抽象的人群物种,尤其是trichocarpa,长期以来一直是基因组研究的模型树,这是由于完全测序的基因组。然而,高杂合性和重复区域的存在,包括丝粒和核糖体RNA基因簇,剩下了59个未解决的间隙,占三分法P. trichocarpa基因组的3.32%。在这项研究中,改进了愈伤组织诱导方法,以从P. ussuriensis花药中得出双倍的单倍体(DH)愈伤组织。利用长阅读测序,我们成功地组装了一个几乎没有间隙的,端粒到telomere(T2T)P。ussuriensis基因组,跨越了412.13 MB。该基因组组件仅包含7个间隙,其重叠n50长度为19.50 MB。注释显示该基因组中有34,953个蛋白质编码基因,比trichocarpa多465个。值得注意的是,中心区域的特征是高阶重复序列,我们在所有DH基因组染色体中鉴定了和注释的中心粒区域,这是杨树的第一个。衍生的DH基因组表现出与毛thocarpa的高共线性,并显着填补了后者基因组中存在的空白。此T2T P. ussuriensis参考基因组不仅会增强我们对基因组结构的理解,并在杨树属内的功能增强了我们的功能,而且还为杨树基因组和进化研究提供了宝贵的资源。
二维半导体 - 螺旋体异质结构构成了许多纳米级物理系统的基础。但是,测量此类异质结构的性质并表征半导体原位是具有挑战性的。[1]最近的一项实验研究能够使用超流体密度的微波测量值探测杂质内的半导体。这项工作表明,由平面磁场引起的半导体中超流体密度的迅速耗竭,在存在自旋轨道耦合的情况下,这会产生所谓的Bogoliubov Fermi Sur- sus。实验工作使用了一个简化的理论模型,该模型忽略了半导体中非磁性疾病的存在,因此仅在定性上描述数据。是由实验激励的,我们引入了一个理论模型,该模型描述了一个具有强旋转轨道耦合的无序半导体,该模型由超级导体邻近。我们的模型为状态密度和超流体密度提供了特定的预测。存在疾病的存在导致无间隙超导阶段的出现,这可能被视为Bogoliubov Fermi表面的表现。应用于真实的实验数据时,我们的模型显示出了出色的定量一致性,并在考虑到磁场的轨道贡献后,提取了材料参数(如平均自由路径和迁移率),以及e ef the g-tensor。我们的模型可用于探测其他超导体 - 症状导体异质结构的原位参数,并可以进一步扩展以访问运输特性。
全基因组测序和组装彻底改变了植物遗传学和分子生物学。然而,第一代和第二代技术的显着缺点导致了不完善的参考基因组:高质量或不确定的序列的大量和较大的差距高度重复性DNA的领域以及有限的染色体相限制,研究人员限制了研究人员表征最近期犯罪事件的调节性非编码元素和谱系区域的能力。最近,长阅读测序的进步导致了植物基因组的第一个无间隙,端粒到端粒(T2T)组件。这种飞跃有可能提高基因组学和分子实验的速度和信心,同时降低研究界的成本。
