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土壤环境与微生物特刊
“微生物”将极小的生物体与不断进化繁殖的生物体的概念相结合，这是微生物学学科的统一原则。我们的期刊认识到微生物的广泛多样性和相互联系性，并为从事任何原核或真核微生物的高质量基础和应用研究的科学家的原创文章提供了一个先进的出版平台，也为微生物群落的生态学、基因组学和进化研究以及在实验室中探索培养微生物的研究提供了平台。
鉴定元素组对EH CRISPR -CAS9系统及其在基因组工程中的应用
抽象的非编码RNA（CRRNA）是由定期间隔短的短膜重复序列（CRISPR）基因座（CRISPR）基因座和与CRISPR相关的（CAS）的（CAS）的蛋白形成的，形成了crispr-CAS系统形成的复合物，这些复合物形成了与CAS-CataLe creeavage crre creage creeavage crrecry crrecry creeaveage crecrecry crrecry creeavage物质相互作用的相互作用的相互作用的creve criss cospectes。这些核糖蛋白启用的核酸易于编程的靶向促进了基于CRISPR的分子生物学工具的实施，用于体内和DNA和RNA靶标的体外修饰。尽管到目前为止鉴定出靶向DNA的Cas核酸酶的多样性，但在Pyogenes链球菌SPCAS9的天然和工程衍生物是基因组工程中最广泛使用的，至少部分是由于它们的CATA-LECALLYTIC稳健性以及一个异常短的图案（5''-ngg-ngg-3'''Pam）farnk sequence。但是，SPCAS9变体的大尺寸会损害该工具向真核细胞的传递，并且需要较小的替代品。在这里，我们在元基因组中识别与较小的CAS9蛋白（EHCAS9）相关的新的CRISPR-CAS9系统，该系统靶向以5'-NGG-3'PAM为两侧的DNA序列。我们开发了一种简化的EHCAS9工具，该工具专门切割DNA靶标，可用于原核生物和真核细胞中的基因组编辑应用。
布氏锥虫中 RNA–DNA 混合相互作用蛋白的免疫沉淀揭示了保守和新的活性，包括控制抗原变异逃避免疫所需的表面抗原表达
摘要 RNA-DNA 杂交是基因组的表观遗传特征，可提供多种且不断增长的活动范围。通过表征与杂交相互作用的蛋白质，可以了解这些功能，但迄今为止，所有这些分析都集中在哺乳动物身上，这意味着尚不清楚在其他真核生物中是否也发现了类似的 RNA-DNA 杂交相互作用物。非洲锥虫是 Discoba 类群的单细胞真核寄生虫，在核心生物学的几个方面与其哺乳动物宿主存在显著差异。在这里，我们表明 DNA-RNA 杂交免疫沉淀结合质谱法在 T. brucei 哺乳动物和昆虫感染细胞中恢复了 602 个推定的相互作用物，其中一些提供在哺乳动物中也发现的活动，一些提供谱系特异性的活动。我们证明，三种因子（两种假定的解旋酶和一种 RAD51 旁系同源物）的缺失会改变布氏锥虫的核 RNA-DNA 杂交和 DNA 损伤水平。此外，每种因子的缺失都会影响寄生虫抗原变异免疫存活机制的运作。因此，我们的工作揭示了 RNA-DNA 杂交对布氏锥虫生物学的广泛贡献，包括宿主免疫逃避中的新功能以及可能对真核基因组功能至关重要的活动。
端到端的深度学习，具有基因预测的HMM
动机：超过25年，基于学习的真核基因预测因子是由隐藏的马尔可夫模型（HMM）驱动的，这些模型（HMMS）直接输入了DNA序列。最近，Holst等。与他们的程序直升机一起证明，可以通过将深度学习层与单独的HMM后处理器相结合，可以改善Ab Insi算真核基因预测的准确性。结果：我们提出了Tiberius，这是一种新型的基于深度学习的Ab Initio基因预测因子，端到端将卷积和长期的短期记忆层与可区分的HMM层整合在一起。Tiberius使用自定义基因预测损失，并接受了哺乳动物基因组预测的培训，并对人类和两个基因组进行了评估。它显着胜过现有的从头算法，在人类基因组的基因水平下达到62％的F1分数，而下一个最佳AB始于方法的F1得分为21％。在从头模式下，提比略（Tiberius）预测了三个人类基因中两个的外显子内结构，而没有误差。非常明显，即使是Tiberius的Ab从头算精度也匹配Braker3的原始精度，Braker3使用RNA-Seq数据和蛋白质数据库。Tiberius高度平行的模型是最新的基因预测方法，在2小时内处理人类基因组。可用性和实施：https：//github.com/gaius-augustus/tiberius contact：{lars.gabriel，mario.stanke}@uni-greifswald.de
M2实习建议2025
Naegleria属的成员属于主要的真核谱系杂果。这些自由生活的变形虫（单细胞真核生物）在土壤和淡水栖息地中无处不在，是细菌的重要捕食者。描述的47种Naegleria物种，N。Fowleri是唯一对人类致病性的人，导致罕见但暴发的原发性反向脑膜脑炎，死亡率为97％。尽管牛乳杆菌和对其基因组的持续研究具有显着的临床意义，但其致病性的基因组机制仍在很大程度上未知。
免疫词：免疫相互作用药物的免疫调节评估平台
当您与糖基团研究所合作时，您将获得我们最先进的基础设施和世界领先的科学专业知识。糖胶菌免疫母体平台研究所依赖于使用我们具有广泛配备的糖碱分析设施，该设施提供了用于定制印刷幻灯片的微阵列制造套件，以使用表面质子膜共振来表征结合动力学。糖叠式分析设施支持确定蛋白质，整个真核和原核细胞，寄生虫和病毒的聚糖结合曲线，以确定这些结合相互作用的表征。
入门微生物学
¾课程代码：MCB112¾课程标题：入门微生物学¾单位数：2个单位¾课程持续时间：每周两个小时¾课程协调员：教授（MRS）M.O。Bankole PhD¾电子邮件：aadmokole@yahoo.com¾办公室地点：A212室，Colnas¾其他讲师：（MRS）Afolabi Dr S.A. Balogun博士1.原核生物和微生物真核生物的原核生物和真核生物细胞结构，对真核和原核生物的主要群体的调查2。不同科学家对微生物学发展的微生物学贡献的历史和发展3。微生物学的范围4。微生物作为生物实体的简介5。自然界中微生物的分布6。对微生物作为朋友和敌人的简短调查：有益和有害的微生物在与植物，动物和人的关系中扮演多个角色。这是微生物学学生的强制性课程1。Pelczar，M.J.，Reid，R.D。和Chan，E.C.S。 微生物学。 McGraw-Hill Book Company。 纽约。 第四版。 1977。 2。 Pyatkin，K。和Krivoshein，Y。微生物学。 Mir Publishers，莫斯科。 1980 3。 Pelczar，M.J.，Krieg，N。和Chan，E.C.S。 微生物学：概念和应用。 McGraw-Hill，纽约。 国际版。 1993 4。 Willey，J.M。，Sherwood，L.M。 和Woolverton，C.J。 Prescott，Harley和Klein的微生物学。 国际版。 McGraw-Hill，纽约。 2008和Chan，E.C.S。微生物学。McGraw-Hill Book Company。纽约。第四版。1977。2。Pyatkin，K。和Krivoshein，Y。微生物学。Mir Publishers，莫斯科。1980 3。Pelczar，M.J.，Krieg，N。和Chan，E.C.S。 微生物学：概念和应用。 McGraw-Hill，纽约。 国际版。 1993 4。 Willey，J.M。，Sherwood，L.M。 和Woolverton，C.J。 Prescott，Harley和Klein的微生物学。 国际版。 McGraw-Hill，纽约。 2008Pelczar，M.J.，Krieg，N。和Chan，E.C.S。微生物学：概念和应用。McGraw-Hill，纽约。国际版。1993 4。Willey，J.M。，Sherwood，L.M。 和Woolverton，C.J。 Prescott，Harley和Klein的微生物学。 国际版。 McGraw-Hill，纽约。 2008Willey，J.M。，Sherwood，L.M。和Woolverton，C.J。Prescott，Harley和Klein的微生物学。国际版。McGraw-Hill，纽约。2008