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扩展数据图1. 使用RFdiffusion设计β链配对支架。为了充分利用RFdiffusion的多样化生成潜力，同时
扩展数据图 1. 使用 RFdiffusion 设计 β 链配对支架。为了充分利用 RFdiffusion 的多样化生成潜力，同时鼓励在设计输出中使用 β 链界面，我们实现了一种界面调节算法，该算法可根据简单的用户输入生成 SS/ADJ 调节张量。该模型以张量的形式理解折叠调节，这些张量标记每个残基（a，顶部和左侧）的二级结构（蓝色）以及这些二级结构块的邻接关系（a，黄色中心）。用户指定的参数指定了以下信息：结合剂界面二级结构块（在本例中为 β 链）、该块的长度（b，结合剂张量 L 中的青色块）以及结合剂块相邻的靶位残基（b，靶位张量 T 中的青色块）。根据这些预定义参数，该算法随机采样结合剂界面二级结构块在残基索引空间中的位置，同时保持与指定靶位残基的确定邻接关系（绿色）。该用户定义的调节张量将扩散输出导向β链配对的结合物-靶标界面 (c)。此前，RFdiffusion 界面设计计算可以针对指定为靶标“热点”的特定残基，以指定要结合的靶标残基。而这种新的链间 SS/ADJ 调节功能，使用户能够在结合物支架生成过程中指定“β链热点”或“ɑ-螺旋热点”。基于扩展的结合物-靶标 SS/ADJ 张量调节的结合物支架输出，支持用户指定 β 链界面类型的设计。
发现具有四唑支架的新型茶碱衍生物用于治疗阿尔茨海默氏病
已经提出了几种假设是为阿尔茨海默氏病的根本原因提出的，重点是不同的病理机制。一些关键假设，包括淀粉样蛋白β，胆碱能和金属离子假设。3,4尽管进行了正在进行的研究，但FDA和EMA批准了数量有限的阿尔茨海默氏症药物。其中包括：Galant-氨，Rivastigmine，Donezepil，Lecanemab，Donanemab，Adu-Canumab。5,6大多数可用的治疗方法都集中在胆碱能假设上，该假设突出了乙酰胆碱（ACH）在认知功能中的作用。因此，靶向ACHE是一种高度有希望的AD治疗策略。ACHE的结合位点分为三个不同的区域，包括催化活性位点（CAS），结合峡谷和外围阴离子位点（PAS）。有效的ACHE抑制剂必须与CAS或PAS区域结合，或具有桥接这两个位点的合适长度和结构的接头，允许与两者相互作用，尤其是两个芳族残基。7此外，良好的AD与A B肽的自组装相关，这是淀粉样蛋白级联假设的基石。在淀粉样蛋白的淀粉样蛋白前体蛋白（APP）（一种跨膜蛋白）中，通过B-和G-分泌酶进行蛋白水解裂解，从而导致B肽的产生。8因此，针对B -
富含血小板的血浆与无菌3D多乳酸支架相结合，用于术后对四匹马的角膜瘤的完整蹄壁切除。
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Semaphorin3a/Plexina3与CGMP涂鸦支架的关联是顶端树突开发
从双极锥体神经元的主要过程中开发了根尖树突的发展，可以由作用于局部内在决定因素的空间组织的外部线索指导。调节顶端树突极化的细胞外提示仍然难以捉摸。我们表明，领先的过程和顶端树突的发育是由III类信号素指导的，并由局部CGMP合成综合介导。与CGMP合成的酶可溶性鸟苷酸环化酶（SGC）相关的脚手架蛋白质涂鸦也将其与Semaphorin3a（Sema3a）共受体plexor Plexin的Plexine 3相关联。缺失或敲除plexina3和sema3a或plexina3-Scribble关联的破坏可防止SEMA3A介导的CGMP增加，并导致根尖树突发展中的缺陷。这些操作还损害了双极极性和领先的过程。局部CGMP高程或SGC表达挽救了Plexina3敲低或Plexina3-Scribble复合物破坏的影响。在神经元极化期间，前导过程和顶端树突的发育是由将信号素提示与CGMP增加联系起来的脚手架的。
重新探索水杨酰基支架，以抑制结核分枝杆菌中的霉菌酸合成
全球结核病报告2023。（世界卫生组织，日内瓦，2023年）； Butler，M。S。等。对具有新作用模式的抗菌候选者的审查。ACS感染。dis。10，3440–3474（2024）; Gavalda，S。等。PKS13/FADD32串扰结核分枝杆菌中霉菌酸的生物合成。生物学杂志284，19255–19264（2009）; Galandrin，S。等。用于鉴定分枝杆菌FADD32活性抑制剂的测定开发。SLAS Discovery 18，576–587（2013）; Le，N.-H。等。针对分枝杆菌脂肪酰基 - A酰基 - AM-AMP连接酶FAAL32的药物筛查方法更新了Salicylanilide药物团在抗结结核病中的兴趣。生物有机和药物化学71，116938（2022）。
从植物细胞支架中种植表型控制的语音材料
hal是一个多学科的开放访问档案，用于存款和传播科学研究文件，无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
通过选择支架序列来优化 DNA 折纸组装，以最大限度地减少脱靶相互作用
摘要。DNA 折纸是 DNA 纳米技术的支柱，人们已经投入了大量精力来了解自组装反应的各种因素如何影响目标折纸结构的最终产量。本研究分析了碱基序列如何通过在自组装过程中产生脱靶副反应来影响折纸产量。脱靶结合是一种未被充分探索的现象，可能会在折纸折叠途径中引入不必要的组装障碍和动力学陷阱。我们开发了一种多目标计算方法，该方法采用给定的折纸设计，并对不同的支架序列（及其互补的钉书钉）进行评分，以确定四种不同类型的脱靶结合事件的发生率。使用我们在 DNA 折纸上的方法，我们可以选择生物序列（如 lambda DNA 噬菌体）的“坏”区域，当用作折纸支架序列时，每种形状的脱靶副反应数量过多。我们利用高分辨率原子力显微镜 (AFM) 显示，尽管支架序列具有完全互补的订书钉组，但这些支架序列在体外大多无法折叠成目标三角形或矩形结构。相反，使用我们的方法，我们还可以选择生物序列的“良好”区域。这些序列缺乏脱靶反应，当用作折纸支架时，可以更成功地折叠成其目标结构，如 AFM 所表征。这些结果已在两个不同实验室的“盲”折叠实验中得到验证，其中实验者不知道哪些支架是好的或坏的折叠者。为了进一步研究组装行为，光镊实验揭示了不同的机械响应曲线，与支架特定的脱靶相互作用相关。虽然 GC 含量较高的变体显示出较高的平均展开力，但脱靶结合较低的变体表现出更均匀的力-延伸曲线。我们的分析证实，高脱靶结合会导致结构异质性增加，如 OT 实验展开轨迹的聚类行为所示。总体而言，我们的工作表明，如果脱靶反应足够普遍，碱基序列中隐含的脱靶反应会破坏折纸自组装过程，并且我们提供了一种软件工具来选择支架序列，以最大限度地减少任何 DNA 折纸设计的脱靶反应。
内源性大麻素降解酶抑制剂作为潜在的抗精神病药：药物化学的观点
Yong Jian Wang，Claire Valotteau，Adrien Aimard，Lorenzo Villanueva，Dorota Kostrz等人。CombimberiningDNA支架和声学力光谱，以表征单个蛋白质键。 Bio-物理期刊，2023，122（12），pp.2518-2530。 10.1016/j.bpj.2023.05.004。 hal-04165173Yong Jian Wang，Claire Valotteau，Adrien Aimard，Lorenzo Villanueva，Dorota Kostrz等人。CombimberiningDNA支架和声学力光谱，以表征单个蛋白质键。Bio-物理期刊，2023，122（12），pp.2518-2530。10.1016/j.bpj.2023.05.004。hal-04165173
引用Wang Z，Sun Y和Li C（2024）3D打印技术的进步，用于从可生物降解材料中制备骨组织工程脚手架
患者面临严重创伤，传染病或肿瘤引起的显着骨缺损时，通常需要手术骨移植才能完全愈合，这使得骨组织成为当今第二常见的移植组织（Migliorini等人，2021年）。传统的自体或同种异体骨移植经常遇到供体短缺，免疫排斥和对次级手术的需求（Dalipi等，2022）。骨组织工程（BTE）有可能通过促进快速骨再生来减轻这些问题。这是通过将官能细胞播种到生物相容性支架上的，在植入以促进骨骼再生之前，在体外培养到成熟。植入的支架为细胞提供了一个栖息地，可帮助营养供应，气体交换和废物清除。随着材料的降解，植入的骨细胞增殖，最终导致骨缺陷的修复（Ellermann等，2023； Jia等，2021）。BTE的关键在于鉴定高度生物相容性，迅速降解，无毒的脚手架材料，并且具有出色的孔隙率和表面生物活性。传统的支架材料，例如生物陶瓷，玻璃，金属和聚合物通常缺乏生物活性，导致诸如不良整合，磨损和腐蚀等问题，从而阻碍了功能性骨再生（Deng等，2023; Abbas et al。，2021;Pazarçeviren等，20221，20221）。虽然复合材料已经解决了单一材料的某些局限性，例如制造复杂性，脆性和对衰老的易感性，继续阻碍BTE的发展（Cannillo等，2021）。3D打印技术通过基于数字模型文件（Yang，2022）将粘合剂（例如金属或塑料）分层（例如粉末状金属或塑料）来构建对象。这项技术简化并加速了骨组织工程脚手架的制造，显着减少了生产时间，同时可以使用复杂的结构来创建个性化的脚手架，这极大地有益于患者损伤的修复（Anandhapadman等人，2022222222年）。尤其是3D生物打印的快速发展将其定位为生产组织工程脚手架材料的最有前途的技术之一，具有应对材料制备和推动材料科学和医学快速发展的主要挑战（Liu等人，2022年）。近年来，低温打印技术的应用进一步提高了脚手架的性能。Gao等。 （2022）证明，通过低温打印产生的层次多孔支架在生物矿化和骨再生方面具有显着优势。 尽管现有的评论文章广泛讨论了3D生物打印在骨组织工程中的应用，但大多数主要关注材料选择和过程优化，对挑战和潜在临床应用的潜在障碍有限分析。 这些评论通常会忽略3D生物打印与创新的生物材料和个性化结构设计相结合时如何应对骨组织工程中当前的挑战。 此外，本文探讨了如何创新Gao等。（2022）证明，通过低温打印产生的层次多孔支架在生物矿化和骨再生方面具有显着优势。尽管现有的评论文章广泛讨论了3D生物打印在骨组织工程中的应用，但大多数主要关注材料选择和过程优化，对挑战和潜在临床应用的潜在障碍有限分析。这些评论通常会忽略3D生物打印与创新的生物材料和个性化结构设计相结合时如何应对骨组织工程中当前的挑战。此外，本文探讨了如何创新回应，本文提供了3D生物打印的临床应用的全面摘要，分析了诸如印刷材料的可控降解性，与骨组织的机械兼容性以及植入后生物相容性的问题。