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肠道微生物组衍生的水解酶——一个被低估的目标……
近年来，人们对肠道微生物组衍生的水解酶与口服药物代谢的关系研究越来越感兴趣，尤其关注天然药物。尽管天然药物在口服药物领域具有重要意义，但对肠道微生物组衍生的水解酶与这些药物之间的调控相互作用的研究却很少。本综述从三个关键角度深入探讨了肠道微生物组衍生的水解酶与天然药物代谢之间的相互作用。首先，研究了糖苷水解酶、酰胺水解酶、羧酸酯酶、胆汁盐水解酶和环氧化物水解酶对天然产物结构的影响。其次，探讨了天然药物如何影响微生物组衍生的水解酶。最后，分析了水解酶与天然产物相互作用对疾病发展的影响以及开发微生物衍生酶的挑战。本综述的总体目标是为新型天然药物的研究和开发以及个性化治疗的进步奠定坚实的理论基础。
对微生物组衍生的代谢功能和肝病转化研究的批判性综述
肠道微生物组成的显着变化与慢性肝病有关。使用临床前模型，已经证明乙醇/酒精诱导的肝病是通过粪便微生物群移植（FMT）传播的。因此，严重酒精性肝炎患者的存活率变得更好，这表明肠道菌群的构成和功能的变化在代谢肝病中起作用。泄漏的肠壁屏障在通过肠道微生物群的影响与代谢相关的肝脏疾病发展中起着重要作用。结果，可行的细菌和微生物产物可以传输到肝脏，引起炎症，导致肝细胞死亡并引起邻链反应。随着代谢相关的肝病的开始并变得更糟，肠道营养不良与免疫系统的变化，胆汁酸组成和肠道中微生物群的代谢功能有关。代谢相关的肝病及其自我永久疾病将使用临床前和人类研究的数据来证明。此外，我们总结了未靶向的治疗方法如何影响代谢相关肝病的肠道菌群，包括饮食变化，益生菌，抗生素和FMT。它讨论了靶向疗法如何改善各个地区的肝病。这些方法可以改善代谢相关的肝病治疗选择。
肠道微生物组和糖尿病 - 审查
虽然有广泛的信息有关肠道菌群如何改变正常人与糖尿病个体之间的组成，但几乎没有证据表明在糖尿病前期发生的变化是否显而易见（T2DM的初步状态对T2DM的变化，这些变化与这些变化相对于正常的eugglycemempiations and themiabiaia而在e -euglycemempiation中的特征），以及与正常的链接有关）以及 糖尿病。在这篇综述中，我们的目标是总结肠道微生物组中的组成转移的所有发现，这些发现与尤金血糖状态相比，这些发现显示在糖尿病前和糖尿病的个体中发生。我们的综述还强调了由于肠道中存在不同微生物环境而导致的新陈代谢改变的潜在病理生理机制。此外，我们还收集了有关各种因素所起的作用的可用证据，例如饮食变化和运动，以及它们在诱导肠道微生物组变化中的潜在作用。最后但并非最不重要的一点是，我们的审查还评估了随后的益生菌和共生，二甲双胍和acarbose带来的微生物群的变化。此外，我们还评估了上述干预措施在减轻糖尿病前期糖尿病的进展中的使用。我们认为，这项综述可以帮助了解肠道微生物组在糖尿病前期发作的动态作用，以及是否有可能通过正确的措施恢复到尤格利西亚。
健康的人类微生物组
人类的遗传构成实际上是相同的，但是我们DNA的小差异引起了人口的巨大表型多样性。相比之下，人类微生物组的元基因组（居住在我们体内的微生物的总DNA含量）的变化更大，其中只有三分之一的成分基因在大多数健康个体中发现。了解“健康微生物组”中的这种变异性是微生物组研究的主要挑战，至少可以追溯到1960年代，继续通过人类微生物组项目及以后。对支持健康的必要和足够的微生物组特征进行分类，以及在健康人群中这些特征的正常范围，是识别和纠正与疾病有关的微生物构型的重要第一步。朝向这一目标，一些人口规模的研究记录了通常在健康人群的微生物中观察到的分类学组成和功能潜力的范围和多样性，以及可能的驱动因素，例如地理，饮食和生活方式。在这里，我们回顾了出现的“健康微生物组”的几个定义，当前对健康微生物多样性范围的理解以及分子功能的表征以及未来要解决的生态疗法的差距。
肿瘤内微生物组对肺癌的影响：单个...
与脑转移和副肿瘤正常组织相比，与真菌相关细胞的比例在原发性肺癌病变中是最高的，而与原发性肺部肿瘤和副肿瘤组织相比，细菌相关细胞的比例最丰富。同时，在不同组织类型的样品样品中细胞类型的比例存在差异，并且在不同细胞类型中真菌和细菌的分布存在显着差异。
土壤微生物组的移植，以增强萨尔维亚官方的干旱反应。
结果：我们的结果表明，对三种根瘤菌的接种并没有增强植物总生物量，而它显着影响了植物建筑，生态生理学和代谢反应。与JP根瘤菌组接种的接种导致根生物量显着增加，从而导致较小的叶子和较高的叶子数。这些形态学的变化表明，改善了取水和温度调节策略。此外，在接种了来自PJ和PL的微生物组的植物中观察到了不同的气孔电导模式，表明对干旱胁迫的反应发生了改变。代谢组分析表明，根瘤菌的移植显着影响了S. officinalis的叶片代谢组。所有三个根瘤菌促进了酚类化合物，萜类化合物和生物碱的积累，已知在植物防御和应激反应中起着至关重要的作用。五个分子（Genkwanin，β-离子酮，苏莫醇，β-贝氏蛋白贝苯胺A-甲基酯和cinnamoyl-beta-d-d-葡萄糖苷）通常积聚在接种的鼠尾草叶片中，与微生物组无关。此外，根据特定的接种根瘤菌组观察到独特的代谢改变，强调了植物 - 微生物相互作用的专业性质，并可能将这些特定分子用作监测有益微生物的募集的生物标志物。
棉叶卷曲疾病抑制的微生物群移植⠎核心微生物组和转录组动力学
微生物群移植是管理植物性疾病的强大工具。这项研究研究了微生物群移植对棉叶毛皮疾病（CLCUD）抗性的影响，该物种长度良好，但对生物胁迫的敏感性很高。分析了抗clcud抗性物种gossypium arboreum的v3-v4 16S rRNA基因扩增子，来自根际和腓骨层的微生物馏分以及易感棉花品种。已经确定了与疾病抗性相关的独特细菌分类群。进行了种间和种内微生物群移植，然后进行CLCUD发病率分析。可以看出，从G. arboreum fdh228中移植的根际微生物群体显着抑制了G. hirsutum品种中的Clcud，表现优于外源水杨酸的施用。虽然浮游移植也降低了疾病的发生，但它们的效率不如根际移植。差异表达分析DESEQ2用于识别与Clcud抑制相关的关键细菌属，包括pseudoxanthomonas和stenotrophomonas在G. arboreum fdh228的根际中。功能途径分析揭示了耐受物种中应力反应和代谢的上调。转录组学揭示了与蛋白质磷酸化和种间根际微生物群移植中有关的基因上调。这项研究强调了微生物群移植是一种可持续的方法，用于控制CLCUD以及有助于Clcud耐药性的特定微生物和遗传机制。
算法，专家还是两者？评估特征选择方法对用户偏好和Reliance
sof umer洞穴是一个未开发的极端环境，可容纳新型微生物和潜在的遗传资源。来自洞穴的微生物组已被遗传适应以产生各种生物活性代谢产物，使它们能够生存并耐受苛刻的结合。然而，尚未探索Sof umer Cave微生物中与生物合成相关的基因簇标志。因此，使用高通量shot弹枪测序来探索sof umer Cave的微生物组中与生物合成相关的基因簇（BGC）。Geneall DNA土壤迷你试剂盒用于从均质样品中提取高分子量DNA，并使用Novaseq PE150对纯化的DNA进行测序。根据微-RN数据库，乌默洞穴中最常见的微生物属是原细菌，静脉细菌，verrucomicrobobiota和蓝细菌。对与生物合成相关的基因簇进行了注释并分类，并使用抗石和NAPDOS1预先对BGC进行预令。确定了编码广泛的二级代谢物的BGC的460个推定区域，包括RIPP（47.82％），萜烯（19.57％），NRPS（13.04％），杂种（2.18％）和其他新的注释（10.87％）com punds。此外，NAPDOS管道还从链霉菌素的链霉菌素（链霉菌素基因肌链霉菌素）中鉴定出钙依赖性的抗生素基因簇，来自链霉菌Chrysomallus的放线菌素基因簇和来自链霉菌链霉菌的博霉素基因簇。这些发现突出了Sof Umer Cave微生物组的未开发的生物合成潜力，以及其发现天然产物的潜力。
驯化植物会影响其微生物组，研究发现
概念模型说明了如何通过驯化的植物表型来利用对植物细菌群落的驯化作用在这项研究中利用的，我们发现了在驯化和细菌群落层次变化期间选择的植物特征之间统计关系的证据。基于本研究中测得的植物特征，与野生对应物相比，驯化的植物具有较低的表型多样性和相似的手段。因此，我们可以预期，驯化植物中细菌群落组成的差异比野生植物中的差异要弱。我们报告了支持这一假设的三层证据。首先，适合每个SV的广义线性模型的总体AIC表明，使用植物特征作为解释变量在统计学上比使用定性解释变量（生物状态）更好。第二，高斯副群模型证实了AIC分数的结果，除了Lunatus，实际上，野生和驯化植物之间的表型差异比P. vulgaris弱。最后，随机森林分类器提供了由驯化过程产生的微生物特征的证据，该过程与驯化事件无关。信用：当前的生物学（2024）。doi：10.1016/j.cub.2023.12.056
粘蛋白 - 微生物组相互作用在牲畜呼吸道疾病中的预测能力
抽象复杂的呼吸道疾病是全球牲畜行业的重大挑战。这些疾病极大地影响了动物健康和福利，并造成严重的经济损失。病原体防御的第一线结合了呼吸道粘液，一种主要由粘蛋白组成的高度粘性物质以及繁荣的多象胸部微生物生态系统。微生物组 - 麦氨基蛋白相互作用可保护不需要的物质和生物体，但其功能障碍可能会引起致病性感染和呼吸道疾病的发作。新兴的证据还表明，非编码调节RNA可能会调节微生物组粘膜关系的结构和功能。本意见论文在兽医感兴趣的动物的呼吸道感染背景下发掘了粘蛋白，微生物组和非编码RNA之间三角关系的当前理解。有必要查看这些分子基础，这些基础决定了独特的健康和疾病结果，以实施针对不同流行病学环境量身定制的有效预防，监视和及时的干预策略。