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利用低温电子显微镜对恰加斯疫苗候选物 TcPOP 的开放和封闭构象进行分析，并对其抗体反应进行表征
细化参数 闭合构象 开放构象 地图分辨率（掩蔽） 3.54Å 4.02Å 地图分辨率（未掩蔽） 3.55Å 4.03Å FSC（模型）（掩蔽）= 0.143 2.28Å 3.35Å 相关系数（掩蔽） 0.77 0.60 Ramachandran 允许值 100% 98.53% 表 2 PHENIX 40 中实空间细化的闭合和开放构象的冷冻电镜统计数据。447
Ph.D.候选人Ph.D.候选人
10。Multari，Silvia，Rızaözçelik，Angelica Mazzolari，Salvatore Nobile和Francesca Grisoni。“与分子变压器预测药物设计优化的代谢反应。” IEEE生物信息学和计算生物学计算智能会议（CIBCB），2024。
HIV-1 候选疫苗的设计和表征，以引发针对多个表位的抗体
设计和表征 HIV-1 候选疫苗以引发针对多个表位的抗体 Harry B. Gristick 1 、Harald Hartweger 2 、Yoshiaki Nishimura 3 、Edem Gavor 1 、Kaito Nagashima 1 、Nicholas S. Koranda 1 、Priyanthi NP Gnanapragasam 1 、Leesa M. Kakutani 1 、Luisa Segovia 1 、Olivia Donau 3 、Jennifer R. Keeffe 1 、Anthony P. West, Jr. 1 、Malcolm A. Martin 3 、Michel C. Nussenzweig 2,4 、Pamela J. Bjorkman 1,* 1 加州理工学院生物学和生物工程部，美国加利福尼亚州帕萨迪纳市 2 洛克菲勒大学分子免疫学实验室，美国纽约州纽约 10065 3美国马里兰州贝塞斯达市国立卫生研究院国家过敏和感染性疾病研究所分子微生物学系。4 洛克菲勒大学霍华德休斯医学研究所，纽约州纽约市 10065，美国
我们正在寻找10位积极进取的博士候选人，以填补欧洲顶级研究中心和医科大学医院的职位。
Miracle将培训10名博士候选人，以获得创新的高科技技术，高级数据分析工具和人工智能，芯片MRD模型以及药物和免疫疗法测试的独特技能组合，并将提出创新的想法，以通过几个学分和数据源的整合来推动未来的白血病治疗。
染色质构象的原发性骨关节炎软骨细胞图揭示了新型候选效应基因
抽象目标骨关节炎是一种复杂的疾病，具有巨大的公共卫生负担。基因组广泛的关联研究（GWAS）已经鉴定出数百个骨关节炎相关的序列变体，但是这些信号支撑的效应基因在很大程度上仍然难以捉摸。了解三维（3D）空间中的染色体组织对于以组织方式（例如，基因和调节元件之间的遥远基因组特征（例如，基因和调节元素之间）之间的长距离接触至关重要。在这里，我们生成了原发性骨关节炎软骨细胞的第一个整个基因组染色体构象分析（HI-C）图，并确定了该疾病的新型候选效应基因。方法从8例膝关节骨关节炎患者收集的原发软骨细胞进行了HI-C分析，以将染色体结构与基因组序列联系起来。然后将鉴定的环与骨关节炎GWAS结果和来自原发性膝关节骨关节炎软骨细胞的表观基因组数据结合在一起，以通过增强子启动子相互作用来鉴定与基因调节有关的变异。结果，我们确定了与77个骨关节炎GWAS信号相关的染色质环锚固中的345种遗传变异。例如，PAPPA与胰岛素类似生长因子1（IGF-1）蛋白的周转直接相关，而IGF-1是修复受损软骨细胞受损的重要因素。结论我们构建了第一张原代人软骨细胞的高图，并将其作为科学界的资源提供。Ten of these variants reside directly in enhancer regions of 10 newly described active enhancer- promoter loops, identified with multiomics analysis of publicly available chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP- seq) and assay for transposase- accessible chromatin using sequencing (ATAC- seq) data from primary knee chondrocyte cells, pointing to two new candidate effector genes SPRY4 and PAPPA（妊娠与血浆蛋白A）以及对已知参与骨关节炎的基因SLC44A2的进一步支持。通过将3D基因组学与大规模的遗传关联和表观遗传学数据相结合，我们确定了骨关节炎的新型候选效应基因，从而增强了我们对疾病的理解，并可以作为假定的高价值新型药物靶标。
使用外膜蛋白A，C和F
Salmonella Kentucky带来的全球公共卫生风险（S。肯塔基州）正在上升，特别是由于人类和动物种群中抗菌抗性基因的传播。这种血清在非洲普遍存在，已成为人类非脑性胃肠炎的显着原因。在这项研究中，我们使用了一种生物信息学方法来开发基于肽外膜蛋白A，C和F的基于肽的疫苗。肯塔基州。此外，我们采用了鼠伤寒沙门氏菌的鞭毛蛋白（FLIC）（s。鼠伤寒）作为增强疫苗有效性的佐剂。通过这种方法，我们确定了14个CD8+和7个CD4+ T细胞表位，这些表位预先限制为各种MHC I类和MHC II类等位基因。预计的表皮预计将在疫苗配方中使用时达到94.91％的覆盖率。此外，我们确定了七个高度免疫原性的线性B细胞表位和三个构象B细胞表位。然后，使用适当的接头将这些T细胞和B细胞表位连接起来，以创建多角色疫苗（MEV）。增强了肽构建体的免疫原性，从s。鼠伤寒在N末端包括在内。由此产生的MEV结构表现出高结构质量和有利的理化特性。通过Toll样受体1、2、4和5进行了分子对接研究，然后进行分子动力学模拟，表明疫苗受体综合在能量上是可行的，稳定的和健壮的。免疫模拟结果表明，MEV引起的显着反应，包括IgG，IgM，CD8+ T细胞，CD4+ T-细胞和各种细胞因子（IFN-γ，TGF-β，IL-2，IL-10和IL-12），以及抗原水平的显着降低。尽管有这些有希望的内部发现结果，但进一步验证
关于KPQC回合2候选人评估的报告
2背景2 2.1通用晶格攻击。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。2 2.2安全假设。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4 2.2.1研究ASPPTIONS的安全级别的重要性。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5 2.2.2加密系统中使用的假设。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。6 2.2.3计算与决策LWE变量。。。。。。。7 2.2.4 LWE与LWR。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7 2.2.5部分校正加密系统。。。。。。。。。。。8 2.2.6安全假设。。。。。。。。。。。。。。。。。。。8 2.2.7基本的REGEV加密系统。。。。。。。。。。。。。。10 2.3一般设计框架和可证明的安全性。。。。。。。12 2.3.1 Fujisaki Okamoto变换（有隐性拒绝）12 2.3.2安全损失。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。13 2.3.3菲亚特 - 沙米尔变换。。。。。。。。。。。。。。。。14 2.4关于回合2 C软件的一般说明。。。。。。。。。。。。。15 2.4.1正确性。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。15 2.4.2防止正时攻击。。。。。。。。。。。。15 2.4.3基准。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。16 2.4.4将来的速度。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。16
入围候选人将被要求参加面试 更多...
筛选标准：获得认可大学的化学/物理学硕士/综合硕士学位或化学/聚合物/机械/塑料/电子与通信工程学士/理学学士学位或同等学历，并在工业和学术机构或科技组织和科学活动和服务方面拥有 2 年研发经验。
医学生物信息学领域的PhD候选人（M/F/D）
我们正在寻找一个雄心勃勃的博士候选人，他们想成为医学生物信息学研究的最前沿。我们的新项目介绍了重点介绍长/后循环（LC/PC）综合征的主题，并改善治疗结果，其中涉及使用创新的人工智能（AI）和多学科专业知识来分析LC/PC患者的分子和临床数据。重点的另一个关键领域是胰腺癌治疗结果的预测，我们将多摩学数据和组织病理学图像整合到多模式学习方法中。