XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemcompartment
前列腺癌微生物组研究的当前趋势和挑战
使用网络药理学系统地推断出选择性的核酸腔室抑制剂ML246 Bhuvnesh P. Sharma 1，Himanshu N. Singh 2，Bhupesh Singh 3，Bhupesh Singh 3，Deepak Parashar 4，deepak Parashar 4，Kuldeep K. Roy 5 Kashyap 6,7 1 Bhagwant University，Ajmer，印度拉贾斯坦邦Bhagwant大学生物技术系，305004，2放射学，纪念斯隆·凯特林癌症中心，纽约，美国，美国10065，3次应用科学学院，OM斯特林全球大学，印度Haryar，Haryar，Haryar，Haryars，医学院，医学，医学，医学，医学，医学，医学，医学，医学，医学学，医学，医学学，医学学，科学学，密尔沃基，美国威斯康星州53226，美国5卫生科学和技术学院药学系，UPES，UPES，UPES，DEHRADUN，DEHRADUN，印度北阿坎德邦，248007，248007，癌症免疫学和微生物学和医学和肿瘤学综合服务部门，医学院（ST-CECR），德克萨斯大学里奥格兰德分校医学院，美国德克萨斯州麦克阿伦，美国摘要Metarrestin（ML246）是一种口服的可生物可利用合成分子，选择性地破坏了围核核酸群体（PNC）结构（PNC）的结构，并且在预先进行的转化癌症治疗方面表现出了希望。然而，ML246的精确分子机制仍然鲜为人知。我们研究了ML246的拓扑和蛋白质相互作用网络（PIN）分析，以确定ML246的分子机制。为了确定ML246对ML246雷的销钉的调节作用，使用25种致癌蛋白构建了对讲机。使用反向药效团匹配方法（基于拟合分数> 0.502）选择这些蛋白质。ML246-rewired Pin表现出无尺度的拓扑结构，并且与生物系统表现出很大的连接性。模块化后，Rewired引脚产生了10个子集，MCODE插件能够从中识别对破烂中最关键的种子蛋白。通过使用Cluego插件来富集获得14个富集的信号通路。大多数途径与癌症等人类疾病组有关。最后，通过检查拓扑特性，包括瓶颈分析，GO期限/途径分析，程度分析，分子对接和动力学研究，确定了ML246蛋白引脚的主要调节蛋白。这项研究提出了一种熟练的方法来探索ML246的潜在机械作用，并为临床环境中的新药物开发前景铺平了道路。关键字：Metarrestin，ML246，蛋白质相互作用网络（PIN），拓扑研究
多周期反应网络中动力学不对称的分析建立了自主分区化的分子棘轮的原理
Emanuele Penocchio，1.6， *艾哈迈德·巴希尔（Ahmad Bachir），2.6 Alberto Credi，3.4 Raymond Dean Astamian，2.5， *和Giulio Ragazzon 2.7， * 1 * 1， * 1， * 1， * 1， * 1， * 1，埃文斯顿西北大学，60208，60208，USA 2 CNRS，8 All'E Gaspard Monge，67000 Strasbourg，法国3氏族中心激活的纳米结构，有机合成与骨质阶级研究所，国家研究委员会，通过Gobetti 101，40129 Boologna，意大利意大利意大利40129工业化学局40129' 40136意大利博洛尼亚5物理与天文学系，缅因州奥罗诺大学，ME 04469，使用6这些作者的贡献Equilly 7 Lead Contact *通信 *通信：Emanuele.penocchio@northwestern.edu（E.P.），astumian@maine.edu（R.D.A. ），girls@unist.fr（g.r。） https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.07.038），girls@unist.fr（g.r。）https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.07.038
自发犬粘膜黑色素瘤的积极潜力可以决定其初始大小和膨胀能力的独特癌症干细胞室行为
粘膜黑色素瘤代表了黑色素瘤最高度转移和侵略性的亚型之一。粘膜黑色素瘤的生物学记录很少，缺乏实验模型使设计和测试新疗法很难。狗经常受口腔黑色素瘤的影响，使自发的犬黑色素瘤成为其人类对应物的潜在可预测模型。我们最近建立并表征了两种新的犬粘膜黑色素瘤细胞系，名为OCR_OCMM1和OCR_OCMM2。Here, we identified quiescent cancer stem cell (CSC) subpopulations in both canine cell lines that displayed similarities to human quiescent CSCs: canine melanoma CSCs had the ability to self-renew, produced nonstem cell (SC) progeny, and formed melanospheres that recapitulated the phenotypic profile of the parental tumor.这些CSC还形成了免疫型小鼠中的黑色素瘤，PI3K/AKT信号的抑制膨胀了CSC池。一个非CSC的子集转换为CSC。OCR_OCMM1和OCR_OCMM2在其初始尺寸和扩展能力方面显示出不同的CSC分配行为。总体而言，这项研究表明，OCR_OCMM1和OCR_OCMM2犬黑色素瘤细胞系是研究黑色素瘤SC的强大细胞工具，不仅用于粘膜，而且对于更常见的人皮肤黑色素瘤。
使用扩散 MRI 多室模型和纤维束测量技术对老年抑郁症和冷漠症患者进行大脑微结构评估
晚年抑郁症 (LLD) 很常见，会导致残疾，并使患痴呆症的风险加倍。冷漠症可能会造成认知能力下降的额外风险，但对其病理生理学的了解尚不清楚。虽然已经使用扩散张量成像 (DTI) 评估了白质 (WM) 的改变，但该模型不能准确地表示 WM 的微观结构。我们假设更复杂的多室模型将提供 LLD 和冷漠症的新生物标志物。研究纳入了 56 名个体（LLD n = 35，26 名女性，75.2 ± 6.4 岁，冷漠评估量表得分（41.8 ± 8.7）和健康对照者，n = 21，16 名女性，74.7 ± 5.2 岁）。在本文中，我们通过沿纤维束直接插入微观结构指标，采用基于纤维束的方法来研究 LLD 和冷漠症的新型扩散模型生物标志物。我们进行了多元统计分析，并结合主成分分析来降维数据。然后，我们通过展示文献中经典报道的 LDD 修改，同时报告 LLD 中冷漠的生物学基础的新结果，测试了我们框架的实用性。最后，我们旨在研究冷漠与不同纤维束中微观结构之间的关系。我们的研究表明，新的纤维束，如纹状体运动前束，可能与 LLD 和冷漠有关，这为重度抑郁症中的冷漠机制带来了新的启示。我们还发现了 5 个不同束的扩散 MRI 指标的统计变化，这些变化此前曾在严重认知障碍痴呆症中报告过，这表明这些束之间的这些改变都与动机和认知有关，可能解释了冷漠如何成为退行性疾病的前驱阶段。
使用扩散 MRI 进行多室映射的图谱和通用先验
其中 (i) wj 是体积分数，(ii) b 和 g 分别是定义扩散梯度的 b 值和方向，δ 和 Δ 是脉冲持续时间和分离 (iii) S IR 是由 [3] 中提出的 IR 扩散模型预测的 MR 信号，该模型具有两个参数：IR 扩散率（以 mm2/s 为单位）和平均细胞半径（以 为单位）；(iv) μ j 是第 j 个各向异性隔室的扩散方向。数据我们根据来自人类连接组计划的 HCP105 数据库 [4] 的数据选择了这样一个模型。先验模型我们为许多 MCM 通用的该模型参数定义先验。我们使用具有适当支持的参数分布，每个先验取决于各向异性隔室的数量。整个管道过程如图 1 所示。我们为 0、1、2 和 3 个各向异性隔室计算了它们。这样做可以确保用户最终能够根据数据选择最合适的隔间数量。
line1促进核分室化以抑制胚胎干细胞中的8细胞状态
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年9月23日。 https://doi.org/10.1101/2024.09.22.614332 doi：Biorxiv Preprint
多周期反应网络中动力学不对称的分析建立了自主分区化的分子棘轮的原理
Emanuele Penocchio，1.6， * Ahmad Bachir，2.6 Alberto Credi，3.4 Raymond Dean Astamian，2.5， *和Giulio Ragazzon 2.7， * 1 * 1， * 1， * 1， * 1，埃文斯顿西北大学，60208，60208，美国2 （ISIS），Strasbourg大学，CNRS，8 All´e Gaspard Monge，67000 Strasbourg，法国3氏族3氏族，用于光激活的纳米结构，有机合成与依靠性研究所，国家研究委员会，通过Gobetti 101，40129 Bogologna，40129 Bogologna，Italy 40129博洛尼亚大学的Montanari''，Viale del Risorgimento 4，40136 Bologna，意大利5号，5物理与天文学系，缅因州奥罗诺大学，ME 04469，使用6个作者Equilly 7 Equilly 7 equilly 7 Lead Contactence *通讯 *通信 *emanuele.penocchio.penorcchio@northwesternwesternwesternwesternwestern.edu（e.penortern.edu（e.pentorn.edu.edu（E.P.Ed.edu（E.P.）），astumian@maine.edu（R.D.A. ），girls@unist.fr（g.r。） https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.07.038），girls@unist.fr（g.r。）https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.07.038
NMDA受体自身抗体主要损害外部腔室
针对N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDAR -AB）的自身抗体是在患有NMDAR脑炎的患者中检测到的致病免疫球蛋白。nmdar-ab改变受体膜运输，突触传播和神经元网络特性，导致患者的神经和精神病症状。患者的神经元损害通常很少，但迅速而庞大（治疗响应）脑功能障碍会导致NMDAR-AB的未知早期机制。我们对这一早期分子级联的理解仍然令人惊讶地分散。在这里，我们使用了基于单分子的膜蛋白成像的组合来揭示NMDAR-AB对活海马神经元的时空作用。我们首先证明了NMDAR-AB的不同克隆主要影响外链（而不是突触）NMDAR。在开始的几分钟内，nmdar-ab增加了外部NMDAR膜动力学，使其表面相互作用。nmdar-ab还迅速改组位于外斜室中的所有膜蛋白。与多种蛋白质的改变一致，NMDAR-AB的作用不是通过NMDAR和EPHB2受体之间的唯一相互作用来介导的。从长远来看，NMDAR-AB通过以交联的非依赖性方式减慢受体膜动力学来减少NMDAR突触池。值得注意的是，仅将Ex trynaptic NMDAR暴露于NMDAR-AB足以产生其对突触受体的全面影响。共同证明了NMDAR-AB最初会损害突触外蛋白，然后损害突触蛋白。因此，这些数据在NMDAR-AB的作用方式上散发出了新的和无调的灯光，并且可能是我们对（额外的）突触病的理解。
通过同时二秒，分辨出静脉和脑的原位测量的分室室内药物转运的高精度
图1（a）基于电化学适体的（EAB）传感器包含一个目标识别的适体，该适体已被特定于电极与电极特定连接，并用甲基蓝色氧化还原报告剂进行了修饰。结合诱导的适体折叠会改变从报告基因的电子传递速率，当使用方波伏安法对传感器进行询问时，（b）易于测量的信号。（c，d）在这里，我们采用了颅内EAB传感器来直接在清醒的，自由移动的大鼠的侧心室中测量抗生素万古霉素的浓度。（e）药物静脉注射后，脑室室内万古霉素水平表现出双相上升和下降，非常适合简单的两室模型。不幸的是，两个在数学上等效的“解决方案”（参数集）非常适合数据（表1）。（f）但是，这两种解决方案预测了完全不同的等离子体药物时间课程。虽然仅使用在大脑中收集的数据进行区分，但使用EAB传感器同时收集脑内和内部测量的相对容易性为此提供了解决方案。
气味2-甲基异位酚的生物合成在蛋白质壳中被分为分室
。cc-by-nd 4.0国际许可在A未获得Peer Review的认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是制作