a 新加坡国立大学-杜克医学院新发传染病项目,新加坡 169857;b 印度韦洛尔基督教医学院临床病毒学系,邮编 632004;c 新加坡卫生部国家公共卫生实验室,邮编 308442;d 新加坡中央医院分子病理学系,邮编 169608;e 新加坡国立大学医院实验室医学系,邮编 117597;f 莫纳什大学生物医学发现研究所微生物学系,邮编 3800,澳大利亚;g 世界卫生组织流感研究与监测合作中心,彼得·多尔蒂研究所,邮编 3000,澳大利亚;h 新加坡保健集团杜克-新加坡国立大学全球健康研究所,新加坡保健集团杜克-新加坡国立大学学术医学中心,邮编 169857;i 杜克大学杜克全球健康研究所,邮编 27710
图 1 Peromyscus maniculatus 和 Peromyscus polionotus 小鼠大脑中的基因表达。 (a) 两种焦点 Peromyscus 物种(粗体)与家鼠 (Mus)、大鼠 (Rattus) 和人类 (Homo) 的系统发育关系。 (b) 脑矢状切面示意图,突出显示了本研究中使用的 10 个(子)区域解剖位置(彩色)以及整个大脑(灰色)。 有关解剖的详细信息,请参见第 2 节和附表 S2。 (c) 基因表达整体变化的 t 分布随机邻域嵌入 (t-SNE) 图。 P. maniculatus 样本表示为朝下的三角形,P. polionotus 样本表示为朝上的三角形。 (d) 在一个或多个大脑区域中表达的基因数量(n = 16,078)。 (e)10 个(子)区域中私人表达基因的分布;511 个基因在整个大脑样本中表达,但在 10 个采样(子)区域中均未表达。
R2非长末端重复(非LTR)逆转录子是多细胞真核生物中分布最广泛的移动遗传元件之一,并且对在人类基因组的转基因补充中的应用显示出希望。他们以精致的特异性将新基因插入28S核糖体DNA中的保守位点。r2进化枝是由逆转录子编码的蛋白的N末端的锌指(ZF)数量定义的,该蛋白被认为是为添加赋予DNA位点特异性的。在这里,我们阐明了进化枝之间的R2 N末端结构域的DNA识别的一般原则,并具有广泛的,具体的识别,仅需要一个或两个紧凑型域。DNA结合和保护测定法证明了广泛共享以及进化枝特异性的DNA相互作用。基因插入测定识别足以用于目标位点插入的N末端结构域,并揭示了进化枝特异性ZFS中第二链裂解或合成中的作用。我们的结果对理解非LTR逆转录座插入机制的进化多样化以及基于逆转录座子的基因疗法的设计具有意义。
此预印本版的版权持有人于2025年2月11日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637618 doi:Biorxiv Preprint
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在社会感知中的同种偏见对于多种感觉方式和许多物种来说都是显而易见的。还有一个专门的神经网络用于灵长类动物的面部处理。然而,在视觉社会处理中,神经物种敏感性和面部灵敏度的进化起源和相对作用在很大程度上是未知的。在这项比较研究中,使用对狗(n = 20; 45%女性)和人类(n = 30; 50%女性)的功能磁共振检查,检查了对相同视觉刺激的物种敏感性和对相同视觉刺激的敏感性(人脸和狗面和枕骨的敏感性)。在狗中,双侧上丙基节的回和表现出偏见,没有区域表现出偏爱,并且大多数视觉响应的皮层比面部偏爱更大。在人类中,同种推荐区域(右杏仁核/海马和后颞上沟)也显示出面部偏爱,并且许多视觉响应的皮层表现出比偏好更大的面部偏爱。多元模式分析(MVPA)鉴定了这两个物种的物种敏感区域,但仅在人类中进行面向现场区域。各个物种的表示相似性分析(RSA)揭示了与其他对比相比,狗和人类反应模式之间的对应关系更强,以区分异种面孔。结果揭示了狗和人类的同性恋处理过程中的类比,但表明,面部感知的皮质专业化可能不会在整个哺乳动物中无处不在。
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二氟甲基化和二氟烷基化试剂,其中二氟甲基亚砜亚胺 10 和砜 9,11 因其在有机合成中的独特反应性而引起了广泛关注。二氟烷基亚砜亚胺和砜试剂的高度可调功能性在不同反应条件下表现出不同的反应性和选择性。Hu 等人报道,N-甲苯磺酰基-S-二氟甲基-S-苯基亚砜亚胺 [PhS(O)NTsCF 2 H] 可以在 NaH 存在下释放二氟卡宾,被 S-、N- 和 C-亲核试剂捕获(方案 1 a,左)。10a 相反,光催化使 PhS(O)NTsCF 2 H 成为二氟甲基自由基来源,用于烯烃的氧化二氟甲基化。 12 二氟甲基苯基砜 (PhSO 2 CF 2 H) 也采用了类似的活化策略,以 LHMDS 为碱进行去质子化生成亲核性 PhSO 2 CF 2 − 物质,13 而在电化学条件下则得到亲电性 PhSO 2 CF 2 自由基物质(方案 1 b)。14 然而,同时具有亚砜亚胺和砜官能团的二氟烷基化试剂的不同反应性和选择性尚未见报道(方案 1 c)。
湿地中的抽象水文转移是全球重要的甲烷(CH 4)来源,是CH 4排放和碳气候反馈的关键限制。对水文驱动的氧(O 2)的变化如何影响微生物CH 4循环的有限理解使湿地CH 4排放不确定。瞬态o 2暴露在温带沼泽中的植物泥炭中显着刺激了缺氧的CH 4产生,通过富集多酚氧化剂和多糖降解剂,从而增强了底物在随后的缺氧条件下朝着甲烷生成的流动。评估土壤微生物组结构和功能的转移是否在湿地类型的跨类型中相似,我们在这里检查了不同湿地土壤对瞬时氧合的敏感性。在从矿物营养的芬中植入泥炭泥炭的浆液中,以及淡水沼泽和盐泥的沉积物,我们检查了微生物体的时间变化以及浆液的地球化学表征和孵化向前空间。氧合不影响微生物组的结构和富含矿物质的Fen-Origin泥炭和淡水沼泽土壤中的缺氧CH 4产生。与O 2刺激的CH 4产生相关的关键分类单元在膜中泥炭中非常罕见,在芬罗根泥炭中支持微生物组的结构,这是湿地对O 2位变化的主要决定因素。与淡水湿地实验相反,盐泥地球化学(尤其是pH值)和微生物组的结构持续且显着改变后氧合作用,尽管对温室气体的排放没有显着影响。简介这些不同的反应表明,湿地可能对2波动有差异。随着气候变化的变化,湿地中的o 2变异性更大,我们的结果为湿地弹性的机制提供了帮助,并将微生物组结构作为潜在的弹性生物标志物。
海洋酸化(OA)深刻影响海洋生物化学,从而导致生物多样性损失。porifera通常被预测为获胜者分类单元,但是应对OA的策略可能会有所不同,并可能产生多样化的健身状况。在这项研究中,比较了基于V 3 - V 4 16S rRNA基因标记的微生物移位,均具有高微生物丰度(HMA)的邻居无聊的肾脏肾状态肾小管和低微生物含量(LMA)微生物群。海绵Holobionts在具有低pH值(PHT〜7.65)的CO 2通风系统中共发生,并且在Ischia岛附近具有环境pH(pHT〜8.05)的控制位点,代表了研究未来OA的自然类似物,并且面对全球环境变化,物种的反应。微生物的多样性和组成在两个物种跨越不同,但在不同的水平上有所不同。在Cunctatrix中检测到核心分类单元的数量增加,在OA下,在肾牙叶梭状芽孢杆菌中报道了更多样化和柔性的核心微生物组。通气S. cunctatrix表现出形态障碍,以及假定的压力诱导的营养不良的迹象,表现为:1)α多样性的增加,2)从海绵相关的微生物向海水微生物转移,以及3)高营养不良评分。肾形状在代替中,没有形态变化,失调分数低,并且α多样性的降低和排气标本中的核心分类量降低。因此,