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盐胁迫对水稻根际土壤细菌群落的影响
盐分是限制沿海滩涂土地利用的首要因素，根际微生物在增强作物抗逆性方面发挥着至关重要的作用，对环境变化高度敏感。水稻（Oryza sativa L.）是盐渍土改良的首选作物。本研究通过高通量测序技术，对不同盐胁迫处理下水稻根际土壤微生物群落进行了研究。研究发现，盐胁迫改变了水稻根际土壤细菌群落多样性、结构和功能。盐胁迫显著降低了水稻根际土壤细菌群落的丰富度和多样性。盐胁迫下，细菌群落中绿弯菌门、变形菌门和放线菌门丰度较高，厚壁菌门、酸杆菌门和粘球菌门相对丰度降低，拟杆菌门和蓝藻门相对丰度增加。水稻根际土壤细菌群落功能主要有化学异养、好氧_化学异养、光能营养等，其中化学异养和好氧_化学异养NS3（基土中添加3‰NaCl溶液）处理显著高于NS6（基土中添加6‰NaCl溶液）处理。本研究为开发水稻专用耐盐微生物菌剂提供了理论基础，为利用有益微生物改善滨海盐渍土土壤环境提供了可行的策略。
通过组合代谢工程提高快速生长蓝藻的柠檬烯产量
萜类化合物是一大类具有商业用途的天然产物。微生物生产萜类化合物被认为是稳定供应这些复杂碳氢化合物的可行方法。蓝藻是一种光合原核生物，是可持续生物生产的有吸引力的宿主，因为这些自养生物只需要光和二氧化碳就能生长。尽管蓝藻已被改造成生产各种化合物，但它们的萜类化合物生产率通常较低。需要进一步研究以确定提高蓝藻萜类化合物产量的瓶颈反应。在这项研究中，我们对快速生长的蓝藻 Synechococcus elongatus UTEX 2973 进行了改造，使其生产一种商业用途的萜类化合物柠檬烯。我们在编码香叶基香叶基焦磷酸合酶 crtE 的基因中发现了一个有益的突变，导致柠檬烯产量增加了 2.5 倍。工程菌株以每天 8.2 mg L 1 的速率生产了 16.4 mg L 1 的柠檬烯，比之前报道的其他蓝藻物种的柠檬烯产量高出 8 倍。此外，我们采用了组合代谢工程方法来优化参与柠檬烯生物合成上游途径的基因。通过调节编码 MEP 途径中的酶和香叶基焦磷酸合酶的基因的表达，我们表明优化表达水平对于提高蓝藻中的柠檬烯产量至关重要。
基本，萨马尔，菲律宾的喀斯特生态系统的细菌和真菌社区分析
菲律宾在石灰石景观中有大量的喀斯特或森林，但只有一小部分的研究和保护。尽管喀斯特森林的动植物是多种多样且独特的，但对居住在该生态系统中的菌群知之甚少。使用Illumina shotgun metagenome测序分析了菲律宾萨马尔三个位置的土壤样品中细菌和真菌的分类和功能组成。蛋白菌细菌和细菌细菌序列在喀斯特土壤中最普遍，其次是粉状，酸性杆菌，氯反llexi，planctcomycetes，callomicrobacteria，verrumicrobia，capterrobia，capteriodetes和deinocococcus-thermus。最丰富的真菌序列属于Ascomycota，其次是basidiomycota。在所有站点中，平均检测到3300万个预测的蛋白质特征。氮和硫代谢以及几种碳固定途径的酶途径似乎几乎完整。据我们所知，这是第一份有关微生物群落及其在菲律宾喀斯特森林生态系统健康中的作用的基线信息，这可能导致识别具有专业代谢的新微生物，并促进菲律宾Karst Forest的生物多样性保护。此外，与植物多样性的相关性分析将揭示植物 - 微生物相互作用，从而导致了解微生物和植物的适应性，丰度，生存和多样性。
算法，专家还是两者？评估特征选择方法对用户偏好和Reliance
sof umer洞穴是一个未开发的极端环境，可容纳新型微生物和潜在的遗传资源。来自洞穴的微生物组已被遗传适应以产生各种生物活性代谢产物，使它们能够生存并耐受苛刻的结合。然而，尚未探索Sof umer Cave微生物中与生物合成相关的基因簇标志。因此，使用高通量shot弹枪测序来探索sof umer Cave的微生物组中与生物合成相关的基因簇（BGC）。Geneall DNA土壤迷你试剂盒用于从均质样品中提取高分子量DNA，并使用Novaseq PE150对纯化的DNA进行测序。根据微-RN数据库，乌默洞穴中最常见的微生物属是原细菌，静脉细菌，verrucomicrobobiota和蓝细菌。对与生物合成相关的基因簇进行了注释并分类，并使用抗石和NAPDOS1预先对BGC进行预令。确定了编码广泛的二级代谢物的BGC的460个推定区域，包括RIPP（47.82％），萜烯（19.57％），NRPS（13.04％），杂种（2.18％）和其他新的注释（10.87％）com punds。此外，NAPDOS管道还从链霉菌素的链霉菌素（链霉菌素基因肌链霉菌素）中鉴定出钙依赖性的抗生素基因簇，来自链霉菌Chrysomallus的放线菌素基因簇和来自链霉菌链霉菌的博霉素基因簇。这些发现突出了Sof Umer Cave微生物组的未开发的生物合成潜力，以及其发现天然产物的潜力。
基于自旋扭转二极管的无线电接收器作为能量探测器
光子微生物（例如蓝细菌和微藻）可以在地下遗产地点易于增殖，在地下遗产地点引入人工照明设备已经显着改变了以前稳定的环境条件。在Reims（France）中雕刻在地下粉刷香槟地窖中的浅浮雕上的延长的Lampenflora生物膜生长（法国）代表了一个经常性的生物殖民化问题，需要定期清洁。这项工作的目的是使用基于多氧碱离子液体（POM-ILS）的预防性杀生物处理来限制Lampenflora在粉笔底物上的生长。在实验室进行的杀生物测定法显示了两种不同的无色POM-POM-il涂层比商业预防性RI80更有效，对从肥大的BAS浮雕，pseudostichoccus monallantoides和chofloris zofloris zofingiensis中分离出的两种藻类菌株。但是，当应用于湿粉笔时，只有一个POM-IL变体能够持续预防生物膜生长，这复制了地窖的更为剧烈的自然环境条件，并且可以限制杀生物涂层的性能。至关重要的是，涂层浓度研究表明，来自先前实验的POM-IL涂层平板如何保留其杀生物活性，并在重新接种具有藻类和蓝细菌的涂层平板后可以防止亚次依次重新固定。因此，POM-ILS代表了在Pommery Champagne Cellar独特的地下环境中消除粉笔浮雕上Lampenflora增长的出色候选人。
热带农业科学 - Pertanika
本研究研究了温度对两种蓝藻：来自北极地区的假鱼腥藻属和来自热带地区的聚球藻属的生长和生化组成的影响。蓝藻分离物在3个不同的温度下培养：4±2℃、15±2℃和25±2℃。假鱼腥藻属在4±2℃、15±2℃和25±2℃下的生长速率分别为1.61天 -1 、1.62天 -1 和1.53天 -1 ，倍增时间分别为0.11、0.18和0.08天。聚球藻属的生长速率略低。在4±2℃、15±2℃和25±2℃条件下，生长速率分别为0.65 day -1 、0.94 day -1 和1.06 day -1 ，倍增时间分别为0.003、0.07和0.25 d。Pseudanabaena sp.在4±2℃、15±2℃和25±2℃条件下的总碳水化合物分别为207.16±10.03 mg/L、329.57±189.65 mg/L和63.32±41.02 mg/L。同温度下，Synechococcus sp.的总碳水化合物含量为14.44±10.03 mg/L。分别为 269.44±81.29 mg/L、321.15±73.31 mg/L 和 1556.84±243.38 mg/L。这表明聚球藻的总碳水化合物含量高于假鱼腥藻。在 4±2°C、15±2°C 和 25±2°C 下，假鱼腥藻的总蛋白质含量分别为 5.59±0.09 mg/L、5.23±0.21 mg/L 和 4.34±0.47 mg/L。同时，对于聚球藻，总
用于实验生物学的海洋细菌模型
细菌在海洋环境中普遍存在且数量丰富（105-106细胞.mL−1），在海洋生态系统中发挥着多种作用，这是其长期进化和随后的遗传多样化的产物。某些物种在生物地球化学循环中发挥着关键作用，特别是光养蓝藻对初级生产的贡献，或异养细菌对这种生产的再矿化。其他细菌物种会导致人类和水产养殖设施患病，从而对人类健康和经济产生不利影响，而其他细菌物种则以协调的方式相互作用形成生物膜，导致海洋结构物生物污垢和腐蚀。相反，凭借其广泛的遗传多样性，细菌界提供了可在许多领域加以利用的化学和酶多样性，例如，海洋污染的生物修复或用于发现食品和医疗行业的新型天然产物。为了进一步了解这些不同的研究领域，需要简单易处理的细菌模型生物。在本章中，我们将简要介绍众所周知的非海洋细菌模型生物和良好模型生物的标准，并解释尽管海洋环境储量巨大，但可用的海洋模型却很少的一些原因。然后，我们将介绍四种应用于不同研究领域的不同海洋细菌模型，每种模型都有各自的具体问题和应用，但都依赖于我们将在本章末尾开发的类似工具包。
Annexure A提出的硕士课程提纲应用心理学第I＆II部分（年度系统）的附属学院
教学大纲概述：不同植物群的比较研究，其中包括病毒，细菌，藻类，真菌，地衣，苔藓植物，pteridophytes和Gymosperms。课程大纲：生命形式，结构，生殖和经济含义的比较研究。病毒（RNA和DNA类型），特别参考烟草病毒（TMV）。b。细菌和蓝细菌（NOSTOC，振荡器）。c。藻类：（衣原体，螺旋藻，Chara，Pinnularia，Ectocarpus和polysiphonia）。d。真菌：（粘液，青霉，植物学，乌斯蒂利亚，乌斯蒂利亚和阿甘里库），它们对农作物生产和工业应用的影响。e。地衣：（生理）。f。苔藓植物：i- riccia ii- Anthoceros iii- Funaria g。翼植物：i-化石和化石II-主要群体及其亲和力a。 psilopsida（psilotum）b。 Lycopsida（Selaginella）c。 Sphenopsida（Equisetum）d。翼虫（Marsilea）III-种子习惯h。 Gymnosperms ：（ Cycas，Pinus和Ephedra）模块的目的：该课程旨在提供有关不同植物群体及其系统发育关系的基本概念的足够知识。学习策略：1。讲座2。小组讨论3。实验室工作4。研讨会/研讨会学习成果：希望学生熟悉有关不同植物群体的形态和系统知识。他们将能够利用这些知识在其他学科中进行详细研究。
Long W，Li M，Gao Y，Zhang Y，Yuan X，Ye H，Huang H，Liang W，Zhang R，Du G.微生物群落，致病细菌和高风险的抗生物生物分离
抽象目标。该研究的目的是探索微生物群落，致病细菌和高风险抗生素抗生素基因的特征，沿海海滩与多功能宿主之间的相关性，以确定中国热带海岸海滩上的粪便源污染物的潜在物种生物标志物。“一项健康”方法用于海滩和温血宿主的微生物研究。微生物使用16S rRNA基因扩增子和shot弹枪元基因组学上分析了社区。非盐海滩的混乱，辛普森，香农和王牌索引大于属属和OTU级别的盐海滩（P <0.001）。bacteroidota，halanaerobiaeota，蓝细菌和富公司在盐海滩上很丰富（p <0.01）。人类采购的微生物在盐海滩上更丰富，占0.57％。粪便核酸杆菌和hallii菌群被认为是人类粪便污染的可靠指标。在盐海滩上观察到了耐高风险的碳苯甲酸克雷伯氏菌肺炎和基因型KPC-14和KPC-24。TET（X3）/TET（X4）基因和四种类型的MCR基因在海滩和人类上共发生； MCR9.1占多数。TET（X4）在蓝细菌中发现。在中国海滩上很少报道，但观察到病原体，例如藤本植物，肺炎军团菌和幽门螺杆菌。低微生物社区的多样性并未表明风险降低。高危ARM向极端沿海环境的转移应受到足够的关注。
选择Anabaena sp。 PCC 7938作为火星生物ISRU的蓝细菌模型
预计将在即将到来的12月举行的摘要船员任务。短期住宿后，希望永久存在能够实现大量的科学发现。这将需要为工作人员提供生命支持的消耗品，数量太大而无法从地球进口。这些消耗品的一部分可以在现场生产生物处理，但是不必进口原料。正在考虑的解决方案在于使用重18zotrophic，岩石 - 酸性蓝细菌作为主要生产者：喂养现场自然可用的材料，它们将提供其他生物所需的营养。这个概念最近已经取得了动力，但是由于缺乏贡献团队的一致性，尤其是共享模型有机体，进步会减慢进步。希望解决这个问题，我们介绍了为选择当前模型所做的工作。我们从怀旧家族的预选菌株开始。对Anabaena sp的基因组进行了测序。PCC 7938（唯一尚未可用的人）我们比较了菌株的基因组数据，以确定其相关性并提供对其生理学的见解。然后，我们评估并比较了相关特征：Chie ply，它们利用Martian Regolith营养素的能力，它们对高氯的耐药性（Regolith中存在的有毒化合物）以及作为中学生产者的原料（在这里是异养细菌和较高植物）。这导致选择了Anabaena sp。PCC 7938，我们建议作为模型蓝细菌，用于开发基于火星的Natu-Natu-lal资源。