动机:由于基因组图是代表人群中遗传多样性的强大数据结构,因此它们可以帮助识别传统线性参考遗漏的基因组变异,但它们的复杂性和大小使对基因组图的分析变得具有挑战性。我们试图开发一种基因组图分析工具,该工具通过解决现有工具的局限性来帮助这些分析更容易访问。具体来说,我们提高了可扩展性和用户友好性,并提供了许多新的统计信息以进行图形评估。结果:我们开发了一种有效,全面和集成的工具Gretl,以通过提供广泛的统计数据来分析基因组图并获得对其结构和组成的见解。gretl可以用于评估不同的图表,比较图形构造管道的输出与不同的参数,并对单个图进行深入分析,包括特定于样本的分析。借助Gretl,可以确定遗传变异和潜在目标区域的新型模式,以便以后进行更详细的检查。我们证明,Gretl在速度方面优于其他工具,尤其是对于较大的基因组图。可用性和实现:Gretl在Rust中实现。评论的源代码可在MIT许可证上获得https://github.com/moinsebi/gretl。文档中提供了如何运行gretl的示例。几个Jupyter笔记本电脑是存储库的一部分,可以帮助可视化Gretl结果。
摘要:本文提出的讨论是指关于循环经济的广泛理解和生态创新相关问题,特别关注两者之间的双向关系。基于欧盟成员国在该领域的活动的数据,本文的目的是评估循环经济对生态创新发展的影响。首先,从循环经济的角度出发了可持续发展的思想,以及其感知的变化。此外,欧盟委员会在欧盟成员国的立法方面得到了强调。欧盟委员会关于不可持续的生产和消费的预测发起了文献综述。在同一部分中,提供了循环经济和生态创新的定义,并且在科学出版物中经常强调了这两个方面之间的密切关系。logit模型是为了验证循环经济对生态创新发展的影响。为此,使用了Gretl ConereTric软件包。循环经济指标和欧洲委员会网站可用的生态创新指标用作模型中的诊断变量。在两种情况下,logit模型表示所讨论区域之间存在显着关系,该区域也作为线性回归函数表示。在最后阶段,得出了结论,其中包括研究局限性和未来的研究指示。
4AOP 自动大气吸收图集操作版本 6SV1 太阳光谱中卫星信号的第二次模拟,版本 1 ASCII 美国信息交换标准代码 ANOVA 方差分析 ASTER 先进星载热发射和反射辐射计 BRDF 双向反射分布函数 CASI 紧凑型机载光谱成像仪 CDOM 有色溶解有机物 CRTM 社区辐射传输模型 CNES 法国国家空间研究中心 CRTM 社区辐射传输模型 CRTM 社区辐射传输模型 CZCS 沿海区彩色扫描仪 ENVISAT 环境卫星 ESA 欧洲空间局 FOV 视场 GDAL 地理空间数据抽象库 GIS 地理信息系统 GPS 全球定位系统 GRASS 地理资源分析支持系统 GRETL GNU 回归、计量经济学和时间序列库 HCMR 希腊海洋研究中心 GUI 图形用户界面HyMap 高光谱测绘仪 ILWIS 综合陆地和水域信息系统 iPAQ internet CompAQ 出品的掌上电脑 KOPRA Karlsruhe 优化和精确辐射传输算法 LAD 最小绝对偏差 LAI 叶面积指数 Landsat TM Landsat 专题测绘仪 Landsat ETM+ Landsat 增强专题测绘仪 Plus MERIS 中分辨率成像光谱仪 MIPAS 用于被动大气探测的迈克尔逊干涉仪 MODIS 中分辨率成像光谱辐射计 NASA 美国国家航空航天局
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