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通过变性梯度凝胶电泳分析聚合酶链反应扩增的基因编码复杂微生物种群
我们描述了一种分析复杂微生物种群遗传多样性的新型分子方法。该技术基于通过变性梯度凝胶电泳 (DGGE) 分离编码 16S rRNA 的聚合酶链式反应扩增基因片段，这些片段的长度相同。对不同微生物群落的 DGGE 分析表明，分离模式中存在多达 10 个可区分的条带，这些条带很可能来自构成这些种群的许多不同物种，从而生成了种群的 DGGE 图谱。我们表明，可以识别仅占总种群 1% 的成分。使用针对硫酸盐还原菌 16S rRNA 的 V3 区特异性的寡核苷酸探针，可以通过杂交分析识别某些微生物种群的特定 DNA 片段。对在有氧条件下生长的细菌生物膜的基因组 DNA 进行分析表明，尽管硫酸盐还原菌具有厌氧性，但它们仍存在于这种环境中。我们获得的结果表明，该技术将有助于我们了解未知微生物种群的遗传多样性。
2023 年中国北京儿童肺炎支原体分离株体外抗菌耐药性增强
结果：肺炎支原体分离株对红霉素和阿奇霉素的耐药率均为100%（62/62）。乙酰螺旋霉素（16元大环内酯类）的最低抑菌浓度（MIC）低于红霉素和阿奇霉素。2023年阿奇霉素的MIC明显高于2021年和2022年。未观察到对四环素和左氧氟沙星的耐药。74.2%和25.8%的分离株被鉴定为P1型1型和P1型2型，M4-5-7-2（61.3%）和M3-5-6-2（22.6%）为主要的多位点可变数目串联重复分析（MLVA）类型。所有分离株均存在A2063G突变（100%）。59例患者中，45例（76.3%）为重症肺炎支原体肺炎，14例（23.7%）合并感染。发热持续时间为12天（1～30天），大环内酯类抗生素治疗后发热持续时间为8天（1～22天）。
生物炭和秸秆改良剂促进盐渍灌溉棉田中微生物对磷动态的调节
咸水滴灌是解决干旱地区淡水短缺问题的一个潜在解决方案。然而，长期使用会使土壤盐分积累并降低磷 (P) 的有效性。生物炭和秸秆改良剂已被证明可以减轻这些影响，但它们在调节长期咸水灌溉下参与磷转化的微生物基因方面的机制仍不清楚。本研究旨在评估生物炭和秸秆掺入对盐灌棉田土壤微生物群落结构和磷有效性的影响。基于 14 年的田间试验，开发了三种处理方法：仅咸水灌溉 (CK)、咸水灌溉加生物炭 (BC) 和咸水灌溉加秸秆 (ST)。结果表明，这两种改良剂都显著提高了土壤含水量、有机碳、总磷、有效磷和无机磷组分 (Ca 10 -P、Al-P、Fe-P 和 OP)，同时降低了土壤电导率和 Ca 2 -P 和 Ca 8 -P 组分。生物炭增加了 Chloro flexi、Gemmatimonadetes 和 Verrucomicrobia 的相对丰度，而秸秆则促进了 Proteobacteria 和 Planctomycetota 的丰度。两种处理均降低了几种 P 矿化基因（例如 phoD、phoA）的丰度并增加了与 P 溶解相关的基因（例如 gcd）。相关性研究表明，微生物种群和 P 循环基因与土壤特性紧密相关，其中 Ca 2 -P 和 Al-P 是重要的介质。通常，在长期含盐灌溉下，生物炭和秸秆改良剂可降低土壤盐分，提高土壤 P 的有效性，降低磷循环相关微生物基因的表达并改善土壤特性。这些结果使它们成为可持续土壤管理的绝佳技术。
理学学士微生物学第一学期和第二学期课程大纲
总学时：56 单元 1. 微生物学的简介、历史和范围 14 小时 1. 微生物和生命起源。 2. 微生物学的历史发展 - 自然发生和生物发生理论。 安东尼·冯·列文虎克、爱德华·詹纳、拉扎罗·斯帕兰扎尼、路易斯·巴斯德、约瑟夫·利斯特、罗伯特·科赫、亚历山大·弗莱明、贝耶林克、维诺格拉茨基和伊万诺夫斯基的贡献。 3. 印度科学家对微生物学领域的贡献。 4. 作为一门现代和相关健康科学的微生物学范围。 5. 微生物学的分支。 单元 2. 微生物学中使用的仪器和染色技术 14 小时 显微镜 1. 显微镜原理 - 分辨力、数值孔径、焦距和放大倍数 2. 显微摄影原理。 3. 工作原理和应用 a) 简单和复合显微镜 b) 暗场显微镜 c) 荧光显微镜 d) 电子显微镜 -TEM 和 SEM
肠道微生物组衍生的水解酶——一个被低估的目标……
近年来，人们对肠道微生物组衍生的水解酶与口服药物代谢的关系研究越来越感兴趣，尤其关注天然药物。尽管天然药物在口服药物领域具有重要意义，但对肠道微生物组衍生的水解酶与这些药物之间的调控相互作用的研究却很少。本综述从三个关键角度深入探讨了肠道微生物组衍生的水解酶与天然药物代谢之间的相互作用。首先，研究了糖苷水解酶、酰胺水解酶、羧酸酯酶、胆汁盐水解酶和环氧化物水解酶对天然产物结构的影响。其次，探讨了天然药物如何影响微生物组衍生的水解酶。最后，分析了水解酶与天然产物相互作用对疾病发展的影响以及开发微生物衍生酶的挑战。本综述的总体目标是为新型天然药物的研究和开发以及个性化治疗的进步奠定坚实的理论基础。
食品系统，微生物瘤和健康项目...
主角：Harry Sokol（Inserm/ap-HP），共同领导的Sylvie Claeysen（Inserm）合作伙伴：Celine Versuyft（Biobanques 2030），Yves-Edouard Herpe（BRC国家网络）（BRC国家网络），Christian Morabito（INRAE），AP-HP BARM BRC，INRAE SAMBO BRC SAMI，INRAEB BRC SAMBO SAMI的企业，来自目标
布干维尔使命：为节约、合作和可持续地测量海洋微生物群做出贡献
索邦大学是一所世界一流的研究型多学科大学，涵盖文学与人文、医学、科学与工程等学科领域。索邦大学位于巴黎市中心，业务遍及该地区，拥有 52,000 名学生、6,400 名教学和研究人员以及一百多个实验室。它与索邦大学联盟的合作伙伴一起，通过其多学科机构和举措，开展和规划研究和培训活动，以加强其对三大转变挑战的集体贡献：全球健康方针（一个健康）、可持续地球的资源（一个地球）以及不断变化的社会、语言和文化（一个人类）。索邦大学也是4EU+联盟的成员，该联盟是欧洲大学的创新模式，致力于发展国际战略伙伴关系并促进其社区向世界其他地区的开放。
关于合成微生物群落（Syncom）生物传感器
合成微生物群落（Syncom）生物传感器是一种有前途的技术，用于检测和响应环境线索和靶分子。Syncom生物传感器使用工程的微生物来创建一个更复杂和多样化的传感系统，从而使它们能够以增强的灵敏度和准确性对刺激做出反应。在这里，我们给出了Syncom生物传感器的定义，超越了他们的建筑工作，并讨论了当前的生物传感技术。我们还强调了开发和优化Syncom生物传感器以及在农业和食品经营中的潜在应用，生物治疗发展，家庭感应，城市和环境监测以及One Health Foundation的挑战和未来。我们认为，Syncom生物传感器可以实时和遥控的方式使用，以感知不断动态的环境的混乱。
b'MSC植物学是一项为期两年的课程，有助于对生物学主题有更好，更深入的了解。该课程具有实用和理论结构。在实验室中为学生提供课程，以更好地了解植物的生活。该课程旨在涵盖诸如微生物学，植物学，植物解剖学，分子生物学等诸如MSC Botony课程等选修和核心主题。
b'MSC植物学是一项为期两年的课程，有助于对生物学主题有更好，更深入的了解。该课程具有实用性和理论结构。在实验室中给学生提供课程，以更好地了解植物生活。该课程旨在涵盖诸如微生物学，植物学，植物解剖学，分子生物学等的选修和核心主题。追求硕士学位植物学的过程还可以帮助学生在诸如兽医，农艺学，细胞学，林业等学科方面进行专业化。
胃癌手术后肠道菌群的变化
胃癌 (GC) 是一个全球性健康问题，是全球第五大最常见的癌症和第三大肿瘤死亡原因 ( 1 )。中国的癌症状况正在发生转变，癌症发病率更高 ( 2 )。胃切除术作为胃癌的治愈性切除术，旨在获得完整的组织病理学清除，包括原发部位的根治性切除以及必要时切除受影响的淋巴结和邻近器官 ( 3 )。人体胃肠道 (GI) 是一个复杂的微生态系统，栖息着多达 10 14 种微生物，包括细菌、真菌、病毒和原生动物 ( 4 )。人体肠道微生态中有400余种细菌，其中优势菌群主要有拟杆菌和芽孢杆菌，占细菌总数的70%以上，其他细菌主要有变形菌、梭菌、放线菌、疣微菌、蓝藻等（5）。不同肠道菌群相互制约，共同维持微生态系统的动态平衡，参与机体的能量转换、代谢、消化、免疫调节及肠黏膜屏障防御功能等（6～8）。随着16S rRNA基因序列分析技术的发展，胃切除患者围手术期肠道菌群的变化逐渐被揭示。鲁氏胃绕道手术 (RYGB) 后发现肠道微生物多样性增加、微生物组成改变和代谢改善( 9 )。此外，将 RYGB 手术小鼠的粪便定植于无菌小鼠体内可导致体重减轻和肥胖减少，这证明 RYGB 相关的肠道微生物群可以改善宿主的代谢( 10 )。这些临床研究表明胃切除术后微生物群发生了重大变化，而大多数研究对象是肥胖患者或接受 RYGB 手术的小鼠。与以往研究不同的是，胃癌患者围手术期面临多种临床暴露因素，包括抗生素、饮食、焦虑和医院内病原体，这些都会影响肠道菌群( 11 )。然而，人们对胃癌患者围手术期肠道微生物群的变化了解甚少。此外，由于消化道重建和肿瘤负荷减轻，胃癌患者的肠道微生物群可能受到进一步影响( 12 )。 Liang 等首次报道了根治性远端胃切除术对胃癌患者粪便菌群的影响，发现根治性远端胃切除术对肠道菌群组成有显著影响，主要表现为阿氏菌、大肠杆菌/志贺氏菌、乳酸杆菌和微杆菌相对丰度的变化（11），但该研究样本量仅为 6 例。本研究旨在描述胃癌患者住院期间手术前后粪便微生物群的变化。