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World File Search Systembradyrhizobium
使用元基因组采矿方法从高山土壤的质体中寻找新的降解酶
塑料材料，包括微塑料，即使在欧洲阿尔卑斯山等偏远和寒冷的环境中也积聚在所有类型的生态系统中。这种污染对环境和人类构成了风险，需要解决。使用大约3,000 m a.s.l.的东部瑞士阿尔卑斯山收集的土壤的shot弹枪DNA宏基因组学，我们确定了可能降解塑料的基因及其蛋白质。我们通过差异丰度分析筛选了质体和大块土壤的宏基因组，并与专门针对推定的塑料降解基因的特定数据库进行了基于相似性的筛选，并选择了具有信号肽的高概率的基因，用于信号肽的细胞外导出和高信任的功能率。此过程导致了9个候选基因的最终列表。预测蛋白的长度在425至845个氨基酸之间，预测产生这些蛋白质的属主要属于Caballeronia和Bradyrhizobium。我们使用异源表达进行了功能验证，然后进行上清液的酶测定。测试的九种蛋白质中的五种显示出我们使用酯酶测定时的活性显着增加，而从候选基因（一种水解酶型酯酶）中的五种蛋白质中的一种显然具有最高的活性，高于双倍以上。，我们仅用来自酯化酯酶测定中五个候选基因的蛋白质对塑料类型的塑料降解和生态®进行荧光测定，但是像阴性对照一样，这些蛋白质并未显示出任何偶尔的活性。相比之下，阳性对照的活性（包含文献中已知的Pla降解基因插入物）是阴性对照的20倍以上。这些发现表明，在计算机筛选中进行功能验证，适合查找新的降解酶。尽管我们只发现了一种新的酯酶酶，但我们的方法有可能应用于任何类型的土壤和各种生态系统中的塑料，以快速有效地寻找新的塑料降解酶。
未来派植物微生物生物技术和生物工程
植物 - 微生物相互作用的领域正在迅速发展，随着生物技术和生物工程的进步，我们正处于释放农业，环境可持续性和健康科学方面的新机会。微生物生物技术与植物系统的整合具有革新作物生产力，营养效率，病原体抗性和气候弹性的潜力。随着研究的继续，生物技术干预措施是针对全球挑战的创新解决方案，例如粮食安全，生态系统退化和可持续的能源生产。本社论探讨了植物 - 微生物生物技术的最新进步，重点是农业中的微生物应用，生物工程突破以及这种动态场的未来轨迹。微生物群落对于植物健康和发育至关重要，并与根际中的植物根相互作用，以促进营养摄取，增强胁迫耐受性并预防病原体。有益的植物相关微生物，例如磷酸盐溶解的微生物（PSM）和氮固定细菌，正在越来越多地探索以减少对化学肥料的依赖并促进可持续的农业（Jain等人。; Pang等。）。磷是植物生长的关键元素，但是由于它倾向于与钙，铁或铝形成不溶性化合物，因此在土壤中通常无法使用。psms通过分泌溶解这些结合化合物的有机酸来增强磷的可用性，从而使磷可供植物进入（Pang等人。）。）。）。芽孢杆菌，假单胞菌和曲霉物种可以显着增加磷的摄取并改善植物的生长和产量（Jain等人。共生细菌，例如根瘤菌，勃arad骨和硫唑群，通过将大气氮转化为氨可以使用，在氮固定中起着至关重要的作用，植物可以使用。这种自然过程减少了对合成氮肥的需求，从而促进了农业和环境可持续性（Pang等人。将这种微生物功能整合到农业系统中可以提高作物产量，减少化学投入并发展弹性的农业系统。
关于兰塔尼德在生物学中的作用的看法
（Fitriyanto等，2011; Hibi等，2011）。一些甲状腺营养和杂营细菌含有吡咯烷酚（PQQ）（PQQ）和钙依赖性甲醇脱氢酶（CA-MDH）。该酶由形成α2/β2异二聚体的基因MXAF和MXAI编码，并将甲醇氧化为甲醛。此外，这些细菌中的许多具有称为XOXF的基因，编码了另一种依赖PQQ的MDH样蛋白，对CA-MDH表现出约50％的身份（Chistoserdova，Kalyuzhnaya，＆Lidstrom，2009年）。与实验室培养物相比，与MXAFI相比，XOXF表达100倍（Bosch等，2008）相比，XOXF基因在甲基杆菌 /甲基肌肉菌属中高度表达。在植物的植物层定植（Delmotte等，2009）。2011年，据报道，LA 3+在甲基杆菌的生长培养基中添加了六倍的MDH活性，报告了Radiotolerans NBRC15690的生长培养基（Hibi等，2011）。La 3+诱导的酶被纯化，并被该细菌的XOXF基因编码。在对毛rad骨MAFF2116450的后续研究中，纯化的Ce 3+诱导的MDH也可以与该细菌的XOXF基因偶联（Fitriyanto等，2011）。推导的氨基酸序列显示了作为辅助因子的结合PQQ的基序。接下来，补充La 3+后，仅在甲醇上生长甲基肌肉质量AM1的δMXAF菌株，而琥珀酸酯上的生长与野生型没有差异（Nakagawa等，2012）。热酸性甲基营养的甲基氧化脂蛋白脂肪液的基因组仅具有XOXF基因。从La 3+ /Ca 2+培养基上生长的菌株AM1仅纯化一个MDH蛋白并将其鉴定为XOXF基因的乘积。MDH含有0.9个La 3+原子和每个二聚体Ca 2+的0.4个原子，EDTA处理显示La 3+紧密结合（Nakagawa等，2012）。这种属于门果肉芽素的极端粒细胞最初是在含有其原始泥锅中的水中的培养基上分离出来的（Pol等，2007，图。1）。没有泥锅的水生长非常差。表明负责这种效果的成分本质上是无机的，最终证明了泥锅水可以被灯笼（LN）取代（Pol等，2014）。甲基氧化脂脂溶剂的生长严格取决于培养基中Ln 3+的存在。显示了在具有Ce 3+浓度范围的培养基上生长的细胞的比例反应。ce 3+可以用La 3+，Pr 3+