导管癌原位(DCIS)是一种无创类型的乳腺癌类型,具有侵入性和影响死亡率的高度可变的潜力。目前,由于缺乏特定的生物标志物,可将低风险病变与较高进展风险的患者区分开来,因此许多DCI患者被过度治疗。在这项研究中,我们分析了来自不同患者的57个纯DCI和313种侵入性乳腺癌(IBC)。 获得了三个级别的基因组数据;基因表达,DNA甲基化和DNA拷贝数。 我们进行了亚型分层分析和DCI和IBC之间的关键差异,这些差异表明亚型特定进展。 在基底样亚型的肿瘤中发现了显着差异:基础样的DCI的增殖较小,并且比基底样IBC显示出更高的分化程度。 此外,与IBC相反,在DCIS之间未识别核心基底肿瘤(以与基底质心相关的高度相关)。 在拷贝数水平上,与基底类的IBC相比,基底样的DCIS显示出较少的拷贝数畸变。 与基底样的DCI和正常组织相比,通过甲基甲基化的分析是基底样IBC中多重原钙粘着蛋白基因的高甲基化,这可能是由远程表观遗传沉默引起的。 这表明在基础类亚型的IBC中特异性地对细胞粘附相关基因进行沉默。在这项研究中,我们分析了来自不同患者的57个纯DCI和313种侵入性乳腺癌(IBC)。获得了三个级别的基因组数据;基因表达,DNA甲基化和DNA拷贝数。我们进行了亚型分层分析和DCI和IBC之间的关键差异,这些差异表明亚型特定进展。在基底样亚型的肿瘤中发现了显着差异:基础样的DCI的增殖较小,并且比基底样IBC显示出更高的分化程度。此外,与IBC相反,在DCIS之间未识别核心基底肿瘤(以与基底质心相关的高度相关)。在拷贝数水平上,与基底类的IBC相比,基底样的DCIS显示出较少的拷贝数畸变。与基底样的DCI和正常组织相比,通过甲基甲基化的分析是基底样IBC中多重原钙粘着蛋白基因的高甲基化,这可能是由远程表观遗传沉默引起的。这表明在基础类亚型的IBC中特异性地对细胞粘附相关基因进行沉默。我们的工作证实,在研究从DCIS到IBC的进展时,亚型地层是必不可少的,并且我们提供了证据,表明基底样DCIS表现出较小的侵略性,并质疑基底样DCIS是基底样DCIS是基础类似基底类似的乳腺癌乳腺癌的直接前体。
建立肽序列与原纤维形成之间的基本关系对于理解蛋白质错误折叠过程和指导生物材料设计至关重要。在这里,我们将全原子分子动力学(MD)模拟与人工intel-ligence(AI)相结合,以研究短肽序列排列的细微变化如何影响其形成原纤维的倾向。我们的结果表明,疏水残基的分布和电荷簇的分布很小,可以显着影响成核速率和跨β结构的稳定性。为了快速扩展此分析,我们开发了一个主动学习 - 增强的框架 - 用于分子动力学的机器学习(ML4MD),从而根据MD衍生的聚合数据迭代地完善了其预测。ML4MD有效筛选了许多肽排列,并指导发现先前未识别的原纤维式序列,从而在接收器操作特征(ROC)曲线(AUC)下达到0.939的接收器下方。总体而言,ML4MD通过将详细的原子模拟与快速和高敏锐的ML预测整合在一起,简化了淀粉样蛋白样肽的合理设计。
卡拉·沃斯(Kara Voss)博士模型顾问气候与可持续发展分公司加利福尼亚州保险部尊敬的沃斯博士:我想参加Verisk Prid程序。作为一名政策分析师和经济学家,一直在研究加利福尼亚保险市场多年来,我寻求帮助促进开发和采用野火模式,以提高保险公司准确价格野火风险并为缓解措施提供适当折扣的能力。我还是由加利福尼亚保险局赞助的公共野火模型战略小组。更好地了解私营部门模型的能力将有助于委员会了解公共模式如何利用私营部门的努力以及公共模式中需要什么能力。,劳埃德·迪克森·劳埃德·迪克森(Lloyd Dixon Lloyd Dixon)高级经济学家兼肯尼斯·费恩伯格(Kenneth R. Feinberg
。cc-by-nc 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以显示预印本(未通过同行评审证明)的预印版本的版权所有者,该版本持有人于2025年2月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.12.12.25322150 doi:medrxiv Preprint
背景:乳腺癌是全球女性死亡的十大原因之一。约 20% 的患者被误诊,导致早期转移、治疗耐药和复发。许多临床和基因表达谱已成功用于将乳腺肿瘤分为 5 种主要类型,这些类型具有不同的预后和对特定治疗的敏感性。不幸的是,这些谱未能将乳腺肿瘤细分为更多亚型,以提高诊断率和存活率。可变剪接正在成为一种新的高度特异性生物标志物来源,用于将肿瘤分为不同等级。利用乳腺癌细胞系 (CCLE) 和乳腺癌肿瘤 (TCGA) 中的大量公共转录组学数据集,我们已经解决了可变剪接变体对高度侵袭性乳腺癌进行细分的能力。
引用MA,S。(2025年,2月12日)。 使用新型的光激活病毒样药物结合物靶向眼恶性肿瘤。 摘自https://hdl.handle.net/1887/4180425引用MA,S。(2025年,2月12日)。使用新型的光激活病毒样药物结合物靶向眼恶性肿瘤。摘自https://hdl.handle.net/1887/4180425
Kimberly M. Holter 1,博士; McKenna G. Klausner 1,BS;玛丽·亨特·海特(Mary Hunter Hite)1; Carson T. Moriarty 1,MS; Samuel H. Barth 1,博士; Bethany E. Pierce 1,MS; Alexandria N. Iannucci 1,BS;道格拉斯·J·谢弗勒(Douglas J. Sheffler)2,博士;尼古拉斯D.P. Cosford 2,博士; Heather A. Bimonte-Nelson 3,博士; Kimberly F. Raab-Graham 1,博士;罗伯特·W·古尔德(Robert W. Gould)1博士Kimberly M. Holter 1,博士; McKenna G. Klausner 1,BS;玛丽·亨特·海特(Mary Hunter Hite)1; Carson T. Moriarty 1,MS; Samuel H. Barth 1,博士; Bethany E. Pierce 1,MS; Alexandria N. Iannucci 1,BS;道格拉斯·J·谢弗勒(Douglas J. Sheffler)2,博士;尼古拉斯D.P.Cosford 2,博士; Heather A. Bimonte-Nelson 3,博士; Kimberly F. Raab-Graham 1,博士;罗伯特·W·古尔德(Robert W. Gould)1博士Cosford 2,博士; Heather A. Bimonte-Nelson 3,博士; Kimberly F. Raab-Graham 1,博士;罗伯特·W·古尔德(Robert W. Gould)1博士
1 POITIERS,国家科学研究中心UMR7267,《互动生态与生物学实验室》,TSA51106,86073 POITIERS,法国2学院2帕斯德研究所,生物图像分析单元,国家科学研究中心UMR3691,ParisCité大学,国家科学研究中心elisabeth.labruyere@pastteur.fr(E.L。); jean-christophe.olivo-marin@pastteur.fr(J.-C.O.-M。)3 Pasteur,蛋白质组学核心设施,生物学质谱单元质谱单元,国家科学中心,2024年2024年,巴黎大学Cité大学,法国75015 Paris,法国,法国,法国75015 Paris; Mariette.matondo@pastteur.fr 4国家科学研究中心药理学与结构生物学研究所UMR 5089,图卢兹大学IIIII-PAUL SABATIER,法国31077,法国图卢兹; Marie.locard-paulet@ipbs.fr 5 Proteomique Profi的国家基础设施-FR2048,2048法国Toulouse 6 C. nguillen@pastteur.fr(n.g。);这样的。: +33-(0)549454013(A.S.-L。); +33-(0)145688675(N.G.)