 融合蛋白复合时还可以激活靶基因表达或调节增强子活性,并且可以整合到基因驱动中,其中传统 gRNA 维持驱动,而 tgRNA 抑制靶基因表达。
摘要 突变选择性 KRAS G12C 抑制剂,例如 MRTX849 (adagrasib) 和 AMG 510 (sotorasib),已证明对 KRAS G12C 突变癌症(包括非小细胞肺癌 (NSCLC))有效。然而,临床获得性耐药 KRAS G12C 抑制剂的潜在机制仍未确定。为了开始定义获得性耐药的机制谱,我们描述了一名患有 KRAS G12C NSCLC 的患者,该患者对 MRTX849 产生了多克隆获得性耐药,在四个基因(KRAS、NRAS、BRAF、MAP2K1)的连续无细胞 DNA 中出现了 10 种异质性耐药性改变,所有这些改变都汇聚在一起重新激活 RAS-MAPK 信号传导。值得注意的是,研究人员发现一种新的 KRAS Y96D 突变会影响 MRTX849 和其他非活性状态抑制剂结合的 switch-II 口袋,这种突变会干扰关键的蛋白质-药物相互作用,并在工程化和患者衍生的 KRAS G12C 癌症模型中产生对这些抑制剂的耐药性。有趣的是,一种功能独特的新型三重复合物 KRAS G12C 活性状态抑制剂 RM-018 保留了结合和抑制 KRAS G12C/Y96D 的能力,并且可以克服耐药性。
TR-FRET E3 检测涉及铽标记的 TUBE,其与由目标 E3 连接酶合成的荧光素标记的多泛素链结合。铽和荧光素是一对 FRET 对,因此含有荧光素标记的泛素的多泛素链在与铽-TUBE 结合时会产生 FRET 信号。该信号可以以均质、高通量的形式随时间监测,使其成为小分子筛选的理想选择。
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ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。 腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。 意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。 These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。 迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。 在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。 相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。 这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。
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